以细胞色素bc1复合物为靶标的新型杀菌剂的合理设计

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21102052
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0706.药物化学生物学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

细胞色素bc1复合物是细胞呼吸和光合作用的必要组成部分,也是开发农用杀菌剂的重要靶标。近年来,由于作用于细胞色素bc1复合物的杀菌剂被大面积推广使用,植物病原菌对该类杀菌剂的抗药性发展极为迅速。因此,设计合成新型高效的细胞色素bc1复合物抑制剂是一项具有重要意义的研究课题。本项目拟系统研究不同结构类型的抑制剂与细胞色素bc1复合物之间的相互作用,并结合文献报道的复合物晶体结构,比较不同抑制剂作用机制的差异。在此基础上,以商品化抑制剂噁唑菌酮为母体结构,采用氢键相互作用导向及π-π堆积作用导向的分子设计策略开展结构优化与分子设计研究,力争通过"合理设计-有机合成-酶抑制动力学-杀菌活性测试"的研究循环,获得一类活性达到纳摩尔级别的、能够与铁硫蛋白形成氢键相互作用的新型细胞色素bc1 复合物抑制剂,为进一步研究细胞色素bc1 复合物的生物学功能提供探针分子,同时为杀菌剂的开发提供新的先导化合物

结项摘要

本项目基本上按计划进行。为了更好地资源配置和提高研究效率,我们在本实验室建立了bc1复合物抑制剂离体筛选和动力学表征等方法之后,就直接与南方农药创制中心(浙江省化工研究院)合作,开展化合物的杀菌活性测试。这样就避免重复性建设和资源的浪费。期间,基于已经报道的蛋白质复合物的晶体结构,本项目对三种代表性的bc1复合物Qo位点抑制剂(嘧菌酯,标桩菌素和噁唑菌酮),进行了详细的结合模式的研究,并提出了钟摆模型。随后,分别对标桩菌素和噁唑菌酮开展具体的改造。 对于噁唑菌酮的改造:一方面,延长苯肼一端并引入合适的氢键受体,使新化合物能与铁硫蛋白末端形成氢键相互作用;另一方面,对其二苯醚一端进行改造,以优化其与Qo位点尤其是空腔中残基F274之间的堆积作用。对于标桩菌素的改造:保留苯并吡喃酮部分,把呈现不稳定性的长不饱和的脂肪链用二苯醚替代。通过“合理设计-有机合成-生物活性筛选”的研究循环,我们得到了一批活性比噁唑菌酮要高的新骨架化合物,并且首次发现噁唑菌酮及其类似物不仅抑制了bc1复合物的活性,而且对复合物II与III之间的相互作用起着抑制作用。本项目在主流学术期刊 ChemBioChem,Bioorg. Med. Chem.,Chem. Biol.Drug Des., Tetrahedron, RSC Advances, Chin. J. Chem.等上发表论文8篇。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
对羟基苯基丙酮酸双氧化酶抑制剂筛选方法研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    农药学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨文超;林红艳;杨盛刚;刘万年;杨光富
  • 通讯作者:
    杨光富
Coumarin-based novel fluorescent zinc ion probe in aqueous solution
水溶液中基于香豆素的新型荧光锌离子探针
  • DOI:
    10.1016/j.tet.2013.03.032
  • 发表时间:
    2013-06-10
  • 期刊:
    TETRAHEDRON
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Li, Jun;Zhang, Chun-Fang;Yang, Guang-Fu
  • 通讯作者:
    Yang, Guang-Fu
Non-peptide-based fluorogenic small-molecule probe for elastase.
用于弹性蛋白酶的非肽荧光小分子探针。
  • DOI:
    10.1021/ac402097g
  • 发表时间:
    2013-11
  • 期刊:
    Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Sun, Qi;Li, Jun;Liu, Wan-Nian;Dong, Qing-Jian;Yang, Wen-Chao;Yang, Guang-Fu
  • 通讯作者:
    Yang, Guang-Fu
Design, synthesis, and bioevaluation of benzamides: Novel acetylcholinesterase inhibitors with multi-functions on butylcholinesterase, Ab aggregation, and b-secretase
苯甲酰胺的设计、合成和生物评价:对丁基胆碱酯酶、Ab 聚集和 b 分泌酶具有多功能作用的新型乙酰胆碱酯酶抑制剂
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Bioorganic & Medicinal Chemistry
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨文超
  • 通讯作者:
    杨文超
Comparative Kinetics of Qi Site Inhibitors of Cytochrome bc1 Complex: Picomolar Antimycin and Micromolar Cyazofamid.
细胞色素 bc1 复合物 Qi 位点抑制剂的比较动力学:皮摩尔抗霉素和微摩尔氰霜唑。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Chemical Biology & Drug Design
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Li Hui;Zhu Xiao-Lei;Yang Wen-Chao;Yang Guang-Fu
  • 通讯作者:
    Yang Guang-Fu

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其他文献

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  • DOI:
    --
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李正秋

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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