Development of an Immunostimulatory Small Molecule Library

免疫刺激小分子库的开发

基本信息

项目摘要

Chronic inflammatory diseases such as asthma, rheumatoid arthritis, and Crohn's disease are thought to arise from an inappropriate immune response. In addition, a variety of types of cancers including gastric, colon and lung arise due to chronic inflammation. The innate immune system's interaction with bacteria is critical to these diseases. It has been shown that fragments of bacterial cell wall activate an innate immune response. The bacterial cell wall is a polymer of carbohydrates. The discrete structures of the activating fragments of bacterial cell wah are not known. In order to better understand the molecular basis of immunological diseases it is critical that a collection of well-defined carbohydrate probes be assembled. In this subproject, we propose to establish a library of structural defined carbohydrates derived from bacterial cell wall to identify small molecule probes ofthe innate immune response. We will use two different methods to produce the carbohydrate libraries: (1) chemical synthesis and (2) bioengineering of bacterial cell wall biosynthesis. We will then screen these libraries in our own laboratory to identify members that have immuno-stimulatory or immuno-inhibitory activity. In addition, we will print these libraries as microarrays so that we may probe for protein interactions. The microarray format will make it easy for us to distribute our libraries to other investigators. In addition, we will use the bacterial cell wall libraries to screen for novel biomarkers associated with Crohn's disease. This project takes a unique approach to addressing major problems in the field of innate immunity through the combination of chemical synthesis, bacterial bioengineering, molecular biology, biochemistry and our knowledge of innate immune signaling. The probes that are developed in this subproject will be useful in the development of new therapeutics for the treatment of inflammatory disorders.
哮喘、类风湿性关节炎和克罗恩病等慢性炎症性疾病被认为是由不适当的免疫反应引起的。此外,多种类型的癌症,包括胃癌、结肠癌和肺癌,都是由于慢性炎症而产生的。先天免疫系统与细菌的相互作用对于这些疾病至关重要。研究表明,细菌细胞壁碎片可激活先天免疫反应。细菌细胞壁是碳水化合物的聚合物。细菌细胞wah激活片段的离散结构尚不清楚。为了更好地了解免疫疾病的分子基础,组装一组明确的碳水化合物探针至关重要。在这个子项目中,我们建议建立一个源自细菌细胞壁的结构明确的碳水化合物库,以识别先天免疫反应的小分子探针。我们将使用两种不同的方法来产生碳水化合物库:(1)化学合成和(2)细菌细胞壁生物合成的生物工程。然后,我们将在我们自己的实验室中筛选这些文库,以识别具有免疫刺激或免疫抑制活性的成员。此外,我们将把这些文库打印为微阵列,以便我们可以探测蛋白质相互作用。微阵列格式将使我们能够轻松地将我们的文库分发给其他研究人员。此外,我们将使用细菌细胞壁文库来筛选与克罗恩病相关的新型生物标志物。该项目采用独特的方法来解决主要问题 通过结合化学合成、细菌生物工程、分子生物学、生物化学和我们对先天免疫信号传导的知识来解决先天免疫领域的问题。探头 该子项目中开发的技术将有助于开发治疗炎症性疾病的新疗法。

项目成果

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