Phenotypic screening using DNA-encoded libraries

使用 DNA 编码文库进行表型筛选

基本信息

批准号：
10622655
负责人：
Thomas J. Kodadek
金额：
$ 18.12万
依托单位：
UNIVERSITY OF FLORIDA
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
2018
资助国家：
美国
起止时间：
2018-09-01 至 2022-08-31
项目状态：
已结题

来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/10622655
关键词：
Phenotypic screening using DNA encoded

项目摘要

Project Summary This project will focus on the development of a powerful new approach for the discovery of bioactive small molecules via cell-based phenotypic screening. DNA-encoded one bead one compound libraries built on small beads will be complexed with cells and suspended in solution. A photolabile linker will be cleaved, exposing the cells briefly to a high local concentration of the compound on the bead to which they are attached. The cells will be engineered to report a phenotype of interest through the increase of a fluorescent signal. Beads carrying positive cells will be isolated by FACS and the encoding tags sequenced, revealing the structures of the hits. Since we will use libraries of molecules capable of linking to targets covalently, the identification of the target will be simplified greatly. This system will be used to discover novel new chemotherapy agents.

项目摘要该项目将着重于开发一种强大的新方法，以发现生物活性小分子通过基于细胞的表型筛选。 DNA编码的一个珠子一个化合物库建造在小珠将与细胞复合并悬浮在溶液中。将裂开光值链接器，暴露细胞短暂地将其附着的珠子上的化合物的高局部浓度短。细胞通过增加荧光信号的增加，将设计为报告感兴趣的表型。珠子携带正面细胞将通过FACS分离，并测序的编码标签揭示了命中的结构。由于我们将使用能够共价链接到目标的分子库，因此识别目标将大大简化。该系统将用于发现新型的新化疗剂。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Mechanistic Studies of the Multiple Myeloma and Melanoma Cell-Selective Toxicity of the Rpn13-Binding Peptoid KDT-11.

DOI：
10.1016/j.chembiol.2020.08.008
发表时间：
2020-11-19
期刊：
Cell chemical biology
影响因子：
8.6
作者：
Dickson P;Simanski S;Ngundu JM;Kodadek T
通讯作者：
Kodadek T

Synthesis and Screening of a DNA-Encoded Library of Non-Peptidic Macrocycles.

DOI：
10.1002/anie.202116999
发表时间：
2022-04-25
期刊：
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子：
16.6
作者：
Koesema, Eric;Roy, Animesh;Paciaroni, Nicholas G.;Coito, Carlos;Tokmina-Roszyk, Michal;Kodadek, Thomas
通讯作者：
Kodadek, Thomas

Physical and Functional Analysis of the Putative Rpn13 Inhibitor RA190.

DOI：
10.1016/j.chembiol.2020.08.007
发表时间：
2020-11-19
期刊：
Cell chemical biology
影响因子：
8.6
作者：
Dickson P;Abegg D;Vinogradova E;Takaya J;An H;Simanski S;Cravatt BF;Adibekian A;Kodadek T
通讯作者：
Kodadek T

Structural characterization of a peptoid-inspired conformationally constrained oligomer (PICCO) bound to streptavidin.

与链霉亲和素结合的类肽构象限制寡聚物 (PICCO) 的结构表征。