里氏木霉sorbicillinoid类次级代谢产物生物合成机制的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31600036
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    19.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0103.微生物组学与代谢
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Sorbicillinoids are typical polyketide secondary metabolites produced by filamentous fungi such as Penicillium and Trichoderma spp. Due to the unique structures and diverse bioactivities, their biosynthetic mechanisms have attracted extensive attentions. However, the biosynthetic gene cluster and pathway of sorbicillinoids remain unclear so far. For the first time, our preliminary studies demonstrated that the important industrial producer of cellulases - Trichoderma reesei is capable of synthesizing sorbicillinoid compounds. We have located the candidate gene cluster likely responsible for sorbicillinoid biosynthesis through mining the genome of T. reesei QM6a strain. In order to understand the unique mechanisms for sorbicillinol assembly and monomer oligomerization, in this project, we propose to determine the boundaries of this gene cluster and the function of each biosynthetic gene by in-frame gene deletion. In the meantime, the research team is aimed to identify the key enzyme(s) involved in the transformation from monomer compounds to complex sorbicillinoid oligomers through heterologous protein expression and in vitro activity reconstitution. This study will provide theoretical and experimental basis for the design and development of new sorbicillinoid derivatives with improved bioactivities.
Sorbicillinoids是木霉、青霉等高等丝状真菌产生的特征性聚酮类次级代谢产物。由于化学结构独特、生物活性多样,其生物合成机制广受关注,但直至目前仍未阐明。我们的前期工作首次发现工业纤维素酶生产菌里氏木霉也具有合成sorbicillinoid类化合物的能力,通过深入的基因组序列分析,成功锁定其生物合成基因簇。为了阐明sorbicillinoids聚酮单体的合成途径及其独特的单体聚合机制,本项目拟通过定点基因敲除技术对其关键基因进行逐一敲除,确定该类化合物生物合成基因簇的边界和每个基因的生物学功能;同时采用蛋白异源表达和体外酶反应重建的方式寻找催化单体化合物sorbicillinol聚合形成复杂sorbicillinoid类化合物的关键酶,深入理解该家族化合物的生物合成机制,为未来设计和创造新的sorbicillinoid类活性产物提供理论和实验基础。

结项摘要

Sorbicillinoids是一类由真菌产生的己烯酮结构骨架的聚酮类化合物,其复杂的化学结构和多样化的生物学活性激发了科学家们的研究兴趣。尽管有研究者利用体外实验确定了产黄青霉黄素单加氧酶SorbC的功能,但对该菌株进行的所有基因敲除尝试均以失败告终。因而截至基金申报时,有关该类化合物生物合成途径假说的提出很大程度上仍然基于间接证据,而具体负责催化合成该类化合物的生物合成酶大多未获得鉴定。因此,本项目以里氏木霉QM6a为研究对象,利用化合物分离鉴定、生物合成基因簇锁定、关键基因的敲除及敲除菌株发酵鉴定等手段,对里氏木霉产生的sorbicillinoids化合物进行了分离鉴定并基本阐明了其生物合成机制。首先,本研究在QM6a的发酵产物中分离获得了六种sorbicillinoids化合物,并通过外源添加SAHA培养的方式,获得了4种甾醇类化合物。接下来,通过基因组扫描分析锁定了里氏木霉sorbicillinoids生物合成基因簇及其关键合成基因,并通过关键基因敲除后发酵分析阐明了这些基因的功能及sorbicillinoids生物合成途径。其中聚酮合酶TrsorA负责己二烯酰侧链的合成;而聚酮合酶TrsorB负责将TrsorA产物继续延伸并释放环化,生成sorbicillin(2’-3’Dihydrosorbicillin);黄素单加氧酶TrsorC氧化sorbicillin(2’-3’ Dihydrosorbicillin)生成sorbicillinol(2’-3’ Dihydrosorbicillinol);最后TrsorF催化单体sorbicillinoids聚合形成各种复杂的sorbicillinoids化合物。通过本项研究的开展,基本阐明了sorbicillinoids化合物生物合成机制,为未来设计和创造新的sorbicillinoids活性产物提供理论和实验基础。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Deciphering the late steps of rifamycin biosynthesis.
破译利福霉素生物合成的后期步骤
  • DOI:
    10.1038/s41467-018-04772-x
  • 发表时间:
    2018-06-14
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Qi F;Lei C;Li F;Zhang X;Wang J;Zhang W;Fan Z;Li W;Tang GL;Xiao Y;Zhao G;Li S
  • 通讯作者:
    Li S
Compartmentalized biosynthesis of mycophenolic acid.
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  • DOI:
    10.1073/pnas.1821932116
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Zhang Wei;Du Lei;Qu Zepeng;Zhang Xingwang;Li Fengwei;Li Zhong;Qi Feifei;Wang Xiao;Jiang Yuanyuan;Men Ping;Sun Jingran;Cao Shaona;Geng Ce;Qi Fengxia;Wan Xiaobo;Liu Changning;Li Shengying
  • 通讯作者:
    Li Shengying

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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