Use of Endophenotypes in the Search for Alzheimer's Disease Risk Genes

利用内表型寻找阿尔茨海默病风险基因

基本信息

  • 批准号:
    8311728
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 56.62万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2010
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2010-09-01 至 2015-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

DESCRIPTION (provided by applicant): Several genome-wide association studies (GWAS) for late-onset Alzheimer's disease (LOAD) have now been published. While all of these studies detected the association of APOE 54 with risk for LOAD only the two largest studies, with over 10,000 cases and controls provided genome-wide significant evidence for any novel loci. To develop larger datasets we and others have formed large collaborative groups, such as the Alzheimer's Disease Genetics Consortium (ADGC). We have also developed an innovative program using cerebrospinal fluid biomarker levels as endophenotypes for our genetic studies of LOAD. Our preliminary data demonstrate the power and novelty of this approach in identifying genes that alter biomarker levels and modify LOAD risk, age at onset or rate of disease progression. This endophenotype approach also has the advantage of pin-pointing specific biological hypotheses regarding the effects of associated variants that can be tested using simple cell culture assays. The goal of this proposal is to combine and analyze existing LOAD GWAS data, then use a novel approach that incorporates quantitative intermediate traits, re-sequencing, bioinformatics, expression and functional studies to facilitate the identification and characterization of genetic variants that modulate risk for LOAD, age at onset or rate of disease progression. To accomplish this we will 1) combine and analyze LOAD GWAS data, 2) use a novel method, the Genomic Information Network, to systematically incorporate biological information to prioritize single nucleotide polymorphisms (SNPs) for follow-up, 3) examine top SNPs from the LOAD GWAS for association with cerebrospinal fluid amyloid-beta and tau levels to establish specific hypotheses of mechanism, 4) use novel genetic and bioinformatic methods to identify putative causal variants from the replicated SNPs, 5) use re-sequencing to identify novel variants in the regions surrounding replicated SNPs, 6) examine the top hits for effects on gene expression. Finally, we will use information from these efforts to test specific amyloid-beta or tau related hypotheses for replicated SNPs in cell culture models. This proposal combines the unique resources and skills of our research team with the vast wealth of publicly available resources into a novel approach to the identification and characterization of genetic risk factors for LOAD. PUBLIC HEALTH RELEVANCE: Alzheimer's disease is a very common neurodegenerative disease with no effective means of prevention or treatment. The goal of the present study is to identify genetic risk factors for Alzheimer's disease, which in the longer term may lead to novel drug targets and improved treatment/prevention of the disease.
描述(由申请人提供):现已发表了几项针对晚期阿尔茨海默氏病(负载)的全基因组关联研究(GWAS)。尽管所有这些研究都检测到APOE 54与载荷的风险仅相关的两项最大研究的风险,而超过10,000例病例和对照为所有新型基因座提供了全基因组的重要证据。为了开发较大的数据集,我们和其他人组成了大型协作群体,例如阿尔茨海默氏病遗传学联盟(ADGC)。我们还使用脑脊液生物标志物水平作为我们的负载遗传研究的内型型开发了一个创新的程序。我们的初步数据证明了这种方法在识别改变生物标志物水平并改变载荷风险,发作时年龄或疾病进展速率的基因的能力和新颖性。这种内表型方法还具有针对可以使用简单的细胞培养分析测试的相关变体的影响的针对特定的生物学假设的优点。该提案的目的是结合和分析现有的负载GWAS数据,然后使用一种新型方法,该方法结合了定量性中间性状,重新序列,生物信息学,表达和功能研究来促进遗传变异的识别和表征,从而调节疾病的疾病的风险,年龄或疾病进展。为此,我们将1)结合和分析负载GWAS数据,2)使用一种新方法,基因组信息网络,系统地结合生物学信息,以优先考虑单个核苷酸多态性(SNP),以进行随访,以进行后续研究,3)检查与脑脊髓液体级别相关的载荷量的高负gaus and taue and taue级别,以建立特定的beta和taue级别,以建立特定的bete级tau级和taue级的含量。生物信息学方法可以从复制的SNP中识别推定的因果变体,5)使用重新测序来识别复制的SNP周围地区的新型变体,6)检查最高命中是否对基因表达的影响。最后,我们将使用这些努力中的信息来测试细胞培养模型中复制SNP的特定淀粉样蛋白β或与TAU相关的假设。该建议将我们研究团队的独特资源和技能与大量公开资源结合在一起,成为一种新颖的方法,以识别和表征负载遗传风险因素。 公共卫生相关性:阿尔茨海默氏病是一种非常普遍的神经退行性疾病,没有有效的预防手段或治疗手段。本研究的目的是确定阿尔茨海默氏病的遗传危险因素,从长远来看,这可能导致新颖的药物靶标并改善治疗/预防疾病。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

ALISON M GOATE其他文献

ALISON M GOATE的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('ALISON M GOATE', 18)}}的其他基金

Neuroprotective signaling and transcriptional pathways in microglia associated with Alzheimer's disease
与阿尔茨海默病相关的小胶质细胞的神经保护信号传导和转录途径
  • 批准号:
    10552538
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
2022 Neurobiology of Brain Disorders GRC and GRS
2022年脑部疾病神经生物学GRC和GRS
  • 批准号:
    10468475
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Neuroprotective signaling and transcriptional pathways in microglia associated with Alzheimer's disease
与阿尔茨海默病相关的小胶质细胞的神经保护信号传导和转录途径
  • 批准号:
    10301271
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Genetic modifiers of APOE-related risk for AD
APOE 相关 AD 风险的基因修饰
  • 批准号:
    10667481
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Project 1: Determination of molecular differences caused by tauopathy-associated H1 and H2 haplotypes
项目 1:确定 tau 蛋白病相关 H1 和 H2 单倍型引起的分子差异
  • 批准号:
    10295517
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Biology and pathobiology of apoE in aging and Alzheimer's disease
apoE 在衰老和阿尔茨海默病中的生物学和病理学
  • 批准号:
    10407934
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Core A: Administrative
核心A:行政
  • 批准号:
    10295513
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Biology and pathobiology of apoE in aging and Alzheimer's disease
apoE 在衰老和阿尔茨海默病中的生物学和病理学
  • 批准号:
    10667435
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Genetic modifiers of APOE-related risk for AD
APOE 相关 AD 风险的基因修饰
  • 批准号:
    10407948
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Development of PU.1 Inhibitory Modulators as Novel Therapeutics for Alzheimer's Disease
开发 PU.1 抑制调节剂作为阿尔茨海默病的新疗法
  • 批准号:
    10159826
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:

相似国自然基金

无线供能边缘网络中基于信息年龄的能量与数据协同调度算法研究
  • 批准号:
    62372118
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
CHCHD2在年龄相关肝脏胆固醇代谢紊乱中的作用及机制
  • 批准号:
    82300679
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
颗粒细胞棕榈酰化蛋白FXR1靶向CX43mRNA在年龄相关卵母细胞质量下降中的机制研究
  • 批准号:
    82301784
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
年龄相关性黄斑变性治疗中双靶向药物递释策略及其机制研究
  • 批准号:
    82301217
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
多氯联苯与机体交互作用对生物学年龄的影响及在衰老中的作用机制
  • 批准号:
    82373667
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

The Influence of Lifetime Occupational Experience on Cognitive Trajectories Among Mexican Older Adults
终生职业经历对墨西哥老年人认知轨迹的影响
  • 批准号:
    10748606
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
The Proactive and Reactive Neuromechanics of Instability in Aging and Dementia with Lewy Bodies
衰老和路易体痴呆中不稳定的主动和反应神经力学
  • 批准号:
    10749539
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Fluency from Flesh to Filament: Collation, Representation, and Analysis of Multi-Scale Neuroimaging data to Characterize and Diagnose Alzheimer's Disease
从肉体到细丝的流畅性:多尺度神经影像数据的整理、表示和分析,以表征和诊断阿尔茨海默病
  • 批准号:
    10462257
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Project 3: 3-D Molecular Atlas of cerebral amyloid angiopathy in the aging brain with and without co-pathology
项目 3:有或没有共同病理的衰老大脑中脑淀粉样血管病的 3-D 分子图谱
  • 批准号:
    10555899
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
Sustained eIF5A hypusination at the core of brain metabolic dysfunction in TDP-43 proteinopathies
持续的 eIF5A 抑制是 TDP-43 蛋白病脑代谢功能障碍的核心
  • 批准号:
    10557547
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 56.62万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了