基于肾小球转录组学和蛋白质组学研究CORO1C调节糖尿病肾病的分子机制

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基本信息

  • 批准号：
    81800647
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    21.0万
  • 负责人：
    赵婷婷
  • 依托单位：
    南京大学
  • 学科分类：
    H0504.继发性肾脏疾病
  • 结题年份：
    2021
  • 批准年份：
    2018
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The injury of podocyte cytoskeleton plays an important role in the pathogenesis of diabetic nephropathy(DN), but the mechanism is not clear to date. We screened the new regulator molecule of CORO1C by integrating the transcriptomic and proteomic data and the expression level of CORO1C was aggravated with the progression of DN. Further immunohistochemical staining showed that the CORO1C in glomeruli were distributed in podocyte. In vitro, the expression level of CORO1C was significantly up-regulated stimulated by high glucose. All of the above suggested that high glucose stimulation may mediate the damage of podocyte through CORO1C. In this project, we will further investigate the molecular mechanism of CORO1C induced podocyte cytoskeleton damage in vivo and in vitro experiments. And the correlations between the level of CORO1C expression and the progression will be verified by a large number clinical specimen of DN patients. This project provided new targets for the intervention of podocyte cytoskeleton injury in DN. In addition, it also provided a scientific basis for the treatment and prognosis evaluation of diabetic nephropathy in the future.
足细胞骨架损伤是糖尿病肾病发生发展的关键环节，但具体机制迄今未明。我们前期通过整合不同病程的糖尿病肾病患者肾小球转录组和蛋白质组表达谱数据发现新的骨架调节分子CORO1C，其表达水平随病程进展呈加重趋势。免疫组化染色显示CORO1C在肾小球内呈典型的足细胞分布，且体外高糖培养足细胞导致CORO1C的表达水平显著上调，提示高糖刺激可能通过CORO1C介导足细胞骨架损伤。本课题拟在前期研究的基础上，通过体内外实验进一步明确高糖刺激下CORO1C诱导足细胞骨架损伤的分子机制，并扩大临床组织样本量验证CORO1C表达变化与糖尿病肾病患者病程进展的相关性。本课题的完成旨在揭示新的糖尿病肾病足细胞骨架调控和损伤的分子机制，为今后糖尿病肾病的靶向治疗及预后评估提供科学依据。

结项摘要

糖尿病肾病(DN)是糖尿病最常见的微血管并发症，是导致终末肾功能不全的主要病因，但目前DN发病机制尚不清楚。我们首次通过整合50例经活检证实的DN患者和25例对照者肾小球的转录组学和蛋白质组学数据，发现两组学的一致性较低，中位相关系数仅为0.068。其中强相关的差异基因主要参与能量代谢、细胞外基质沉积、整合素与细胞表面的相互作用、胶原蛋白的形成、下游信号转导、免疫系统和炎症等功能调节，弱相关的差异基因主要参与血小板活化和脱颗粒、蛋白质翻译调节、mRNA加工和代谢等调节，以上分析结果初步说明从mRNA到蛋白过程中存在复杂的调控机制，其中转录后调控在DN肾小球病变中发挥重要的作用。结合目前构建的转录后调控数据库，我们发现选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation, APA)是DN主要的调控机制，在DN肾小球病理进程中发挥重要作用。APA主要通过改变3′UTR序列长度影响反式因子的调控作用,从而调节mRNA定位、稳定性和蛋白翻译。进一步借助算法从RNA-seq推算DN和对照组3UTR长度的变化，发现和对照组相比，DN肾小球3′UTR序列长度普遍延长，同时qPCR实验证实了3′UTR长度在DN和对照间的变化。最后，在人足细胞分别过表达不同3′UTR长度的基因亚型，WB结果显示过表达长3′UTR亚型的蛋白水平显著高于过表达短3′UTR亚型。本课题是转录组和蛋白组整合在DN中的首次应用，其完成能揭示糖尿病肾病新的转录后调控机制，为全面理解糖尿病肾病的发病机制及发现新的糖尿病肾病干预靶点提供理论依据。

项目成果

期刊论文数量（2）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Pterostilbene enhances sorafenib's anticancer effects on gastric adenocarcinoma.
紫檀芪增强索拉非尼对胃腺癌的抗癌作用
  • DOI：
    10.1111/jcmm.15795
  • 发表时间：
    2020-11
  • 期刊：
    Journal of cellular and molecular medicine
  • 影响因子：
    5.3
  • 作者：
    Zhao T;Wang C;Huo X;He ML;Chen J
  • 通讯作者：
    Chen J
Genomic variants in Fas-mediated apoptosis pathway predict a poor response to Platinum-based Chemotherapy for Chinese Gastric Cancer Patients.
Fas介导的细胞凋亡途径的基因组变异预示着中国胃癌患者对铂类化疗的不良反应
  • DOI：
    10.7150/jca.48120
  • 发表时间：
    2021
  • 期刊：
    Journal of Cancer
  • 影响因子：
    3.9
  • 作者：
    Zhao T;Li W;Chen J;Qin W
  • 通讯作者：
    Qin W

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其他文献

甘蔗单糖转运蛋白基因ShSTP7序列分析及组织表达特征测定
  • DOI：
    10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2021-1537
  • 发表时间：
    2022
  • 期刊：
    生物技术通报
  • 影响因子：
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  • 作者：
    赵婷婷;王俊刚;王文治;冯翠莲;冯小艳;张树珍
  • 通讯作者：
    张树珍
The non-negligibility of greenhouse gas emission from a combined pre-composting and vermicomposting system with maize stover and cow dung
玉米秸秆和牛粪预堆肥与蚯蚓堆肥联合系统的温室气体排放不可忽视
  • DOI：
    10.1007/s11356-020-12172-2
  • 发表时间：
    2021-01
  • 期刊：
    Environmental Science and Pollution Research
  • 影响因子：
    5.8
  • 作者：
    张蕾;赵婷婷;师恩慧;张尊昊;Zhang Y.;陈玉香
  • 通讯作者：
    陈玉香
二甲双胍铬(Ⅲ)配合物对糖尿病合并非 酒精性脂肪肝大鼠的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    化学研究与应用
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    赵婷婷;宋珍;张培栋;梁钢;董金龙
  • 通讯作者：
    董金龙
亲水作用毛细管电色谱分析苷类药物的研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    福州大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    易姣姣;赵婷婷;林旭聪;朱春玲
  • 通讯作者：
    朱春玲
基于MRI及IMRT下的鼻咽癌新T分期研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    中华放射肿瘤学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周平婷;康敏;赵婷婷;岳海英;韦婷婷;王仁生
  • 通讯作者：
    王仁生

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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