西北干旱荒漠区利什曼原虫、白蛉和蜥蜴的协同进化研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31872959
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0401.动物进化与发育
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Coevolution is a hot topic in evolutionary biology. Parasites and their hosts are a special interaction system, representing an excellent system for studying coevolution. The manifestation of coevolution between them is revealed mainly in the host-specificity, coadaptation and cospeciation. Leishmaniasis is serious threat to global health and security, casued by the protozoan Leishmania spp. and transmitted via the bite of infected female sandflies. In the current context of worldwide re-emergence and spreading of leishmaniasis, the relevance of distinction of strains further gains importance. Most Chinese natural foci of leishmaniasis are located in the arid desert region in Northwest China. In a previous study based on ITS1 sequences, we found evidence for natural infection of some desert lizards in Northwest China with reptilian Leishmania and mammalian Leishmania species. Further studies on coevolution between the Leishmania parasites with their lizard hosts and sandfly vectors are recommended for a better understanding of their epidemiological involvement. In the present study, we propose to integrate genetic, epidemiological, and environmental data into investigating the coevolution between Leishmania parasites, sandflies and lizard hosts throughout the arid desert region. In order to detect the presence of Leishmania spp. in desert lizards, we will employ approaches including the traditional method of blood smear analysis and the highly sensitive polymerase chain reaction (PCR). The DNA sequences will be used for genealogical analyses in conjunction with some representative Leishmania sequences retrieved from GenBank. To identify the effects of the processes that shape parasite diversity, we will incorporate both deep (phylogenetic) and shallow (population) perspectives. We will also incorporate DNA data, climatic and geographical features into investigating the diversification, historical demography of Leishmania species. Specifically, we will conduct cophylogenetic analyses by using both event-based and distance-based approachs. The results of this study will enhance our understanding of the diversity of Leishmania parasites in lizards and their distribution range as well as the role that the lizards play in spreading leishmaniasis, and provide a good model for coevolution of parasite-host. This is crucial for correct diagnosis and prognosis of the diseases as well as for making decisions regarding treatment and control strategies. Using integrative approaches to study coevolution between parasites and their hosts is just beginning and has attracted substantial attention. This project builds on top of our previous work and will strengthen our position as a leader in this area.
协同进化是进化生物学研究的热点。寄生虫与宿主是一个特殊的互作系统,是研究协同进化的极佳体系。利什曼病对人体危害严重,由利什曼原虫引起和白蛉传播,在全球范围再度回升。西北干旱荒漠区为我国利什曼病的主要疫区,我们前期研究发现蜥蜴可寄生有蜥蜴利什曼原虫和哺乳类利什曼原虫。本项目拟对干旱荒漠区的蜥蜴、白蛉进行广泛采样,检测其体内寄生利什曼原虫的感染情况,研究利什曼原虫多样性;并整合遗传数据、流行病学特征和环境地理分布等数据,从系统发育和种群分化二个视角,重建其系统进化关系和演化历史,进而探究利什曼原虫、白蛉、蜥蜴三者之间的协同进化机制。研究结果将促进利什曼原虫的系统分类和流行病学研究,为研究寄生虫与宿主的协同进化提供良好的模型,并为理解利什曼病的传播、诊断和预警提供科学依据。用整合方法研究寄生虫与宿主的协同进化关系是近年来兴起的,我们已有很好的基础。本项目将进一步深化和强化我们在这个领域的研究。

结项摘要

利什曼病对人体危害严重,由利什曼原虫引起和白蛉传播。西北干旱荒漠区为我国利什曼病的主要疫区,我们前期研究发现蜥蜴可寄生有蜥蜴利什曼原虫和哺乳类利什曼原虫。我们对西北干旱荒漠区的爬行动物(蜥蜴、蛇)进行扩大采样,联合多基因片段检测了它们体内寄生利什曼原虫的感染情况。由于新冠疫情影响,野外科考进展不顺利、多次中断,未能成功地采集到白蛉。结果支持多种蜥蜴和蛇类血液不仅有蜥蜴类利什曼原虫,还有哺乳类利什曼原虫(如热带利什曼原虫、都兰利什曼原虫、杜氏利什曼原虫合体等)。干旱荒漠区利什曼原虫组成复杂、异质性高,这些寄生虫没有显著的地理结构和宿主特异性,可能与蜥蜴和白蛉不存在关联进化。中国分布的杜氏利什曼原虫复合体不是通过丝绸之路从欧洲引入,而是具有本土特点。依托本项目,我们还开展了下列相关研究:干旱荒漠区蜥蜴体表寄生蜱调查与分子鉴定;杜氏利什曼原虫的4种蛋白的生物信息分析,以寻找疫苗表位和药物靶点;内脏利什曼原虫药敏试验;婴儿利什曼原虫磷酸烯醇丙酮酸羧基酶优势表位基因;肠道菌群失调对内脏利什曼病感染致病性的影响;TLR-2 增强剂对利什曼原虫感染BALB/c小鼠致病性的影响;营养不良对内脏利什曼病感染BALB/c小鼠的致病性影响研究。此外,我们从干旱荒漠区寄生麻蜥的蜱虫样品检测到利什曼原虫DNA,这一发现暗示了蜱虫有可能参与了荒漠型黑热病的传播。依托本项目,已发表标注论文13篇,其中SCI收录10篇(第一标注论文1篇,第二标注论文2篇);并培养中青年学术带头人1人,项目主持人先后竞聘为硕士生导师、博士生导师,1名主研人员竞聘为副教授和硕士生导师。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
基于454 GS FLX高通量测序的南疆沙蜥微卫星特征分析及其候选引物设计
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    四川动物
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    宋琪;郭宪光;陈达丽
  • 通讯作者:
    陈达丽
Multi-locus characterization and phylogenetic inference of Leishmania spp. in snakes from Northwest China
利什曼原虫属的多位点特征和系统发育推断。
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0210681
  • 发表时间:
    2019-04-25
  • 期刊:
    PLOS ONE
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Chen, Han;Li, Jiao;Chen, Jianping
  • 通讯作者:
    Chen, Jianping
小组合作学习在人体寄生虫学教学中的实践初探
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    热带医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈达丽;田玉;陈琦伟;李浇;陈建平
  • 通讯作者:
    陈建平
Next-generation sequencing yields a nearly complete mitochondrial genome of the Multiocellated Racerunner (Eremias multiocellata) in Northwest China
新一代测序获得了中国西北地区多孔麻蜥(Eremias multiocellata)几乎完整的线粒体基因组
  • DOI:
    10.1080/23802359.2019.1598810
  • 发表时间:
    2019-01
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA Part B
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Su Xiuliang;Liu Jinlong;Chen Dali;Guo Xianguang
  • 通讯作者:
    Guo Xianguang
Direct and Indirect Inhibition Effects of Resveratrol against Toxoplasma gondii Tachyzoites In Vitro
白藜芦醇对弓形虫速殖子的体外直接和间接抑制作用
  • DOI:
    10.1128/aac.01233-18
  • 发表时间:
    2019-03-01
  • 期刊:
    ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Chen, Qi-Wei;Dong, Kai;Chen, Jian-Ping
  • 通讯作者:
    Chen, Jian-Ping

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其他文献

电子版绘图在人体寄生虫学实验教学改革中的效果初探
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    王雅静
基于16S rRNA和rpoB基因的分子系统发育分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何艳霞;向诗非;李 浇;何金蕾;张俊荣;袁冬梅;秦翰霄;陈达丽;陈建平
  • 通讯作者:
    陈建平
核糖体小亚基RNA和细胞色素氧化酶亚单位II基因在中国利什曼原虫系统发育学分析中应用的比较
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    国际医学寄生虫病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曹得萍;廖琳;陈达丽;陈建平
  • 通讯作者:
    陈建平
婴儿利什曼原虫Pepck和Gp63优势表位的 真核与原核重组载体的构建与表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    四 川 大 学 学 报( 医 学 版 )
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张建辉;王玉洁;何金蕾;李焕卿;陈劲宇;陈达丽;陈建平
  • 通讯作者:
    陈建平
小班化背景下的人体寄生虫学教学模式探讨
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    热带医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈达丽;田玉;陈琦伟;王雅静;陈建平
  • 通讯作者:
    陈建平

其他文献

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陈达丽的其他基金

中国利什曼原虫种群结构与遗传分化研究
  • 批准号:
    31572240
  • 批准年份:
    2015
  • 资助金额:
    56.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
我国利什曼原虫系统分类、物种形成及演化的研究
  • 批准号:
    30800094
  • 批准年份:
    2008
  • 资助金额:
    20.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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