大豆抗菌核病主效QTL‘Rswm13’遗传基础解析及抗病基因作用机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31871650
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

In order to reduce the contradiction of yield losses caused by soybean white mold (SWM) and the deficiency of disease-resistant varieties, In our previous study, a novel SWM resistance locus ‘Rswm13’ was first reported using genome wide association analysis (GWAS)combined with linkage analysis. Based on these works, genome, transcriptome sequencing data, and sequencing-based high resolution genetic linkage map would be integrated to redefine ‘Rswm13’. The candidate genes would be screened by sequence variation analysis, copy number variation analysis and gene expression analysis. Function of these new candidate genes would be analyzed using soybean and model plant arabidopsis via Agrobacterium tumefaciens combined with CRISPR/Cas9 and over expression technology, respectively. The mechanism of the resistance gene of ‘Rswm13’ would be revealed by combining the transcriptome data of transgenic arabidopsis thaliana and soybean with epistemic QTL underlying SWM resistance.Functional markers would be developed based on resistance genes. These works would promote SWM resistance breeding process and prepare theoritical basis of soybean molecular breeding.
为缓解大豆菌核病危害逐年加重与抗病品种缺乏之间的矛盾,本项目前期利用全基因组关联分析和连锁分析共定位方法首次报道了抗大豆菌核病主效位点‘Rswm13’,本项目拟整合基因组重测序和转录组测序大数据,利用高分辨率遗传连锁图谱重新定义‘Rswm13’,通过序列变异分析、拷贝数变异分析、基因表达分析等策略筛选抗病候选基因,以大豆和模式植物拟南芥为目标植物,通过根癌农杆菌结合CRISPR/Cas9和过量表达等技术鉴定抗病候选基因功能,并通过转基因拟南芥和大豆的转录组结合QTL上位性互作分析揭示抗病基因的作用机制,继而开发实用化标记并验证其准确性,为推动和缩短我国抗大豆菌核病育种进程奠定理论基础。

结项摘要

菌核病是引起大豆产量损失的第二大病害,抗病资源的鉴定和抗病分子遗传基础研究非常必要。本项目前期利用全基因组关联分析和连锁分析共定位方法首次报道了抗大豆菌核病主效位点‘Rswm13’,通过本项目实施,筛选获得2个受核盘菌诱导上调表达的抗病候选基因,通过根癌农杆菌介导的遗传转化结合超表达和基因编辑技术获得抗病基因过表达和敲除植株,获得 2个具有抗病功能的基因。获得与3个抗病基因功能标记,依此建立高效的抗菌核病分子育种技术,筛选得到 14个抗大豆菌核病的优异大豆种质,可将抗病品种育成周期缩短至2-4年,大大提升育种效率和选择准确性。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Genetic dissection of soybean partial resistance to sclerotinia stem rot through genome wide association study and high throughout single nucleotide polymorphisms
通过全基因组关联研究和高通量单核苷酸多态性对大豆对菌核病茎腐病的部分抗性进行遗传解析
  • DOI:
    10.1016/j.ygeno.2020.10.042
  • 发表时间:
    2021-03-18
  • 期刊:
    GENOMICS
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Jing, Yan;Teng, Weili;Zhao, Xue
  • 通讯作者:
    Zhao, Xue
Genome-wide association study of partial resistance to sclerotinia stem rot of cultivated soybean based on the detached leaf method
基于离叶法的栽培大豆菌核病茎腐病部分抗性全基因组关联研究
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0233366
  • 发表时间:
    2020-05-18
  • 期刊:
    PLOS ONE
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Sun, Mingming;Jing, Yan;Han, Yingpeng
  • 通讯作者:
    Han, Yingpeng
Genome-wide identification and expression analysis of the polyamine oxidase gene family in soybean
大豆多胺氧化酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析
  • DOI:
    10.1139/cjps-2022-0019
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Can. J. Plant Sci.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Kuanwei Yu;Chen Na Yu;Xunchao Zhao;Kezhen Zha;Yuhang Zhan;Ning Xia;Xue Zhao;Yingpeng Han
  • 通讯作者:
    Yingpeng Han
Identification of glutathione transferase gene associated with partial resistance to Sclerotinia stem rot of soybean using genome-wide association and linkage mapping
利用全基因组关联和连锁作图鉴定与大豆核盘菌茎腐病部分抗性相关的谷胱甘肽转移酶基因
  • DOI:
    10.1007/s00122-021-03855-6
  • 发表时间:
    2021-05-31
  • 期刊:
    THEORETICAL AND APPLIED GENETICS
  • 影响因子:
    5.4
  • 作者:
    Jianan, Zou;Li, Wenjing;Han, Yingpeng
  • 通讯作者:
    Han, Yingpeng

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    侯玉平

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大豆胞囊线虫广谱型抗病位点Rscn1的精细定位、基因挖掘及功能解析
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  • 项目类别:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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