Male/Female differences in psychosis and mood disorders:Dynamic imaging-genomic models for characterizing and predicting psychosis and mood d
精神病和情绪障碍的男性/女性差异:用于表征和预测精神病和情绪障碍的动态成像基因组模型
基本信息
- 批准号:10093861
- 负责人:
- 金额:$ 15.55万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2019
- 资助国家:美国
- 起止时间:2019-05-25 至 2024-01-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:3-DimensionalAddressAlgorithmsBiologicalBiological MarkersBipolar DisorderBrainBrain imagingCategoriesClinicalCognitiveCommunitiesComplexConsensusDataData SetDiagnosisDiagnosticDiagnostic and Statistical Manual of Mental DisordersDiffusion Magnetic Resonance ImagingDimensionsDiseaseEnvironmental Risk FactorExhibitsFemaleFunctional Magnetic Resonance ImagingGeneticGenomicsGoalsGroupingImageIndividualJointsMeasuresMental disordersMethodsModelingMood DisordersMoodsPlayPsychotic DisordersRoleSchizophreniaServicesSingle Nucleotide PolymorphismSourceStructureSubgroupSymptomsTimeUnipolar Depressionbasedata fusiondisease classificationflexibilitygenomic datamalemeetingsmultidimensional datamultimodal datamultimodalityneurobehavioralnovelsextask analysistool
项目摘要
Disorders of mood and psychosis such as schizophrenia, bipolar disorder, and unipolar
depression are incredibly complex, influenced by both genetic and environmental factors, and
the clinical characterizations are primarily based on symptoms rather than biological
information. Current diagnostic approaches are based on symptoms, which overlap extensively
in some cases, and there is growing consensus that we should approach mental illness as a
continuum, rather than as a categorical entity. Since both genetic and environmental factors
play a large role in mental illness, the combination of brain imaging and genomic data are
poised to play an important role in clarifying our understanding of mental illness. However, both
imaging and genomic data are high dimensional and include complex relationships that are
poorly understood. To characterize the available information, we are in need of approaches that
can deal with high-dimensional data exhibiting interactions at multiple levels (i.e., data fusion),
while providing interpretable solutions (i.e., a focus on brain and genomic networks). An
additional challenge exists because the available data has mixed temporal dimensionality, e.g.,
single nucleotide polymorphisms (SNPs) do not change over time, brain structure changes
slowly over time, while fMRI changes rapidly over time. To address these challenges, we
introduce a new unified framework called flexible subspace analysis (FSA) that subsumes
existing models while providing important extensions. FSA can automatically identify subspaces
(groupings of unimodal or multimodal components) in joint multimodal data. Our approach
leverages the interpretability of source separation approaches and can include additional
flexibility by allowing for a combination of both linear and nonlinear (shallow and deep)
subspaces. We will apply the developed models to a large (N~80,000) dataset including
individuals along the mood and psychosis spectrum to evaluate the important question of
disease categorization. We will compute fully cross-validated genomic-neuro-behavioral profiles
of individuals including a comparison of the predictive accuracy of 1) standard categories from
the diagnostic and statistical manual of mental disorders (DSM), 2) data-driven subgroups, and
3) dimensional relationships. We will also evaluate the single subject predictive power of these
profiles in independent data to maximize generalization. All methods and results will be shared
with the community. The combination of advanced algorithmic approach plus the large N data
promises to advance our understanding of the nosology of mood and psychosis disorders in
addition to providing new tools that can be widely applied to other studies of complex disease.
情绪障碍和精神病,例如精神分裂症、双相情感障碍和单相情感障碍
抑郁症非常复杂,受到遗传和环境因素的影响,并且
临床特征主要基于症状而不是生物学
信息。当前的诊断方法基于症状,这些症状广泛重叠
在某些情况下,人们越来越一致认为我们应该将精神疾病视为一种治疗方法
连续体,而不是作为一个分类实体。由于遗传和环境因素
在精神疾病中发挥着重要作用,脑成像和基因组数据的结合
准备在澄清我们对精神疾病的理解方面发挥重要作用。然而,两者
成像和基因组数据是高维的,并且包含复杂的关系
不太了解。为了表征可用信息,我们需要以下方法:
可以处理在多个级别上表现出交互的高维数据(即数据融合),
同时提供可解释的解决方案(即关注大脑和基因组网络)。一个
存在额外的挑战,因为可用数据具有混合的时间维度,例如,
单核苷酸多态性(SNP)不会随时间而改变,大脑结构会发生变化
随着时间的推移缓慢变化,而功能磁共振成像随着时间的推移快速变化。为了应对这些挑战,我们
引入一个新的统一框架,称为灵活子空间分析(FSA),其中包含
现有模型,同时提供重要的扩展。 FSA可以自动识别子空间
联合多模态数据中的(单模态或多模态分量的分组)。我们的方法
利用源分离方法的可解释性,并且可以包括额外的
通过允许线性和非线性(浅层和深层)的组合来实现灵活性
子空间。我们将把开发的模型应用到大型(N~80,000)数据集,包括
沿着情绪和精神病谱系的个体来评估以下重要问题:
疾病分类。我们将计算完全交叉验证的基因组神经行为特征
个人的预测准确性的比较,包括 1) 标准类别
精神障碍诊断和统计手册 (DSM),2) 数据驱动的亚组,以及
3)尺寸关系。我们还将评估这些的单一受试者预测能力
独立数据中的概况以最大限度地概括。所有方法和结果将被共享
与社区。先进算法方法与大N数据的结合
有望增进我们对情绪和精神病疾病的疾病分类学的理解
除了提供可广泛应用于其他复杂疾病研究的新工具之外。
项目成果
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