以核糖核酸酶P的RNA组分为作用靶标的抗结核反义寡核苷酸的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81302679
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3404.生物技术药物
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

In recent years, the emergence of multi-drug resistant tuberculosis (TB) has been continuingly increased. The discovery of antitubercular drugs with fully new antibacterial mechanisms is quite demanding. RNase P catalyses the 5'-maturation of tRNA, and is an essential enzyme in almost all organisms. There are large differences in structure and function between bacterial and human RNase P RNA subunits, and therefore the bacterial RNase P RNA is believed to be an ideal antibacterial drug target. This project plans to screen antisense oligonucleotides that target M. tuberculosis RNase P RNA and can effectively inhibit or cease the growth of Mycobacterium tuberculosis by utilizing rational design, affinity assays of macromolecules, kinetic assays, BCG antibacterial activity screening, and new antisense technologies. The project is to identify the targeting sites of antisense oligonucleotides on M. tuberculosis RNase P RNA, and characterize the mechanisms of the antisense oligonucleotides with antibacterial activity. The goal of the project is to contribute to the discovery of new antisense oligonucleotide drug candidates against multi-drug resistant TB.
近年来耐多药结核病的发病率呈上升趋势,人类迫切需要具有全新作用机制的抗结核药物。核糖核酸酶P是存在于几乎所有的生物体中的催化tRNA 5'端成熟的必需酶。细菌与人的核糖核酸酶P的 RNA组分在结构和功能上有巨大差异,是理想的抗菌药物作用靶标。本项目拟以结核分枝杆菌的核糖核酸酶P RNA为作用靶标,通过合理设计、生物大分子间亲和力研究、酶动力学研究和卡介苗(BCG)抗菌活性筛选等手段,并结合新一代的反义技术,筛选能有效阻截靶RNA功能,从而抑制甚至竭制结核分枝杆菌生长和繁殖的反义寡核苷酸。揭示结核分枝杆菌核糖核酸酶P RNA结构中的反义寡核苷酸作用位点,探索具有抗菌活性的反义寡核苷酸的作用机制。该项目可望为开发有效治疗和对抗耐多药结核病的反义寡核苷酸药物奠定坚实基础。

结项摘要

近年来耐多药结核病的发病率呈上升趋势,人类迫切需要具有全新作用机制的抗结核药物。核糖核酸酶P是存在于几乎所有的生物体中的催化tRNA 5'端成熟的必需酶。细菌与人的核糖核酸酶P的 RNA组分在结构和功能上有巨大差异,是理想的抗菌药物作用靶标。本项目以结核分枝杆菌的核糖核酸酶P RNA为作用靶标,通过合理设计、荧光定量生物大分子间亲和力研究和表达eGFP的卡介苗(BCG)抗菌活性筛选等手段,筛选能有效阻截靶RNA功能,从而抑制甚至竭制结核分枝杆菌生长和繁殖的反义寡核苷酸,确证和揭示了结核分枝杆菌核糖核酸酶P RNA结构中的精准抗菌关键作用位点。该项目可望为开发有效治疗和对抗耐多药结核病的反义寡核苷酸药物奠定坚实基础。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ADMET evaluation in drug discovery: 15. Accurate prediction of rat oral acute toxicity using relevance vector machine and consensus modeling.
药物发现中的ADMET评估:15.利用相关向量机和共识模型准确预测大鼠口服急性毒性
  • DOI:
    10.1186/s13321-016-0117-7
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of cheminformatics
  • 影响因子:
    8.6
  • 作者:
    Lei T;Li Y;Song Y;Li D;Sun H;Hou T
  • 通讯作者:
    Hou T
Molecular principle of the cyclin-dependent kinase selectivity of 4-(thiazol-5-yl)-2-(phenylamino) pyrimidine-5-carbonitrile derivatives revealed by molecular modeling studies
分子模型研究揭示4-(噻唑-5-基)-2-(苯氨基)嘧啶-5-甲腈衍生物的细胞周期蛋白依赖性激酶选择性的分子原理
  • DOI:
    10.1039/c5cp05622e
  • 发表时间:
    2016-01-21
  • 期刊:
    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Kong, Xiaotian;Sun, Huiyong;Hou, Tingjun
  • 通讯作者:
    Hou, Tingjun
Assessing the performance of the MM/PBSA and MM/GBSA methods. 6. Capability to predict protein-protein binding free energies and re-rank binding poses generated by protein-protein docking
评估 MM/PBSA 和 MM/GBSA 方法的性能。
  • DOI:
    10.1039/c6cp03670h
  • 发表时间:
    2016-08-28
  • 期刊:
    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Chen, Fu;Liu, Hui;Hou, Tingjun
  • 通讯作者:
    Hou, Tingjun

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基于被动拮抗构象策略的新型糖皮质激素受体调节剂的设计与合成
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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