核酸高级结构生成与解开的动力学及其在动态条件下与蛋白质作用的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    20572082
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    26.0万
  • 负责人：
    谭铮
  • 依托单位：
    武汉大学
  • 学科分类：
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份：
    2008
  • 批准年份：
    2005
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2006-01-01 至2008-12-31

项目摘要

核酸是细胞内最重要的生物分子，它通过分子内的相互作用，可以形成由其序列决定的高级结构并由此而实现其特定的生物学功能，参与和调节重要的生物学过程。核酸高级结构是有效的药物作用靶点。核酸分子的折叠性质被用于设计分子马达和纳米元器件。核酸结构转换的动力学是决定核酸分子上述功能的一个重要性质。目前对于静态结构有很多成熟的研究手段，但是对于核酸结构转换的动力学尚缺乏有效的方法。本实验室近期发展了一项利用传感器测定核酸结构转换动力学参数的技术。它利用互补核酸序列作为探针，其测定环境在盐浓度、pH、探针可用性及通用性方面尚有一定的局限。生物体内存在多种核酸结合蛋白，能够在很广的环境条件下结合核酸并有程度不同的结构特异性。本申请计划筛选，或用基因工程技术改造天然的核酸结合蛋白，以蛋白质取代核酸作为测定核酸结构动力学的探针。预计它将提供一种适应环境广、序列通用、灵敏度更高的检测方法。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（9）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Human telomeric DNA forms parallel-stranded intramolecular G-quadruplex in K+ solution under molecular crowding condition. J Am Chem Soc, 2007. 129(36): p. 11185-91.
人端粒DNA在分子拥挤条件下在K溶液中形成平行链分子内G-四链体。
  • DOI：
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  • 发表时间：
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  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
G-quadruplex formation in human telomeric (TTAGGG)4 sequence with complementary strand in close vicinity under molecularly crowded condition. Nucleic Acids Res, 2007. 35(11): p. 3646-53.
人端粒 (TTAGGG)4 序列中 G-四链体的形成，在分子拥挤条件下互补链非常接近。
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Identification of low-abundance alternatively spliced mRNA variants by exon exclusive reverse transcriptase polymerase chain reaction. Anal Biochem, (2008) 383, 307-10.
通过外显子专属逆转录酶聚合酶链式反应鉴定低丰度选择性剪接 mRNA 变体。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
Kinetics of base stacking-aided DNA hybridization. Chem Commun (Camb), (2008) 6600-2.
碱基堆积辅助 DNA 杂交的动力学。
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
  • 通讯作者：
G-quadruplex preferentially forms at the very 3' end of vertebrate telomeric DNA.
G-四链体优先在脊椎动物端粒 DNA 的 3' 端形成。
  • DOI：
    10.1093/nar/gkm1137
  • 发表时间：
    2008-03
  • 期刊：
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH
  • 影响因子：
    14.9
  • 作者：
    Tang, Jun;Kan, Zhong-yuan;Yao, Yuan;Wang, Quan;Hao, Yu-hua;Tan, Zheng
  • 通讯作者：
    Tan, Zheng

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其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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