Déterminants moléculaires et prédiction de la liaison des protéines aux membranes de différentes compositions biologiques
不同生物组合物的蛋白质和膜的连接终止子分子和预测
基本信息
- 批准号:RGPIN-2022-04721
- 负责人:
- 金额:$ 2.33万
- 依托单位:
- 依托单位国家:加拿大
- 项目类别:Discovery Grants Program - Individual
- 财政年份:2022
- 资助国家:加拿大
- 起止时间:2022-01-01 至 2023-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Les membranes cellulaires forment des structures interfaciales fondamentales pour tous les êtres vivants. Ces structures sont composées de molécules complexes, majoritairement des lipides et des protéines. Les lipides sont des molécules amphiphiles se regroupant spontanément en bicouches, formant le cour des membranes cellulaires. Les protéines sont en quantité variable et ont des fonctions spécifiques : cytosquelette, enzymes, transport, récepteurs, etc... Les membranes cellulaires sont composées de plusieurs types de lipides. Ces compositions, souvent asymétriques entre les deux feuillets, varient grandement parmi les organismes vivants, d'une espèce à l'autre, ou même selon le stade de croissance, le genre et les conditions environnementales. Cette diversité dans la composition lipidique des membranes cellulaires permet de moduler ses propriétés physiques, offrant un milieu d'ancrage ayant des propriétés physique précises, et ainsi moduler la liaison et la fonction des protéines. La modélisation moléculaire est une approche unique et essentielle pour l'étude de la structure et de la dynamique des membranes complexes et des interactions protéines-lipides à l'échelle atomique. Les progrès récents dans les champs de forces des lipides, l'automatisation des simulations, la puissance des ordinateurs et la disponibilité de logiciels d'analyse ont grandement facilité la modélisation de membranes de plus en plus représentatives de la composition membranaire des organismes vivants. Toutefois, il existe toujours un frein majeur à la modélisation de la liaison des protéines à des membranes de compositions lipidiques complexes. En effet, les résultats finaux dépendent encore fortement de la topologie membranaire de la protéine utilisée au début de la trajectoire et, à notre connaissance, il n'existe pas d'outil rapide permettant de prédire la topologie membranaire d'une protéine en fonction de la composition lipidique de la membrane. Les objectifs spécifiques de notre programme de recherche pour les cinq prochaines années sont de 1) déterminer la distribution membranaire des acides aminés pour huit compositions membranaires différentes, soit les membranes de bactéries à Gram négatif (membranes intérieure et extérieure) et à Gram positif, fongique et de mammifère (plasmique moyenne et du cerveau), en plus des effets du genre et de l'âge pour la membrane plasmique de mammifère; et de 2) développer une méthode rapide et fiable pour la prédiction de l'orientation et de l'insertion des protéines dans les membranes tenant compte de la composition membranaire. Ce dernier objectif est construit à partir des connaissances acquises au premier objectif. En plus d'offrir un outil essentiel à la modélisation des protéines membranaires, ces travaux permettront d'approfondir la compréhension des interactions qui conduisent à la liaison des peptides et des protéines aux membranes de différentes compositions lipidiques.
les膜蜂窝料饲料des结构界面粉量倒在tous les。 CES结构藏有coséesdeMolécules复合物,Lipides et desProtéines。 Les Lipides Sont sontdesMoléculesAmphiphiles se Regrofutantspontanémentbicouches,架载型膜膜蜂窝织品。 LesProtéinessont endentité变量ant ont des fonctionsspécifiques:cytosquelette,酶,运输,réectepteurs等... les膜蜂窝织成员sontComposéesde plusieurs de lipides类型。 CES组成,不可分割的分散剂,deux feuillets,变化的宏伟的parmi les生物,d'uneeSpèce -l'autre,OuMêmeSelonle stade de croissance,le le Genre et ne Genre et en genre ven ven ven ven ven ven ven ven ven evormentales。 CetteversitéDansla组成lipidique des Membranes纤维素Permet de Moduler sespropriétés体形,杂物,未来的Milieu d'Ancrage ayantpropriétésdes des des des desproprécises,et ainsi moduler la liaison et la liaison et la liaison et la fonction。 LaModélisationMoléculaireest une grathe exentielle pour pourl'étudede la struction et de la dynambranes complecteres et des des vess Itspetionsprotéines-lipides-l'échelle原子量。 LesProgrèsRécentsdan champs de Lipides,L'Automation Des Simulations,La Puissance des ordinateurs et ladisponibilitédeLogiciels d'Analysze Ont ont grandeur设施是一种描述该组织组成的Modélisation的一种形式。该组织Toutefois拥有模型和组成的历史,该组织具有复杂的历史。 D'ETIL RAPIDE PRENTANT deprédirela Topogogie膜膜d'uneprotéineen fonction de la coptosition lipidique de la membrane。 Les objectifs spécifiques de notre programme de recherche pour les cinq prochaines années sont de 1) déterminer la distribution membranaire des acides aminés pour huit compositions membranaires différentes, soit les membranes de bactéries à Gram négatif (membranes intérieure et extérieure) et à Gram Positif,Fongique etdeMammifère(Plasmique Moyenne et du Cerveau),En plus des effets du genre et de l'ge pour pour pour la membrane plastique demammifère;等2)développeruneméthoderapide et laprédictionde l'Enerientation et de l'Ensertion des desprotéinesdans dans les membranes tenant tenant tenant tenant compte de la组成膜。 ce dernier objectif est construit - partir des connaissances获取au premier objectif。再加上d'Offrir unile of Essentiel -laModélisationprotégéines膜,两国之间的相互作用有利于该国的相互作用。
项目成果
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