与鳗爱德华氏菌ET080813细胞内生活方式密切相关的新型III型分泌系统效应蛋白的鉴定与表征

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31873048
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1908.水产生物病原学与病害控制
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Edwardsiella species, namely E. piscicida and E. ictaluri, are common and important pathogens of marine fish. They all process a type III and a type VI secretion systems (T3SS and T6SS) and these are important virulence mechanisms of these organisms. E. anguillarum is a recent addition as the third Edwardsiella species that is important in fish disease; it possesses two T3SSs and three T6SSs and is very virulent in fish. However, not much is known about the T3SS effectors and functions of E. anguillarum. In this proposal, I plan to use our well-established platform to study the T3SS effectors of E. anguillarum ET080813. Our first objective is to characterize ET080813 further by looking at its abilities to adhere, invade and replicate intracellularly, as well as study the extracellular protein profile, LD50 values, and formation of the Edwardsiella-containing vacuoles (ECVs). Our second objective will be to identify novel T3SS effectors of ET080813 using bioinformatics and transcriptome approaches; genuine effectors will be confirmed by translocation and secretion assays. We will apply our established platform for the study of novel T3SS Edwardsiella effectors and relate their functions to the intracellular lifestyle of the bacterium. The knowledge generated will provide new targets for vaccines and effective therapeutics that can be applied to prevent Edwardsiella and other fish diseases to benefit the aquaculture industry in China.
爱德华氏菌属的杀鱼爱德华氏菌和鲶爱德华氏菌,是鱼类普遍且主要的病原菌。它们均具有1套III型和1套VI型分泌系统,是该菌种中重要的毒力机制。鳗爱德华氏菌是第三种引起鱼类疾病的关键病原菌,它具有2套T3SS和3套T6SS系统,对鱼类具有很强的毒性。但是,人们对于鳗爱德华氏菌的T3SS分泌系统及其功能知之甚少。本课题拟利用我们已经建成的平台研究鳗爱德华氏菌ET080813中的T3SS效应蛋白。首先,我们将观察该菌进行细胞内黏附、侵入及自我复制的能力,测定其半数致死量LD50值,以及观察携带爱德华氏菌的胞内囊泡的形成规律。在此基础上,利用生物信息学和转录组学的方法,鉴别和确定该菌的新型T3SS效应蛋白。此项研究将为预防爱德华氏菌和其他鱼类疾病的疫苗及其他治疗和诊断方法提供新的靶标,从而有利于中国水产业的发展。

结项摘要

爱德华氏菌是国内外鱼类普遍且主要的致病菌,比如杀鱼爱德华氏菌,鲶爱德华氏菌以及鳗爱德华氏菌。其中杀鱼爱德华和鲶爱德华氏菌均含有一套III型和一套VI分泌系统,而鳗爱德华氏菌含有两套III型和三套VI分泌系统。这两套分泌系统是爱德华氏菌最重要的毒力机制。由于鳗爱德华氏菌是一个新发现的菌种,其T3SS和T6SS的研究报道并不多。因此,本课题拟利用已经建成的平台,通过生物信息学、转录组学以及蛋白组学的方法鉴定鳗爱德华氏菌新型的III型分泌效应物。对新型分泌效应物的认识将增加人们对爱德华氏菌的效应物及其对病原-宿主互作所起作用的了解。此外,该研究为未来开发爱德华氏菌的疫苗及鱼类疾病的疗法打下基础。经本课题经费资助,目前本课题发表了两篇高影响力的论文,一篇论文正在准备投稿。项目具体研究分为以下二部分:1. 表征鳗爱德华氏菌标准菌株ET080813的毒力及其对宿主(细胞)的感染规律 。2. 通过生物信息学、转录组学以及蛋白组学的方法鉴定新型III型分泌效应物。还鉴定了至少13个效应物,未来也将对它们进行功能分析。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Edwardsiella piscicida: A versatile emerging pathogen of fish
杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida),一种多用途的新兴鱼类病原体。
  • DOI:
    10.1080/21505594.2019.1621648
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    VIRULENCE
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Leung, Ka Yin;Wang, Qiyao;Siame, Bupe A.
  • 通讯作者:
    Siame, Bupe A.
Edwardsiella induces microtubule-severing in host epithelial cells
爱德华氏菌在宿主上皮细胞中诱导微管断裂。
  • DOI:
    10.1016/j.micres.2019.126325
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    MICROBIOLOGICAL RESEARCH
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Aggarwal, Priyanka;Wei, Lifan;Leung, Ka Yin
  • 通讯作者:
    Leung, Ka Yin

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其他文献

Identification and functional characterization of the novel Edwardsiella tarda effector EseJ
新型迟缓爱德华氏菌效应子 EseJ 的鉴定和功能表征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Infection and Immunity
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Yi Jia;Yu Xiu Jun;Leung Ka Yin;Nie Pin
  • 通讯作者:
    Nie Pin

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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