Assembly of Picornaviral Replication Complexes
小核糖核酸病毒复制复合物的组装
基本信息
- 批准号:10088366
- 负责人:
- 金额:$ 37.76万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2004
- 资助国家:美国
- 起止时间:2004-04-01 至 2023-02-22
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:Active SitesAcute HepatitisAddressAntiviral AgentsAttenuatedBindingBiophysicsCatalysisCellsChildCommon ColdComplementComplexCoxsackie VirusesCrystallizationDataDimerizationDiseaseEndoplasmic ReticulumEnzymesEventFamilyFamily PicornaviridaeFingersFundingGenomeGoalsGrowthHand, Foot and Mouth DiseaseHeart DiseasesHepatitis A VirusHumanHuman poliovirusIn VitroInternetLeadLife Cycle StagesLipid BilayersMediatingMembraneMethodsMicroscopyMolecularMusNucleotidesParalysedPathway interactionsPoliomyelitisPolymerasePolyproteinsProcessProtein EngineeringProtein PrecursorsProteinsProteolytic ProcessingRNARNA BindingRNA StabilityRNA VirusesRNA chemical synthesisRNA replicationRNA-Directed RNA PolymeraseRNA-Protein InteractionReactionReplication-Associated ProcessResearch Project GrantsRhinovirusRoleSolidSpecificityStructureSurfaceTranslationsVesicleViralViral Drug ResistanceViral GenomeViral ProteinsVirionVirusVirus AssemblyVirus Replicationbasebiophysical techniquescell typecosthuman diseasemembernovelnovel vaccinesparticleprotein protein interactionresponsescaffoldsensorsingle moleculestemstructural biologyviral RNA
项目摘要
The picornaviruses are a family of small positive sense single stranded RNA viruses that cause a wide range
of diseases at an annual cost well into the hundreds of million dollars. Members include acute hepatitis A virus,
the heart disease causing coxsackie B3 virus, rhinoviruses that cause more than half the occurrences of the
common cold, and the paralyzing poliovirus. These viruses share a life cycle where RNA replication and viral
assembly occurs in large membrane anchored replication complexes assembled on the surfaces of vesicles
derived from the endoplasmic reticulum. The replication process is driven by a virally encoded RNA dependent
RNA polymerase (3Dpol) that is responsible for the synthesis of all viral RNA. This research project is focused
on the structure and assembly of the viral replication centers and on structure-function studies of the viral
polymerases to understand mechanisms that control of elongation rates and replication fidelity. We have
solved multiple crystal structures of 3Dpol as elongation complexes with bound RNA and these structures
revealed a novel mechanism by which RdRPs close their active sites for catalysis in response to nucleotide
binding. In this upcoming project period we will use biophysical and structural biology methods to further our
mechanistic understanding of RNA translocation by 3Dpol and to solve the structures of viral initiation and
uridylylation complexes. We will also use single molecule microscopy and particle tracking methods to directly
visualize the in vitro assembly of viral replication complexes onto supported lipid bilayers.
picornavirus是一个小型积极意义的单一链RNA病毒的家族,引起广泛的范围
每年的疾病的成本都达到了数百万美元。成员包括急性肝炎病毒,
心脏病引起coxsackie b3病毒,鼻病毒导致一半以上发生的鼻病毒
普通感冒和瘫痪的脊髓灰质炎病毒。这些病毒共享一个生命周期,其中RNA复制和病毒
组装发生在组装在囊泡表面的大膜锚定复制复合物中
源自内质网。复制过程由病毒编码的RNA依赖驱动
RNA聚合酶(3DPOL),负责所有病毒RNA的合成。该研究项目集中在
关于病毒复制中心的结构和组装以及病毒的结构功能研究
了解控制伸长率和复制保真度的机制。我们有
求解了3DPol的多个晶体结构,作为与结合RNA和这些结构的伸长复合物
揭示了一种新型机制,RDRP通过该机制关闭其活性位点以响应核苷酸
结合。在接下来的项目时期,我们将使用生物物理和结构生物学方法来进一步
3DPol对RNA易位的机械理解,并解决病毒启动的结构和
尿液层化复合物。我们还将使用单分子显微镜和粒子跟踪方法直接
可视化病毒复制复合物的体外组装上受支持的脂质双层。
项目成果
期刊论文数量(18)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A quantitative stopped-flow fluorescence assay for measuring polymerase elongation rates.
- DOI:10.1016/j.ab.2009.04.035
- 发表时间:2009-08-01
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- 影响因子:2.9
- 作者:Gong P;Campagnola G;Peersen OB
- 通讯作者:Peersen OB
ATP Is an Allosteric Inhibitor of Coxsackievirus B3 Polymerase.
- DOI:10.1021/acs.biochem.6b00467
- 发表时间:2016-07-19
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Karr JP;Peersen OB
- 通讯作者:Peersen OB
Distinct conformations of a putative translocation element in poliovirus polymerase.
- DOI:10.1016/j.jmb.2013.12.031
- 发表时间:2014-04-03
- 期刊:
- 影响因子:5.6
- 作者:Sholders AJ;Peersen OB
- 通讯作者:Peersen OB
Vemurafenib Inhibits Acute and Chronic Enterovirus Infection by Affecting Cellular Kinase Phosphatidylinositol 4-Kinase Type IIIβ.
- DOI:10.1128/spectrum.00552-23
- 发表时间:2023-08-17
- 期刊:
- 影响因子:3.7
- 作者:
- 通讯作者:
Structures of coxsackievirus, rhinovirus, and poliovirus polymerase elongation complexes solved by engineering RNA mediated crystal contacts.
- DOI:10.1371/journal.pone.0060272
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:3.7
- 作者:Gong P;Kortus MG;Nix JC;Davis RE;Peersen OB
- 通讯作者:Peersen OB
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