基于多组学分析对新疆地区维吾尔族、汉族溃疡性结肠炎肠道菌群及代谢差异的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81760101
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    36.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0304.消化道内环境紊乱、黏膜屏障障碍及相关疾病
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

This study is based on the past, we have been found in Xinjiang Uygur and Han ulcerative colitis in patients with clinical phenotype differences:Uygur patients with a single age peak of onset and the age of onset is small, the disease is serious, the disease is widespread, the complication is high, the effect is poor, the recurrence rate is high, And HLA-DRB1, FUT2 and IL-23R gene polymorphisms were different in the incidence of ulcerative colitis between the two ethnic groups.First,This distinguish used macrogeome and metabolomics to study the differences between the intestinal flora and fecal metabolites between Xinjiang Uygur ethnic group and Han groups, and further analyzed the correspondence between them. To understand the possible metabolic pathways associated with this difference. After wards,the gut microbiota of UC model rats and normal rats should be manipulated via fecal microbiota transplantation with representative samples, and then to detect the expression of cytokines in colonic mucosa. In order to observe the effect of different bacteria on intestinal mucosal inflammation in rats.The medium conditions is Controlled by significant differences in metabolites,we should cultivate the mucosal epithelial cells of UC model rats and normal rat intestinal , and the expression of cytokines in colonic mucosa will also be detected to observe the effect of different metabolites on the inflammatory response of intestinal epithelial cells in rats.In order to verify the effects of different intestinal flora and fecal metabolites on the occurrence of UC in patients with UC, and to elucidate the significance of intestinal flora in the occurrence and development of UC in Uygur and Han nationalities in Xinjiang.
我们前期研究发现新疆地区维吾尔、汉UC患者临床表型存在差异:维吾尔族患者为单一发病年龄高峰、发病年龄小、病情重、病变广泛、并发症发生率高、疗效差、复发率高,且HLA-DRB1、FUT2和IL-23R基因多态性与UC发病存在民族差异性。本研究首先利用宏基因组和代谢组学技术,寻找肠道菌群和粪便代谢物在维、汉UC患者中的差异,分析差异相关的代谢通路,阐明肠道菌群与维、汉UC发生及临床表型的关系。随后用具代表性的差异样本制备粪菌液,对UC大鼠及正常大鼠进行粪菌移植,取结肠粘膜组织,检测UC相关细胞因子的表达,观察差异菌对大鼠肠粘膜炎症反应的影响;并以差异代谢产物控制培养条件,培养UC大鼠及正常大鼠肠粘膜上皮细胞,检测UC相关细胞因子表达,观察差异代谢物对大鼠肠粘膜上皮细胞炎症反应的影响,进而验证维、汉UC患者不同肠道菌群和粪便代谢物对UC发生的影响,阐明肠道菌群在新疆维、汉UC发生、发展中的意义。

结项摘要

本课题组前期研究发现新疆地区维吾尔、汉UC患者临床表型存在差异:维吾尔族患者为单一发病年龄高峰、发病年龄小、病情重、病变广泛、并发症发生率高、疗效差、复发率高,且基因多态性与UC发病存在民族差异性。因此本研究首先初步通过对新疆地区维吾尔族及汉族UC患者与其1:1匹配健康亲属对照组粪便样本进行16S rRNA基因V3-V4区扩增高通量测序,筛选出两民族UC患者差异表达微生物及具有疾病鉴别能力的菌属;通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)代谢组学平台筛选出了两民族粪便代谢物中的潜在生物标志物。综合微生物多样性和代谢组实验结果,通过两组学关联整合分析,验证两民族UC患者关键差异表达的微生物与代谢物之间的相关性;最后通过UC大鼠模型分别进行两民族患者粪菌液的粪菌移植,进一步验证肠道微生物及代谢差异与UC肠黏膜细胞炎症的相关性。结果显示维吾尔族与汉族UC患者肠道微生物在结构、多样性上均存在差异。克里斯滕森氏菌属等6种微生物种属对维吾尔族UC患者与健康对照组有一定鉴别诊断能力。维吾尔族UC患者与汉族UC患者间分别相较于其匹配健康亲属肠道粪便代谢物的变化存在差异。汉族UC患者与正常对照组间筛选出2种潜在生物标志物,维吾尔族UC组与正常对照组间筛选出21种潜在生物标志物。Omega-3花生四烯酸作为潜在生物标志物在维吾尔族UC患者中显著降低。两组学关联整合分析发现,维吾尔族UC患者中嗜血杆菌属与N-乙酰半乳糖胺的高度负相关,嗜血杆菌属很可能通过影响N-乙酰半乳糖胺表达量影响肠粘膜屏障,而汉族UC患者中未观察到此关联特征。维吾尔族及汉族UC患者肠道微生物及代谢水平的差异可能通过影响IL-6的表达水平造成疾病表现的差异。肠道微生物结构的差异与代谢水平间的相互作用及Omega-3与IL-6间的作用可能与新疆地区维吾尔族UC患者特殊临床表现及遗传背景相关。维吾尔族及汉族UC患者粪菌液灌肠在正常大鼠中没有引起炎症因子表达的差异,肠道微生物及其所影响的代谢水平可能是UC疾病的促进因素而不是始动因素。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
溃疡性结肠炎肠外表现的危险因素分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    胃肠病学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    木克热木·依明尼亚孜;高峰
  • 通讯作者:
    高峰
Intestinal flora differences between patients with ulcerative colitis of different ethnic groups in China
我国不同民族溃疡性结肠炎患者肠道菌群差异
  • DOI:
    10.1097/md.0000000000026932
  • 发表时间:
    2021-08-13
  • 期刊:
    Medicine (Baltimore)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu H;Liu W;Huang X;Feng Y;Lu J;Gao F
  • 通讯作者:
    Gao F

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    --
  • 发表时间:
    --
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    王连国

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宿主-肠道微生物交互调控肠道代谢影响肠黏膜屏障功能在新疆地区乳糜泻中的作用机制研究
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    82260116
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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