磷脂酰乙醇胺通过间质上皮转化(MET)调控体细胞重编程的机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31900614
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1201.干细胞基础研究
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Metabolic remodeling has emerged as key regulators of somatic cell reprogramming. Due to the complexity of lipid metabolism, rules and roles of lipid remodeling remain unclear. Specific lipid molecules and pathways involved in reprogramming need further investigation. Our previous work found key regulator of lipid metabolism, Srebp1, regulates reprogramming (Stem Cells, 2016). Using lipidomics approach, we revealed phospholipid remodeling occurred during reprogramming and identified phosphatidylethanolamine (PE) as key lipid in the early stage of reprogramming. PE regulated mesenchymal-epithelial transition (MET) during reprogramming. Preliminary mechanistic studies revealed PE binding protein Pebp1 modulated MET and most genes PE-regulated during reprogramming. The functional similarity between PE and Pebp1 promoted us to hypothesize PE coordinate Pebp1 to regulate MET in reprogramming. In this project, we aim to explore specific lipids and pathways involved in lipid remodeling during reprogramming, and to reveal mechanisms by which PE coordinate Pebp1 to control MET and reprogramming. This project will elucidate phospholipid remodeling during reprogramming and provide insights into metabolic regulation of cell fate.
近年来代谢重塑被发现在细胞命运决定中起重要作用。由于脂代谢的复杂性,其在细胞命运决定中的重塑规律及作用仍不清楚,关键的脂类分子及代谢途径仍需更深层次的研究。我们的工作发现脂代谢因子Srebp1调控高效安全的重编程(Stem Cells, 2016),后续我们利用脂质组学发现了体细胞重编程中的磷脂重塑现象,鉴定出磷脂酰乙醇胺(PE)为重编程早期关键的脂类,调控重编程中的间质上皮转化(MET)。初步机制探索发现PE结合蛋白Pebp1与PE在重编程中调控相似的下游,且与MET相关,由此我们推测PE与Pebp1协同调控重编程中的MET。本项目拟在此基础上,进一步深入研究体细胞重编程中的磷脂重塑规律及代谢途径,研究磷脂PE与Pebp1在重编程中的关系及其调控MET的分子机制。本研究将有望阐明重编程早期的磷脂重塑规律,揭示其代谢调控途径及其对MET的调控机制,为探索细胞命运转变的代谢调控提供重要思路。

结项摘要

脂代谢重塑是细胞命运转变中的关键步骤,而磷脂作为脂代谢中的一大种类在细胞命运调控中起着重要作用。本项目以体细胞重编程,胚胎干细胞分化等为模型,研究脂代谢重塑规律并鉴定关键磷脂分子。研究发现多能性退出的过程伴随着中性脂水解速率的上升,其上升是由分子伴侣介导的自噬调控,并发现加速中性脂水解可促进多能性退出。进一步机制研究利用脂质组学,发现中性脂水解影响磷脂稳态,并鉴定出磷脂酰乙醇胺与心磷脂为多能干细胞命运调控的关键磷脂分子,发现磷脂重塑可调控表观遗传及多能干细胞命运。本工作不仅揭示了脂代谢稳态在多能性维持中的作用及其调控蛋白,鉴定出磷脂酰乙醇胺和心磷脂为关键磷脂,还发现了脂代谢调控表观遗传及细胞命运的新模式。由于脂代谢变化及线粒体重塑存在于许多生理病理过程中,包括胚胎停滞,肿瘤发生,脂肪肝及神经退化等,这一工作为探索这些生理病理过程的机制提供了全新的思路。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Heterochromatin loosening by the Oct4 linker region facilitates Klf4 binding and iPSC reprogramming.
Oct4 连接区导致的异染色质松弛有利于 Klf4 结合和 iPSC 重编程。
  • DOI:
    10.15252/embj.201899165
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    The EMBO Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Chen Keshi;Long Qi;Xing Guangsuo;Wang Tianyu;Wu Yi;Li Linpeng;Qi Juntao;Zhou Yanshuang;Ma Bochao;Scholer Hans R;Nie Jinfu;Pei Duanqing;Liu Xingguo
  • 通讯作者:
    Liu Xingguo
OPA1-Exon4b Binds to mtDNA D-Loop for Transcriptional and Metabolic Modulation, Independent of Mitochondrial Fusion.
OPA1-Exon4b 与 mtDNA D 环结合,进行转录和代谢调节,不依赖于线粒体融合。
  • DOI:
    10.3389/fcell.2020.00180
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Frontiers in Cell and Developmental Biology
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Yang Liang;Tang Haite;Lin Xiaobing;Wu Yi;Zeng Sheng;Pan Yongzhang;Li Yukun;Xiang Ge;Lin Yifang;Zhuang Shimei;Song Zhiying;Jiang Yiguo;Liu Xingguo
  • 通讯作者:
    Liu Xingguo
Glis1 facilitates induction of pluripotency via an epigenome-metabolome-epigenome signalling cascade.
Glis1 通过表观基因组-代谢组-表观基因组信号级联促进多能性的诱导。
  • DOI:
    10.1038/s42255-020-0267-9
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Nature Metabolism
  • 影响因子:
    20.8
  • 作者:
    Li Linpeng;Chen Keshi;Wang Tianyu;Wu Yi;Xing Guangsuo;Chen Mengqi;Hao Zhihong;Zhang Cheng;Zhang Jinye;Ma Bochao;Liu Zihuang;Yuan Hao;Liu Zijian;Long Qi;Zhou Yanshuang;Qi Juntao;Zhao Danyun;Gao Mi;Pei Duanqing;Nie Jinfu;Ye Dan;Pan Guangjin;Liu Xingguo
  • 通讯作者:
    Liu Xingguo
Phase separation drives the self-assembly of mitochondrial nucleoids for transcriptional modulation.
相分离驱动线粒体核苷的自组装以进行转录调节。
  • DOI:
    10.1038/s41594-021-00671-w
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Nature Structural & Molecular Biology
  • 影响因子:
    16.8
  • 作者:
    Long Qi;Zhou Yanshuang;Wu Hao;Du Shiwei;Hu Mingli;Qi Juntao;Li Wei;Guo Jingyi;Wu Yi;Yang Liang;Xiang Ge;Wang Liang;Ye Shouhua;Wen Jiayuan;Mao Heng;Wang Junwei;Zhao Hui;Chan Wai-Yee;Liu Jinsong;Chen Yonglong;Li Pilong;Liu Xingguo
  • 通讯作者:
    Liu Xingguo
Plin2-mediated lipid droplet mobilization accelerates exit from pluripotency by lipidomic remodeling and histone acetylation
Plin2介导的脂滴动员通过脂质组学重塑和组蛋白乙酰化加速多能性的退出
  • DOI:
    10.1038/s41418-022-01018-8
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Cell Death & Differentiation
  • 影响因子:
    12.4
  • 作者:
    Wu Yi;Chen Keshi;Li Linpeng;Hao Zhihong;Wang Tianyu;Liu Yang;Xing Guangsuo;Liu Zichao;Li Heying;Yuan Hao;Lu Jianghuan;Zhang Cheng;Zhang Jinye;Zhao Danyun;Wang Junwei;Nie Jinfu;Ye Dan;Pan Guangjin;Chan Wai-Yee;Liu Xingguo
  • 通讯作者:
    Liu Xingguo

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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