Functional analysis of autism risk genes during neural development using single cell seq

使用单细胞测序对神经发育过程中自闭症风险基因进行功能分析

基本信息

  • 批准号:
    9765793
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 62.25万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2019
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2019-03-15 至 2024-01-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The brain represents a complex organ with a myriad of functionally diverse cell types. Autism spectrum disorder (ASD) is thought to alter the combinatorial transcriptional and post-transcriptional code responsible for specifying and maintaining different cell functions in the vertebrate brain. The proposed studies will test the central hypothesis that chromatin/transcriptional regulators identified as ASD risk genes act as developmental switches during early neurodevelopment, altering the gene expression network and subsequent cell function. In this proposal we combine single cell sequencing, with genetic, genomic and computational approaches in zebrafish and embryoid bodies to i) characterize the role of ASD-risk genes in healthy neural gene regulatory networks (Aim 1); 2) Interrogate the effects of ASD loss-of-function (LOF) mutations in different neural lineages (Aim 2). Cell types and developmental lineages within the brain that are more significantly affected by each candidate ASD risk gene will be identified using zebrafish and human cell–derived organoids. The experiments outlined in this proposal have the ultimate goal of identifying how ADS risk genes affect neural gene expression and cell function during vertebrate development.
大脑代表具有无数功能潜水的复杂器官 细胞类型。自闭症谱系障碍(ASD)被认为改变了组合 转录和转录后代码负责指定和 在脊椎动物大脑中保持不同的细胞功能。提出的研究 将检验染色质/转录调节剂鉴定的中心假设 由于ASD风险基因在早期起发育转换的起作用 神经发育,改变基因表达网络和随后的细胞 功能。 在此提案中,我们将单细胞测序与遗传,基因组结合在一起 斑马鱼和胚胎体的计算方法至I) 表征ASD风险基因在健康神经基因调节中的作用 网络(AIM 1); 2)询问ASD功能丧失(LOF)的影响 不同神经谱系中的突变(AIM 2)。细胞类型和发育 大脑内部的谱系受到每个候选者的影响更大 ASD风险基因将使用斑马鱼和人类细胞衍生 器官。 该提案中概述的实验的最终目标是 确定ADS风险基因如何影响神经元基因表达和细胞功能 在脊椎动物发育期间。

项目成果

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