DNA计算模型的理论研究及应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    60503002
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    26.0万
  • 负责人：
    王淑栋
  • 依托单位：
    山东科技大学
  • 学科分类：
    F0201.计算机科学的基础理论
  • 结题年份：
    2008
  • 批准年份：
    2005
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2006-01-01 至2008-12-31

项目摘要

本项目是关于计算机科学、数学和生物学的综合交叉性研究课题。研究内容重点是建立通用Watson-Crick图灵机模型，并对模型的形式验证技术、逻辑控制技术、完备性、可计算性、复杂性等理论进行深入系统的研究。初步建立DNA可计算性理论、DNA计算复杂性理论和DNA计算系统的形式语言理论。将DNA计算的形式理论和生物实验技术相结合，利用建立的通用DNA计算模型和并行计算机编程技术对图与组合优化中的NP完全问题的进行求解、仿真与检测。作为研究内容的一部分，将进一步研究DNA计算模型与膜计算模型的区别与联系，以建立分子生物计算下不同模型的转换、映射规则和方法。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（26）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（2）
专利数量（0）
求解0-１规划问题的DNA计算模型
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    强小利;曾波;王子成
  • 通讯作者：
    王子成
活体生物计算模型的研究进展及展望
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘向荣;赵东明;郗方;李菲
  • 通讯作者：
    李菲
An E®ective Solution for Redistricting Based on Divide-Conquer and Genetic Algorithm
基于分治法和遗传算法的有效选区重划解决方案
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Dynamics of Continuous Discrete and Impulsive Systems
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Shanchen Pang, Xiaowei Guan, Zhihui Lin, Leizhi
  • 通讯作者：
    Shanchen Pang, Xiaowei Guan, Zhihui Lin, Leizhi
Petri 网在工作流系统建模和分析中的应用
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    系统仿真学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    蒋昌俊;庞善臣
  • 通讯作者：
    庞善臣
DNA自组装技术的研究进展及难点
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    杨静;张成
  • 通讯作者：
    张成

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其他文献

最小支配集的活体分子计算模型
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘向荣;王淑栋;郗方
  • 通讯作者：
    郗方
DNA计算在组合优化中的应用及其复杂性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    系统工程与电子技术
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    殷志祥;刘文斌;董亚非;王淑栋
  • 通讯作者：
    王淑栋
Analysis of Gene Logic Networks for Arabidopsis
拟南芥基因逻辑网络分析
  • DOI：
    10.2174/1574893611308020012
  • 发表时间：
    2013-03
  • 期刊：
    Current Bioinformatics
  • 影响因子：
    4
  • 作者：
    王淑栋
  • 通讯作者：
    王淑栋
基于条件互信息的乳腺癌易感基因网络的构建和分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    计算机与数字工程
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王淑栋;范晓丹;王新赠
  • 通讯作者：
    王新赠
最小支配集问题的活体分子计算模型
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    计算机学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘向荣;王淑栋;郗方;陈梅
  • 通讯作者：
    陈梅

其他文献

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王淑栋的其他基金

复杂基因逻辑网络若干理论和应用研究
  • 批准号：
    61170183
  • 批准年份：
    2011
  • 资助金额：
    59.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目
基于网络核与核度理论的基因网络研究
  • 批准号：
    60874036
  • 批准年份：
    2008
  • 资助金额：
    37.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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