Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
基本信息
- 批准号:9751071
- 负责人:
- 金额:$ 82.16万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2017
- 资助国家:美国
- 起止时间:2017-08-01 至 2022-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:19qAccountingAddressAdultAdult GliomaAgeAmericanArchivesB-LymphocytesBioinformaticsBiologicalBiological AssayBloodBlood CellsBlood specimenBone MarrowCD8-Positive T-LymphocytesCellsChildClassificationClassification SchemeClinicCorrelation StudiesDNADNA MethylationDataDevelopmentDiagnosisDiagnosticDisease ProgressionElementsEnvironmentEpidemiologyEpigenetic ProcessExclusionFingerprintFluorescence-Activated Cell SortingFoundationsFutureGene MutationGenerationsGliomaGliomagenesisGoalsHeartHematopoiesisImmuneImmune System DiseasesImmune checkpoint inhibitorImmunityImmunologic FactorsImmunologic MarkersImmunologicsImmunophenotypingImmunosuppressionImmunosuppressive AgentsInflammationInheritedInterventionLeukocytesLibrariesLymphocyteMalignant NeoplasmsMalignant neoplasm of brainMeasuresMedicineMethylationMolecularMolecular GeneticsMutationMyelogenousMyeloid-derived suppressor cellsMyelopoiesisParaffin EmbeddingPatient-Focused OutcomesPatientsPeripheralPopulationPredictive ValueProductionPrognostic FactorPrognostic MarkerProtocols documentationResourcesRiskRisk FactorsRoleSan FranciscoSignal TransductionStratificationSuppressor-Effector T-LymphocytesTechniquesTechnologyTestingThe Cancer Genome AtlasTherapeuticTimeTreatment outcomeTumor MarkersVaccinesVariantbasecancer biomarkerscancer immunotherapycancer sitecancer therapycell typeclinical decision-makingcost effectiveepigenetic markerflexibilitygenome wide methylationgranulocyteimmunological statusimprovedin vitro Modelinnovationmethylomemonocyteneutrophilnovel markeroutcome forecastpatient populationperipheral bloodpersonalized cancer therapyprognostic valueprogramspromoterpublic health relevanceresponsesuccesssurvival predictiontooltumortumor DNAtumor microenvironmentyears of life lost
项目摘要
Project Summary/Abstract
Gliomas are devastating central nervous tumors that are associated with an immunosuppressive
network impacting the tumor microenvironment, bone marrow and the peripheral blood
compartments. The development of novel biomarkers of cancer immunity have not kept pace with
breakthroughs in our understanding of cancer-associated inflammation and its relationship with
abnormal hematopoiesis and the production of myeloid related suppressor cells (MDSC). This gap in
our understanding is a recognized high priority in the new era of cancer immunotherapy. The Cancer
Moonshot blue ribbon panel recommended as a key actionable goal “to develop approaches to
overcome an obstructive, immune-suppressive tumor environment in both children and adults”. Our
project addresses this important goal by developing and testing a highly innovative approach for
measuring immunosuppression in glioma patients. In Aim 1 we will augment our validated epigenetic
bioinformatic approach for leukocyte profiles to include both granulocytic and monocytic MDSCs. We
use specific DNA methylation changes as quantitative markers of immune cell types. In Aim 2 we will
then assess the predictive value of methylation generated immune profiles (CD4, CD8, T-cells, B-
cells, NK, monocytes, neutrophils, gMDSC, mMDSC) in glioma patient progression and survival.
Patients will be carefully selected from the UCSF Adult Glioma Study to represent key molecular
genetic subtypes of glioma using three diagnostic gene mutations (IDH, TERT, 1p19q deletion). We
then will validate the blood immune profiles in an independent population of glioma patients from the
Mayo Clinic. We will also augment Aim 2 by oversampling an uncommon and poorly understood
subset of glioma patients whose tumors do not contain any of the three cardinal mutations (i.e. triple
negative glioma). To explore the relationship of blood and tumor immune profiles we will apply
genome wide methylation assay to tumors in Aim 3 from patients with matched blood samples from
UCSF. We will then replicate tumor blood correlations within the Mayo Clinic patient population. This
comprehensive program will develop new tools to characterize the destructive immune suppression in
glioma patients. Our epigenetic immune approach is highly flexible and cost effective and will provide
a major advance for evaluating immune factors in glioma treatment and outcomes.
项目概要/摘要
神经胶质瘤是一种破坏性中枢神经肿瘤,与免疫抑制相关
影响肿瘤微环境、骨髓和外周血的网络
癌症免疫的新型生物标志物的发展尚未跟上。
我们对癌症相关炎症及其与癌症的关系的理解取得了突破
造血异常和骨髓相关抑制细胞(MDSC)的产生存在这种差距。
我们的理解是癌症免疫治疗新时代公认的高度优先事项。
登月蓝带小组被推荐为一个关键的可行目标“开发方法
克服儿童和成人的阻塞性、免疫抑制性肿瘤环境”。
项目通过开发和测试高度创新的方法来实现这一重要目标
在目标 1 中,我们将增强经过验证的表观遗传学测量神经胶质瘤患者的免疫抑制。
白细胞谱的生物信息学方法包括粒细胞和单核细胞 MDSC。
在目标 2 中,我们将使用特定的 DNA 甲基化变化作为免疫细胞类型的定量标记。
然后评估甲基化产生的免疫谱(CD4、CD8、T 细胞、B-
细胞、NK、单核细胞、中性粒细胞、gMDSC、mMDSC)在神经胶质瘤患者进展和生存中的作用。
患者将从 UCSF 成人神经胶质瘤研究中精心挑选,以代表关键分子
使用三种诊断基因突变(IDH、TERT、1p19q 缺失)确定神经胶质瘤的遗传亚型。
然后将验证来自独立神经胶质瘤患者群体的血液免疫特征
我们还将通过对不常见且知之甚少的情况进行过采样来增强 Aim 2。
胶质瘤患者的子集,其肿瘤不包含任何三种主要突变(即三重突变)
为了探索血液和肿瘤免疫谱的关系,我们将应用它。
对 Aim 3 中的肿瘤进行全基因组甲基化分析,该分析来自具有匹配血液样本的患者
然后,我们将在 UCSF 患者群体中复制肿瘤血液相关性。
综合计划将开发新工具来表征破坏性免疫抑制
我们的表观遗传免疫方法高度灵活且具有成本效益,并将提供
评估神经胶质瘤治疗和结果中免疫因素的重大进展。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
John K. Wiencke其他文献
John K. Wiencke的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('John K. Wiencke', 18)}}的其他基金
Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
- 批准号:
10224109 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
- 批准号:
9982213 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7934298 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7523958 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
8115135 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
8278519 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
8461813 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7645800 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7848862 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
相似国自然基金
套期会计有效性的研究:实证检验及影响机制
- 批准号:72302225
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
上市公司所得税会计信息公开披露的经济后果研究——基于“会计利润与所得税费用调整过程”披露的检验
- 批准号:72372025
- 批准年份:2023
- 资助金额:40 万元
- 项目类别:面上项目
全生命周期视域的会计师事务所分所一体化治理与审计风险控制研究
- 批准号:72372064
- 批准年份:2023
- 资助金额:40 万元
- 项目类别:面上项目
兔死狐悲——会计师事务所同侪CPA死亡的审计经济后果研究
- 批准号:72302197
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
环境治理目标下的公司财务、会计和审计行为研究
- 批准号:72332003
- 批准年份:2023
- 资助金额:166 万元
- 项目类别:重点项目
相似海外基金
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
10472504 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
10226954 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
10675604 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
9759883 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别:
Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
- 批准号:
10224109 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 82.16万 - 项目类别: