6 Base PCR to Build a Superior Genetic Detection System
6碱基PCR构建卓越的基因检测系统
基本信息
- 批准号:6736698
- 负责人:
- 金额:$ 9.98万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2004
- 资助国家:美国
- 起止时间:2004-02-01 至 2004-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
DESCRIPTION (provided by applicant): Although, the storage of genetic information for all living systems is derived from the organizational string of just two base pairs (A:T and G:C), additional nucleic acid bases and base-pairs are chemically possible. We have shown that two additional bases encoding a third base pair can be applied to PCR along with the I four-base, two-base-pair system of nature. This project will focus on using this newly discovered six-base PCR system to advance and simplify ligonucleotide ligation systems for highly multiplexed genetic analysis. The three-base-pair PCR technology will be used in a genetic analysis system which first uses ligation to specifically couple sequence-specific primer sets and then PCR to amplify those ligated sets. The additional complexity provided by using three base pairs will allow the products of the proposed analysis system to be analyzed by room temperature hybridization. This analysis will achieve higher complexity and better discrimination than that possible with natural DNA alone. The goal is to simplify and advance genetic analysis technology with six-base PCR in order to lower cost and increase robustness and accuracy. If this can be demonstrated in Phase I of this project, additional chemistries should benefit from a six-base PCR system including aptamer production and DNA tagging strategies.
描述(由申请人提供):虽然所有生命系统的遗传信息的存储都源自仅两个碱基对(A:T和G:C)的组织串,但附加的核酸碱基和碱基对在化学上是可能的。我们已经证明,编码第三个碱基对的两个额外碱基可以与自然界的四碱基、两碱基对系统一起应用于PCR。该项目将重点利用这一新发现的六碱基 PCR 系统来推进和简化寡核苷酸连接系统,以进行高度多重遗传分析。三碱基对 PCR 技术将用于遗传分析系统,该系统首先使用连接来特异性偶联序列特异性引物组,然后使用 PCR 来扩增这些连接组。使用三个碱基对带来的额外复杂性将允许通过室温杂交来分析所提出的分析系统的产物。与单独使用天然 DNA 相比,这种分析将实现更高的复杂性和更好的区分度。目标是通过六碱基 PCR 简化和推进遗传分析技术,以降低成本并提高稳健性和准确性。如果这一点可以在该项目的第一阶段得到证实,那么其他化学物质应该受益于六碱基 PCR 系统,包括适体生产和 DNA 标记策略。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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