NER系统基因miRNA-SNPs与肺癌遗传易感的关联及机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81660550
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    35.0万
  • 负责人：
    肖莎
  • 依托单位：
    海南医学院
  • 学科分类：
    H3007.卫生毒理
  • 结题年份：
    2020
  • 批准年份：
    2016
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Lung cancer is a complex process involved in genes and other factors, and its occurrence and development resulted from genetic and environmental interaction. Nucleotide excision repair (NER) is an important defense mechanism of the body to exogenous carcinogens and mutagens, such as benzo[a]pyrene (B[a]P). Research shows that DNA repair ability is the important factor to cancer susceptibility and DNA repair ability is closely related with single nucleotide polymorphisms (SNPs) and MicroRNAs (miRNAs). SNPs are the most abundant form of DNA variation in the human genome. A miRNA can bind to the 3’ untranslated region (UTR) of its target mRNA to post-transcriptionally regulate genes. Studies have shown that miRNAs play a role in several biological processes, including embryonic development, cell proliferation and differentiation, apoptosis, fat metabolism, atherosclerosis and oncogenesis. SNPs within the binding site of miRNA can affect miRNA-induced genetic repression. If an SNP can influence the binding of a miRNA to its target gene, this SNP is called a miRNA-SNP. Therefore, miRNA-SNPs can affect gene expression levels to influence susceptibility to disease. In the present study, we found that XPB and XPG are associated with the risk of lung cancer in Hainan. In addition, we will consider the genetic susceptibility of lung cancer in Li population. Therefore, we aim to identify miRNA-SNPs in the genes of NER pathways that may influence risk of lung cancer in Hainan. The combination of population investigations and functional studies related to miRNA-SNPs will provide powerful approaches for molecular epidemiological association studies in predicting lung cancer risk.
肺癌是严重威胁人类健康的公共卫生问题。NER系统基因的单核苷酸多态性 (SNP) 以及非编码RNA (miRNAs) 表观遗传调控和肿瘤遗传易感的关联研究颇受关注。前期研究发现，海南汉族人群中，NER系统基因多态及单体型可增加肺癌的发病风险。XPB、XPD、XPG基因3′UTR的SNP可能干扰miRNAs功能而异常调控靶基因表达水平，从而影响肺癌的遗传易感性，值得进一步探讨。另外，我们还需关注海南地区少数民族黎族人群。因此，本项目拟选择海南地区肺癌人群为研究对象，采用病例对照研究方法，检测XPD rs3916843 (A>G)，XPG rs873601 (G>A) 基因多态，分析其与肺癌患者发病风险的关联。采用microRNA芯片技术检测五个miRNA表达水平。构建候选miRNA-SNP转染细胞模型，与人群研究结果相结合，得到肺癌遗传易感关联的NER系统基因miRNA-SNPs。

结项摘要

肺癌是严重威胁人类健康的公共卫生问题。NER系统基因的单核苷酸多态性 (SNP) 以及非编码RNA (miRNAs) 表观遗传调控和肿瘤遗传易感的关联研究颇受关注。本项目在海南地区汉族人群中，纳入300例肺癌患者和300例非肺癌患者，检测XPG rs873601、ERCC1 C8092A位点SNP；检测XPB、XPD、XPG基因mRNA表达水平和miRNA-4715-3p、miRNA-466、miRNA-486-3p、miRNA-10b-5p、miRNA-200a-3p表达水平。调查120例以铂类药物为基础进行化疗治疗的肺癌患者的化疗及生存期情况。同时，体外构建Has-miR-486-3p过表达转染细胞系，以不同浓度苯并芘分别处理各转染细胞6h, 12h, 24h, 48h（染毒24h，洗后继续培养24h）。qPCR法检测各组细胞Has-miR-486-3p表达水平；MTT实验、Rad51免疫荧光实验检测细胞损伤修复水平。人群结果发现miRNA-4715-3p、miRNA-466、miRNA-10b-5p低表达，miRNA-486-3p高表达的人群具有较高的肺癌易感性。miRNA-4715-3p和XPG mRNA之间存在调控关系，年龄和XPG rs873601位点多态可影响肺癌患者XPG mRNA表达水平。XPG rs873601位点AA基因型肺癌患者的化疗有效率显著高于其他基因型，可用于预测铂类药物的化疗疗效。但双荧光素酶报告实验并未发现hsa-miR-4715-3p与h-XPG基因3’UTR的相互作用。体外实验结果发现5µM苯并芘处理Has-miR-486-3p过表达转染细胞24h，Has-miR-486-3p表达量最高；10µM苯并芘处理Has-miR-486-3p过表达转染细胞48h，Has-miR-486-3p表达量最高。

项目成果

期刊论文数量（14）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
肺癌遗传易感差异表达miRNA的筛选及生物信息学分析
  • DOI：
    10.13604/j.cnki.46-1064/r.2019.08.02
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    中国热带医学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吕鹏飞;肖莎;周静;马亚萍;李晓珍;黄奕江;龙文芳
  • 通讯作者：
    龙文芳
2000-2017年海口地区肺癌患者的流行病学调查分析
  • DOI：
    10.19450/j.cnki.jcrh.2020.03.010
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    中国研究型医院
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李逸轩;邓小刚;付君婷;段欣汝;韩淳;肖莎
  • 通讯作者：
    肖莎
2016-2017年海口市某国家监测点空气质量时间分布特征
  • DOI：
    10.15886/j.cnki.hdxbzkb.2019.0035
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    海南大学学报(自然科学版)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    肖莎;管孝贤;顾晨;刘丽;杨渝;王灵叶
  • 通讯作者：
    王灵叶
着色性干皮病基因表达与肺癌的关联研究
  • DOI：
    10.16241/j.cnki.1001-5914.2018.04.009
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    环境与健康杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    肖莎;符诒慧;黄奕江;叶家萍;周慈;周静;龙文芳;黄海溶
  • 通讯作者：
    黄海溶
海口市居民对慢性阻塞性肺疾病健康知识和危险因素的认知调查
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    中国初级卫生保健
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    管孝贤;顾晨;刘丽;杨渝;王灵叶;肖莎
  • 通讯作者：
    肖莎

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其他文献

海水浴场革兰阴性菌的检测及耐药性研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    海水浴场革兰阴性菌的检测及耐药性研究
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    龙文芳;李天娇;黄飞羽;陈姝;赵婵娟;肖莎;于德娥
  • 通讯作者：
    于德娥
Boundary element analysis of transversely isotropic bi‐material halfspaces with inclined planes of isotropy and interfaces
具有各向同性斜面和界面的横向各向同性双材料半空间的边界元分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    International Journal for Numerical and Analytical Methods in Geomechanics
  • 影响因子：
    4
  • 作者：
    肖莎;岳中琦;肖洪天
  • 通讯作者：
    肖洪天
Boundary element analysis of elastic fields in non-horizontally layered halfspace whose horizontal boundary subject to tractions
水平边界受牵引力的非水平层状半空间弹性场边界元分析
  • DOI：
    10.1016/j.enganabound.2018.06.020
  • 发表时间：
    2018
  • 期刊：
    Eng Anal Bound Elem
  • 影响因子：
    3.3
  • 作者：
    肖莎;岳中琦;肖洪天
  • 通讯作者：
    肖洪天
海口市装修居室内空气中甲醛浓度调查
  • DOI：
    10.13604/j.cnki.46-1064/r.2016.02.07
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    中国热带医学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    肖莎;龙文芳;杨建军;刘云儒;刘玉梅;于德娥
  • 通讯作者：
    于德娥
Dual boundary element method for analyzing three-dimensional cracks in horizontally layered halfspaces
水平层状半空间三维裂纹分析的双边界元法
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    Eng Anal Bound Elem
  • 影响因子：
    3.3
  • 作者：
    肖莎;岳中琦;肖洪天
  • 通讯作者：
    肖洪天

其他文献

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肖莎的其他基金

基于海南候鸟人群研究NAIs通过BER途径调节高血压的作用及分子机制
  • 批准号：
    82060603
  • 批准年份：
    2020
  • 资助金额：
    35 万元
  • 项目类别：
    地区科学基金项目

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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