中国西南丹霞和喀斯特生境下绒毛报春复合群的分化式样研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31700173
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0201.植物分类学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Environmental heterogeneity is one of the most important drivers for species diversification. Southwest Mountains of subtropical China has high percentage endemism. Danxia and Karst Mountains are well-developed across the typography, resulting high environmental heterogeneity. There are few studies comparing whether these two habitats have different impacts on diversification. Primula tsiangii complex is a monophyletic group restricted in this area, and offer an ideal group for testing the divergence pattern between Danxia and Karst landform. In this study, we will first delimitate the species based on various evidences (including morphological characters, molecular markers, etc.), and then integrate the divergence pattern within and among species with their distribution data to identify: (1) diversification pattern of sister pairs in the two different habitats; (2) whether there are some cryptic species and what's their diversification pattern in the two habitats; (3) the presence of hybridization introgression events among species. Through the above studies, some evolutionary hypotheses (such as niche conservatism and character displacement) on the speciation pattern in Southwest Mountain habitats could be tested. The result could largely improve our understanding on how species adapted to different habitats.
环境异质性是物种多样性形成的重要驱动力。中国西南亚热带山区物种特有性强,地质特点迥异的丹霞和喀斯特地貌广泛发育,且交错分布,形成强烈的环境异质性。这两种生境是否对物种的分化存在不同影响?对比性的研究还十分缺乏。报春花属绒毛报春复合群是局限分布于该地区的单系群,其在两种地貌上专一性分布,是研究这种关系的理想类群。本项目拟以该类群为研究对象,首先利用形态和分子证据全面评估该类群的物种界限、种间及种内分化式样,结合不同地貌的分布特点,试图阐明(1)姐妹种对在两种生境中的分化式样;(2)是否存在隐存种,在两种生境上分化式样如何?(3)杂交渐渗现象在种间及生境间的分布如何?通过上述研究,本项目试图回答中国西南亚热带山区生境差异与物种分化的一些进化问题(如生态位保守性、性状置换理论等),为进一步的适应性机制研究提供基础数据。

结项摘要

本项目选取在丹霞和喀斯特地貌上专性分布的绒毛报春复合群为研究对象,分析中国西南山地环境异质性与物种分化之间的关系。我们完成了绒毛报春复合群及其近缘种群体水平的形态学和细胞学研究;采用Hyb-seq和Genome skimming测序技术获取696个单拷贝核基因和叶绿体全基因组数据重建了藏报春亚属的系统发育关系;利用报春花属和点地梅属的种子化石作为校准点估算藏报春亚属的分化时间;利用重测序数据开展群体遗传学研究;并开展叶绿体基因组比较分析和物种多样化分析。主要研究结果为:(1)全面查清了绒毛报春复合群物种的地理分布式样、生境和物候特征。(2)测定喀斯特地貌土壤的交换性镁含量显著高于丹霞土壤。(3)首次报道了报春花属18个物种的染色体数目。测定绒毛报春复合群的染色体数目为2n=22和2n=24,并发现一个3倍体种群(2n=3x=36)。(4)综合形态学、细胞学和分子系统学证据,将绒毛报春复合群划分为15个物种,包括1个隐存种。描述报春花属1个新组和13个新种。(5)验证报春花组为杂交起源,其母本来源于专性分布于丹霞地貌的广东报春分支的祖先种,父本来源于绒毛报春复合群分支的祖先种。(6)推算绒毛报春复合群的冠群分化时间约为8 Ma。随后,从5 Ma开始绒毛报春复合群的多样化速率迅速增长,这与丹霞地貌发育的地质时期基本一致。(7)发现绒毛报春复合群的叶绿体基因组核酸多态性高于报春花组。综合上述研究结果,推论中国西南山地的环境异质性促进了藏报春亚属的物种分化,丹霞地貌的发育促进了绒毛报春复合群物种多样性的形成。本项目的开展为进一步研究丹霞和喀斯特生境下的物种形成机制奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Primula centellifolia (Primulaceae), a new species from south-central China
报春花(报春科),中国中南部一新种
  • DOI:
    10.11646/phytotaxa.326.4.4
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Phytotaxa
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Xu Yuan;Hu Chi Ming;Hao Gang
  • 通讯作者:
    Hao Gang
Primula vallicola sp. nov. (Primulaceae) from Sichuan, China
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  • DOI:
    10.1111/njb.02116
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Nordic Journal of Botany
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    Xu Yuan;Hao Gang;Hu Chi Ming
  • 通讯作者:
    Hu Chi Ming
(2759) Proposal to conserve the name Androsace bulleyana against A. coccinea (Primulaceae)
(2759) 建议保留 Androsace bulleyana 名称以对抗 A. coccinea(报春花科)
  • DOI:
    10.1002/tax.12306
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Taxon
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Xu Yuan;Hu Chi Ming;Hao Gang
  • 通讯作者:
    Hao Gang
On the identity of Androsace sarmentosa var. yunnanensis (Primulaceae) from Yunnan, China
关于垂盆草的身份。
  • DOI:
    10.1111/njb.01886
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Nordic Journal of Botany
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    Xu Yuan;Hao Gang;Hu Chi Ming
  • 通讯作者:
    Hu Chi Ming
(2760) Proposal to conserve the name Primula sinensis Sabine ex Lindl. against P. sinensis Lour. (Primulaceae)
(2760) 建议保留 Primula sinensis Sabine ex Lindl 名称。
  • DOI:
    10.1002/tax.12307
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Taxon
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Xu Yuan;Deng Yun Fei;Hao Gang;Hu Chi Ming
  • 通讯作者:
    Hu Chi Ming

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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