Class switch recombination during early B cell development
早期 B 细胞发育过程中的类别转换重组
基本信息
- 批准号:8594576
- 负责人:
- 金额:$ 22.49万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2013
- 资助国家:美国
- 起止时间:2013-05-24 至 2015-04-30
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:AccountingAffinityAnti-Bacterial AgentsAntibodiesAutoimmune DiseasesAutoimmunityB-Cell DevelopmentB-LymphocytesBacterial InfectionsBiological AssayBone MarrowBreedingCell LineCell OntogenyCellsChromosomal translocationDataDevelopmentExonsFrequenciesFutureGene ExpressionGene MutationGene RearrangementGenesHelminthsHumanHumoral ImmunitiesIL7 geneIgEImmuneImmune responseImmunoglobulin Class SwitchingImmunoglobulin GenesImmunoglobulin IsotypesImmunoglobulin MImmunoglobulin Somatic HypermutationImmunoglobulin Switch RecombinationImmunoglobulinsImmunologic Deficiency SyndromesIn VitroInfectionInjection of therapeutic agentLaboratoriesLymphoidMature B-LymphocyteMediatingMusOrganParasitic infectionPhasePhenotypePlayProcessProductionRag1 MouseRegulationReporterRoleSecondary toSeriesShapesStagingStructureStructure of germinal center of lymph nodeTestingTimeTranscriptTransformed Cell LineV(D)J Recombinationactivation-induced cytidine deaminaseantigen bindingbasecongenital immunodeficiencydesignexperiencein vivoinsightleukemia/lymphomaprogramspublic health relevancerecombinaseresponsetooltumorigenesis
项目摘要
DESCRIPTION (provided by applicant): Immunoglobulin (Ig) genes are unique in that they are subject to three different types of gene alterations to achieve a fully functional humoral immune response. During early B cell development in the bone marrow (BM), V(D)J or VJ joining occurs on the IgH and L chain genes, respectively and is mediated by the RAG recombinase. Following exit from the bone marrow, B cells migrate to the secondary lymphoid organs where they undergo somatic hypermutation (SHM) and class switch recombination (CSR) that is initiated in both cases by activation induced deaminase (AID). Current paradigms describe a strict partition VDJ recombination to the BM and CSR and SHM to the secondary lymphoid organs. However, several lines of evidence have emerged over time suggesting that CSR and SHM can occur at low frequency at very early stages of B cell ontogeny. We have developed new data showing that robust CSR can be induced in Rag1-/- or Mb1-/- pro-B cells in ex vivo cultures expanded with IL7 and in vivo following injection of mice with LPS. We observe that in pro-B cells prior to VDJ or VJ joining, CSR inducers can stimulate the expression of AID and germline transcripts that are critically required for CSR. We find that CSR can be induced in a series of Abelson transformed cell lines followed by the induction of VDJ joining, thereby providing important tools to better analyze these observations. Strikingly, we find that AID and Rag gene expression can overlap which may account for the bulk of pro-B and pre-B cell chromosomal translocations in human leukemias and lymphomas. Based on these intriguing new studies we propose to more fully characterize CSR during early B cell development. We have carried out in vitro studies and show directly that VDJ joining can occur in CSR experienced cells using Abelson cell lines. We propose to determine whether secondary Ig isotypes detected in the ¿MT mouse may derive from CSR in bone marrow pro-B cells. The in vivo frequency of AID+ and IgE+ pro-B cells induced in Rag1-/- or Mb1-/- pro- B cells will be determined using two mouse reporter strains. Enrichment of AID+-EYFP pro-B cells will enable us to characterize CSR and to determine whether VDJ repertoires are selected in this process. Finally we will determine whether Igh-myc junction fragments associated with high frequency T12;15 translocations in mature B cells are detectable in AID+ pro-B cells. These studies will form the basis for new insights regarding development of humoral immunity and early B cell oncogenesis.
描述(由申请人提供):免疫球蛋白 (Ig) 基因的独特之处在于,它们会经历三种不同类型的基因改变,以在骨髓 (BM) 中的早期 B 细胞发育过程中实现功能齐全的体液免疫反应。 D)J 或 VJ 连接分别发生在 IgH 和 L 链基因上,并由 RAG 重组酶介导,从骨髓中退出后,B 细胞迁移至次级淋巴器官并在那里进行连接。在这两种情况下,体细胞超突变(SHM)和类别转换重组(CSR)都是由激活诱导脱氨酶(AID)启动的,目前的范例描述了对BM和CSR和SHM对次级淋巴器官的严格分区重组。随着时间的推移,一系列证据表明 CSR 和 SHM 可以在 B 细胞个体发育的早期阶段以较低的频率发生。我们已经开发出新的数据,表明可以在 Rag1-/- 中诱导强大的 CSR。或 Mb1-/- pro-B 细胞在体外培养物中用 IL7 扩增,并在小鼠注射 LPS 后体内扩增。我们观察到,在加入 VDJ 或 VJ 之前的 pro-B 细胞中,CSR 诱导剂可以刺激 AID 和我们发现 CSR 可以在一系列 Abelson 转化细胞系中被诱导,然后诱导 VDJ 连接,从而为更好地分析这些观察结果提供了重要的工具。 Rag 和 Rag 基因表达可能重叠,这可能是人类白血病和淋巴瘤中 B 细胞前体和前 B 细胞染色体易位的原因。基于这些有趣的新研究,我们建议更全面地描述早期 B 细胞发育过程中的 CSR。进行了体外研究,并直接表明,使用 Abelson 细胞系,VDJ 连接可以发生在经历过 CSR 的细胞中。我们建议确定是否在 ¿ 中检测到次级 Ig 同种型。 MT 小鼠可能源自骨髓 pro-B 细胞中的 CSR。在 Rag1-/- 或 Mb1-/- pro-B 细胞中诱导的 AID+ 和 IgE+ pro-B 细胞的体内频率将使用两种小鼠报告品系来确定。 AID+-EYFP pro-B 细胞的富集将使我们能够表征 CSR 并确定在此过程中是否选择了 VDJ 库。最后,我们将确定 Igh-myc 连接片段是否与高频相关。在 AID+ pro-B 细胞中可检测到成熟 B 细胞中的 T12;15 易位,这些研究将为有关体液免疫发展和早期 B 细胞肿瘤发生的新见解奠定基础。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Amy L Kenter其他文献
Amy L Kenter的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Amy L Kenter', 18)}}的其他基金
Impact of novel enhancers on Igh repertoire diversity
新型增强子对 Igh 库多样性的影响
- 批准号:
10716628 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Igh locus function in immunosenescent mice
免疫衰老小鼠中的 Igh 基因座功能
- 批准号:
10427437 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Igh locus function in immunosenescent mice
免疫衰老小鼠中的 Igh 基因座功能
- 批准号:
10303603 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Characterization of chromatin loops responsible for Igh locus contraction
负责 Igh 基因座收缩的染色质环的表征
- 批准号:
8873312 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Role of MBD4 in double strand break formation during class switch recombination
MBD4 在类别转换重组过程中双链断裂形成中的作用
- 批准号:
8702378 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Class switch recombination during early B cell development
早期 B 细胞发育过程中的类别转换重组
- 批准号:
8664344 - 财政年份:2013
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Lymphocytes/Immune System:Cellular/Interactive Mechanism
淋巴细胞/免疫系统:细胞/相互作用机制
- 批准号:
7000871 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Factors and DNA Motifs in Ig Class Switch
Ig 类别转换中的因素和 DNA 基序
- 批准号:
7533006 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
相似国自然基金
抗原非特异性B细胞进入生发中心并实现亲和力成熟的潜力与调控机制
- 批准号:32370941
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
基于胞内蛋白亲和力标记策略进行新型抗类风湿性关节炎的选择性OGG1小分子抑制剂的发现
- 批准号:82304698
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
面向免疫疗法标志物识别的基于多特征融合的肽与MHC亲和力预测研究
- 批准号:62302277
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于计算生物学技术小分子农兽药残留物驼源单域抗体虚拟筛选与亲和力成熟 -以内蒙古阿拉善双峰驼为例
- 批准号:32360190
- 批准年份:2023
- 资助金额:34 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
DNA四面体限域辅助的高亲和力铅笔芯微电极用于早期癌症精准诊断研究
- 批准号:22304062
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
Mechanistic Studies of Polyketide Synthases Enabled by Unnatural Amino Acids and Antibody Fragment Structural Tools
非天然氨基酸和抗体片段结构工具实现的聚酮化合物合成酶的机理研究
- 批准号:
10448409 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Mechanistic Studies of Polyketide Synthases Enabled by Unnatural Amino Acids and Antibody Fragment Structural Tools
非天然氨基酸和抗体片段结构工具实现的聚酮化合物合成酶的机理研究
- 批准号:
10227676 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Development of Novel Resistance-Modifying Agents for MRSA
新型抗 MRSA 耐药剂的开发
- 批准号:
9020557 - 财政年份:2015
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Class switch recombination during early B cell development
早期 B 细胞发育过程中的类别转换重组
- 批准号:
8664344 - 财政年份:2013
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别:
Tuning aminoglycosides for treatment of genetic diseases
调整氨基糖苷类药物治疗遗传病
- 批准号:
8107761 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 22.49万 - 项目类别: