Role of ETS-Transcription Factors in Regulating Cell Fate
ETS 转录因子在调节细胞命运中的作用
基本信息
- 批准号:10702686
- 负责人:
- 金额:$ 31.44万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:
- 资助国家:美国
- 起止时间:至
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:BindingCell NucleusCell ProliferationCellsDataDefectDevelopmentEmbryonic DevelopmentEnhancersEnsureFamilyGene ExpressionGene Expression ProfileGenesGenetic TranscriptionGoalsGrowthKRAS2 geneMAP Kinase GeneMalignant NeoplasmsMembraneMethyltransferaseMusNRAS geneNuclearProteinsPublicationsRAS genesReceptor SignalingRoleScienceTranscription RepressorWorkbehavioral extinctionembryonic stem cellpluripotencyprogramsras Proteinstranscription factortranscriptome sequencing
项目摘要
During FY2021 we have made great progress in this project, and we have this work accepted for publication in Sciences Advances. We have established the role of the transcriptional repressor ERF as the MAPK dependent switch that controls the exit from the naive state of pluripotency. For this, we have used inducible ESCs to genetically eliminate all RAS proteins and determined that, while differentiated RAS deficient cells remain trapped in an intermediate state of pluripotency, further absence of ERF overcomes the developmental blockage of RAS deficient cells from this intermediate state. We also performed RNAseq data and observed that deletion of ERF restored the overall gene expression profile to a wild type level in differentiated Ras deficient cells. Mechanistically, we have demonstrated that ERF ensures naive pluripotency by strengthen naive pluripotent transcription factor binding and accessibility at specific ESC enhancers. Moreover, we have also determined that ERF regulates negatively the expression of the de novo methylase DNMT3, essential for the extinction of the naive transcriptional program. Our data has revealed an essential role for ERF in the exit from rosette pluripotency as a regulator of the progression to primed pluripotency.
在2021财年期间,我们在该项目中取得了长足的进步,并且我们接受了这项工作以供科学发展中出版。我们已经确定了转录阻遏物ERF作为MAPK依赖性开关的作用,该开关控制了从多能的天真状态出口。为此,我们已经使用了诱导的ESC来消除所有RAS蛋白,并确定,尽管分化的Ras缺乏细胞仍然被困在多能性的中间状态下,但缺乏ERF的进一步克服了RAS缺乏细胞与该中间状态的发育阻塞。我们还进行了RNASEQ数据,并观察到ERF的缺失将整体基因表达谱恢复到分化的RAS缺陷细胞中的野生型水平。从机械上讲,我们已经证明了ERF通过增强特定ESC增强子的幼稚多能转录因子结合和可访问性来确保天真的多能性。此外,我们还确定ERF对新甲基酶DNMT3的表达进行负面调节,这对于灭绝幼稚的转录程序至关重要。我们的数据揭示了ERF在从玫瑰花结多能力中退出的重要作用,这是对启动多能的进展的调节剂。
项目成果
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