Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer

前列腺癌中的细胞特异性表达特征

基本信息

项目摘要

DESCRIPTION (provided by applicant): We hypothesize that prostate cancer (CaP) associated gene expression signatures in specific cell types of the human prostate gland will define the pathobiology of epithelial and stromal components in prostate tumorigenesis, and a subset of these genes may predict the aggressive form of the disease. The objective of this proposal is to perform comparative genomics analyses on laser capture micro-dissected (LCM)- epithelial and stromal cells from prostate glands of carefully selected CaP patients and define gene clusters predictive of non-aggressive or aggressive form of the disease. Our experience with the gene expression analysis of LCM-epithelial cell RNAs, promising preliminary GeneChip data from LCM-epithelial cell RNAs, and development of a LCM DNA/RNA bank from CaP patients provide the basis for following specific aims proposed here. Aim 1: Identify CaP associated epithelial cells specific gene expression patterns: GeneChip defined expression patterns in paired normal and cancer epithelial cells from two CaP patient groups, one with "aggressive CaP" (PSA recurrence, Gleason score 8-9, T3c stage, seminal vesicle invasion, poor tumor differentiation) and the other with "non-aggressive CAP" (no PSA recurrence, Gleason score 6-7, T2a-T3b stage, no seminal vesicle invasion, well or moderate tumor differentiation), will be analyzed for CaP specific expression signatures. Emphasis will be placed on the gene clusters that define "aggressive CAP". Aim 2: Identify CaP associated stromal cells specific gene expression patterns: Using similar strategy and same cohort of patients as for Aim1, CaP associated stromal cells specific gene expression patterns will be defined and emphasis will be placed on gene clusters associated with aggressive CaP. Aim 3: Validation of "Aggressive CAP" associated epithelial or stromal cells specific genes: A panel of "aggressive CAP" associated genes will be analyzed in a large cohort of patients by tissue microarray and/or quantitative real time PCR assay and its predictive value will be established. Significance: Epithelial or stromal cells specific gene expression patterns characteristics of CaP with potential roles in pathobiology will be defined. Gene clusters predictive of aggressive CaP has potential in: (1) providing novel modalities in the future clinical management of CaP; and (2) in identification of novel therapeutic targets for aggressive CaP.
描述(由申请人提供):我们假设人类前列腺特定细胞类型中的前列腺癌(CaP)相关基因表达特征将定义前列腺肿瘤发生中上皮和基质成分的病理生物学,并且这些基因的子集可以预测该疾病的侵袭性形式。该提案的目的是对精心挑选的 CaP 患者的前列腺上皮细胞和基质细胞进行激光捕获显微切割 (LCM) 进行比较基因组学分析,并定义预测该疾病的非侵袭性或侵袭性形式的基因簇。我们在 LCM 上皮细胞 RNA 基因表达分析方面的经验、来自 LCM 上皮细胞 RNA 的初步 GeneChip 数据以及 CaP 患者 LCM DNA/RNA 库的开发为本文提出的以下具体目标提供了基础。目标 1:识别 CaP 相关上皮细胞特异性基因表达模式:GeneChip 定义了来自两个 CaP 患者组的配对正常和癌症上皮细胞的表达模式,其中一组为“侵袭性 CaP”(PSA 复发、格里森评分 8-9、T3c 阶段、精液)囊泡侵犯,肿瘤分化差),另一个为“非侵袭性 CAP”(无 PSA 复发,格里森评分 6-7,T2a-T3b 分期,无精囊侵犯、良好或中等肿瘤分化),将分析 CaP 特异性表达特征。重点将放在定义“攻击性 CAP”的基因簇上。目标 2:识别 CaP 相关基质细胞特定基因表达模式:使用与 Aim1 类似的策略和相同的患者队列,将定义 CaP 相关基质细胞特定基因表达模式,并将重点放在与侵袭性 CaP 相关的基因簇上。目标 3:验证“侵袭性 CAP”相关上皮或基质细胞特异性基因:将通过组织微阵列和/或定量实时 PCR 测定在一大群患者中分析一组“侵袭性 CAP”相关基因及其预测值将成立。意义:将定义上皮细胞或基质细胞特定的 CaP 基因表达模式特征以及在病理生物学中的潜在作用。预测侵袭性 CaP 的基因簇具有以下潜力:(1) 为未来 CaP 的临床管理提供新的模式; (2) 确定侵袭性 CaP 的新治疗靶点。

项目成果

期刊论文数量(22)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Non-Coding RNAs in Castration-Resistant Prostate Cancer: Regulation of Androgen Receptor Signaling and Cancer Metabolism.
ERG Tumor Type is Less Frequent in High Grade and High Stage Prostate Cancers of Chinese Men.
ERG 肿瘤类型在中国男性的高级和晚期前列腺癌中较少见。
  • DOI:
    10.7150/jca.30025
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Baohong,Jiang;Sedarsky,Jason;Srivastava,Shiv;Sesterhenn,Isabell;Dobi,Albert;Quanlin,Li
  • 通讯作者:
    Quanlin,Li
Ets family protein, erg expression in developing and adult mouse tissues by a highly specific monoclonal antibody.
  • DOI:
    10.7150/jca.1.197
  • 发表时间:
    2010-10-25
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Mohamed AA;Tan SH;Mikhalkevich N;Ponniah S;Vasioukhin V;Bieberich CJ;Sesterhenn IA;Dobi A;Srivastava S;Sreenath TL
  • 通讯作者:
    Sreenath TL
Do patients with low volume prostate cancer have prostate specific antigen recurrence following radical prostatectomy?
  • DOI:
    10.1136/jcp.2008.057794
  • 发表时间:
    2008-09-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Furusato, B.;Rosner, I. L.;McLeod, D. G.
  • 通讯作者:
    McLeod, D. G.
Clinical Validation of a Serum Protein Panel (FLNA, FLNB and KRT19) for Diagnosis of Prostate Cancer.
  • DOI:
    10.4172/2155-9929.1000323
  • 发表时间:
    2017-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ravipaty, Shobha;Wu, Wenfang;Akmaev, Viatcheslav R
  • 通讯作者:
    Akmaev, Viatcheslav R
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

SHIV SRIVASTAVA其他文献

SHIV SRIVASTAVA的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('SHIV SRIVASTAVA', 18)}}的其他基金

PMEPA1 Function and Expression in Prostate Cancer
PMEPA1 在前列腺癌中的功能和表达
  • 批准号:
    7031114
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
PMEPA1 Function and Expression in Prostate Cancer
PMEPA1 在前列腺癌中的功能和表达
  • 批准号:
    7250261
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
PMEPA1 Function and Expression in Prostate Cancer
PMEPA1 在前列腺癌中的功能和表达
  • 批准号:
    7430381
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer
前列腺癌中的细胞特异性表达特征
  • 批准号:
    7030213
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer (RO1 DK065977)
前列腺癌中的细胞特异性表达特征 (RO1 DK065977)
  • 批准号:
    8186840
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer (RO1 DK065977)
前列腺癌中的细胞特异性表达特征 (RO1 DK065977)
  • 批准号:
    8304925
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer (RO1 DK065977)
前列腺癌中的细胞特异性表达特征 (RO1 DK065977)
  • 批准号:
    8477942
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer
前列腺癌中的细胞特异性表达特征
  • 批准号:
    6709669
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer
前列腺癌中的细胞特异性表达特征
  • 批准号:
    6872013
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Cell Specific Expression Signatures in Prostate Cancer (RO1 DK065977)
前列腺癌中的细胞特异性表达特征 (RO1 DK065977)
  • 批准号:
    8676475
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:

相似海外基金

Identity, function and control of Francisella effectors encoded outside its pathogenicity island
弗朗西斯菌致病岛外编码的效应子的身份、功能和控制
  • 批准号:
    10187513
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Identity, function and control of Francisella effectors encoded outside its pathogenicity island
弗朗西斯菌致病岛外编码的效应子的身份、功能和控制
  • 批准号:
    9796805
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Therapeutic implication of CD38 in CLL
CD38 在 CLL 中的治疗意义
  • 批准号:
    10228566
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Therapeutic implication of CD38 in CLL
CD38 在 CLL 中的治疗意义
  • 批准号:
    10683157
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
Therapeutic implication of CD38 in CLL
CD38 在 CLL 中的治疗意义
  • 批准号:
    9817310
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 16.62万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了