基于蛋白质液晶化定向排列芯片的RDC核磁样品制备新方法研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21705161
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0403.谱学方法与理论
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Investigations of the residue dipolar coupling (RDC) measurement for protein NMR structure determination have greatly increased. On one hand, the RDC depends on the distance between the two measured nuclei; on the other hand, RDCs from a specific bond can define the relative orientation of two secondary structural elements or two domains in the protein under study. Despite the extensive developments for RDC measurement using NMR spectroscopy and various RDC media designed for protein molecule arrangement, the preparation of the NMR sample for RDC measurement is complex, time-consuming and easy for failure. To solve these problems, a new method is proposed here to develop a liquid crystalline media microfluidic system for the preparation of RDC measurement samples. Using the "Y-ear" type asymmetric microstructure mixer to inject the protein solutions homogenously with a fixed orientation in the RDC liquid crystal phase, this new efficient and automated method is expected to be more rapid,homogeneous, stable and controllable. Furthermore, this new technique will be used to obtain the RDCs from INSM1 ZF1-3, a truncated version of human Insulinoma-associated protein INSM1, which contains three zinc fingers ZF1, ZF2 and ZF3. This pioneering method for sample preparation for RDC measurements will promote NMR structure analysis for macromolecules in solution.
测定残余偶极耦合(RDC)辅助溶液中蛋白质结构解析的研究日益增多。一方面,RDC的大小取决于测定的两个原子核间的距离;另一方面,RDCs可以确定溶液中蛋白质的不同二级结构单元或不同结构域之间的相对取向。尽管测定RDCs的核磁共振(NMR)方法和用于获取不同残余程度的介质的研究已很广泛,然而RDC样品制备时存在着操作复杂、耗时和成功率低等问题。针对这些问题,本项目拟建立一种适用于RDC核磁样品制备的蛋白质液晶化定向排列芯片,利用“Y-ear”型非对称微结构混合器使溶液中的蛋白质在RDC液晶相介质中实现快速、均一、稳定和可控的定向排列,建立高效和自动化的NMR/RDC样品制备新方法。该新方法将应用到人体内胰岛素瘤相关蛋白INSM1截短体ZF1-3(包含3个锌指结构域)的RDCs测量。本课题对NMR/RDC样品制备方法的开拓性发展,将进一步推动溶液中生物大分子的NMR结构研究。

结项摘要

测定残余偶极耦合(RDC)辅助溶液中蛋白质结构解析的研究十分重要,尽管测定RDCs的核磁共振(NMR)方法和用于获取不同残余程度的介质的研究已很广泛,然而RDC样品制备时存在着操作复杂、耗时和成功率低等问题。针对这些问题,本项目建立了一种适用于RDC核磁样品制备的蛋白质液晶化定向排列芯片。利用优化后的鱼钩型非对称微结构混合器使溶液中的蛋白质在RDC液晶相介质中实现快速、均一、稳定和可控的定向排列,建立高效、快速、可控的自动化NMR/RDC样品制备新方法。主要研究内容包括:(1)构建了微流控混合器,优化了自动温控系统和进样控制系统;(2)制备了多种RDC介质和蛋白溶液的混合液晶相,并通过核磁一维谱和二维谱对混合效果进行表征。我们按照项目计划开展相关研究工作,顺利研制出了基于液晶微流体混合器的RDC核磁样品制备的蛋白质液晶化定向排列芯片,制备了多种RDC介质和蛋白溶液的混合液晶相,并应用于人体内胰岛素瘤相关蛋白INSM1截短体ZF1-3(包含3个锌指结构域)等蛋白质的结构研究中。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Hu, Rui;Liu, Chao;Yang, Yunhuang
  • 通讯作者:
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Safety analysis of edible oil products via Raman spectroscopy
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  • DOI:
    10.1016/j.talanta.2018.08.074
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    TALANTA
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Hu, Rui;He, Ting;Liu, Maili
  • 通讯作者:
    Liu, Maili

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  • 通讯作者:
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  • 批准号:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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