ENGINEERING OF ANTIDIGOXIN ANTIBODY COMBINING SITES
抗地高辛抗体结合位点的工程
基本信息
- 批准号:6043778
- 负责人:
- 金额:$ 34.68万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:1992
- 资助国家:美国
- 起止时间:1992-08-01 至 2001-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:X ray crystallography antibody specificity antibody titering antiidiotype antibody chemical binding computer simulation digoxin enzyme linked immunosorbent assay haptens immunogenetics laboratory mouse molecular cloning monoclonal antibody mutant protein engineering protein purification protein sequence protein structure function radioimmunoassay site directed mutagenesis
项目摘要
DESCRIPTION: The objective of this proposal is to modify antibody
combining sites in order to change affinity and specificity for
structurally related analogues. The model system consists of digoxin-
specific antibodies which are proven therapeutic agents for reversal of
digitalis toxicity. Monoclonal anti-digoxin antibodies display
exceptional affinity for their site-filling, relatively rigid
hydrophobic ligand, for which there are numerous analogues of known
stereochemistry for which anti-digoxin antibodies display varying
specificity. Studies of structure-function relationships and antigen
combining site engineering are made feasible by the existence of x-ray
crystallographic structures of two different anti-digoxin Fabs utilizing
entirely different variable region genes in complex with hapten, an
uncomplexed Fab, and a non-binding mutant Fab. The mutagenesis strategy
hinges upon the selection of antibodies of desired specificity from large
libraries of mutant Fab fragments displayed on filamentous bacteriophage.
The DNA from the two anti-digoxin Fabs is cloned into phage expression
vectors, and mutant Fabs with unique specificities obtained through
saturation mutagenesis of complementarity-determining regions (CDRs) and
framework segments are enriched by successive rounds of affinity
selections. Cloned mutants are sequenced, affinity and specificity for
digoxin analogues determined, and the sequence and binding data
interpreted in the context of crystal structure. The results are then
used for reiterative rounds of mutagenesis, employing, as appropriate,
random mutagenesis of entire V regions, site-directed mutagenesis, CDR
loop lengthening, and combinatorial mutagenesis involving different CDRs
and both chains. Systematic mutagenesis ex vivo provides opportunities
to attain specificity and affinity changes not constrained by the biases
of germline gene codons and the in vitro somatic mutation process.
Soluble Fabs of novel variants will be crystallized and structures
determined. A selective approach employing phage-displayed Fab
libraries not only promises insights into the structural basis of a
combining site complementarity, but represents a paradigm for
constructing antibodies of unique specificity, or antibodies for which
undesirable cross-reactivity is removed, for use in clinical
immunotherapy.
描述:该提议的目的是修改抗体
结合站点以改变亲和力和特异性
与结构相关的类似物。 模型系统由高辛 -
特定的抗体,这些抗体被证明是逆转的治疗剂
Digitalis毒性。 单克隆抗二氧抗体抗体显示
对其现场填充,相对僵化的特殊亲和力
疏水配体,有许多已知的类似物
立体化学的抗二高氧蛋白抗体显示不同
特异性。 结构功能关系和抗原的研究
X射线的存在使场地工程相结合是可行的
利用两种不同抗二高氧蛋白的晶体结构
与Hapten复合物中完全不同的变量区域基因,
未复杂的Fab和非结合突变型晶圆厂。 诱变策略
取决于从大的选择所需特异性的抗体
在丝状噬菌体上显示的突变型晶圆厂碎片的库。
将两个抗二氧蛋白晶圆厂的DNA克隆到噬菌体表达中
向量和具有独特特异性的突变型晶圆厂
互补性区域(CDR)和
框架段通过连续的亲和力丰富
选择。 克隆突变体是测序的,亲和力和特异性
地高辛类似物确定,序列和结合数据
在晶体结构的背景下进行解释。 结果是
用于诱变的重复性回合,适当地采用
整个V区域的随机诱变,位置定向诱变,CDR
循环延长和组合诱变涉及不同的CDR
和两个连锁店。 系统诱变后体内提供机会
达到特异性和亲和力变化不受偏见的约束
种系基因密码子和体外体细胞突变过程。
新型变体的可溶性晶圆厂将结晶并结构
决定。 采用噬菌体播放的晶圆厂的选择性方法
图书馆不仅承诺对一个结构基础的见解
结合场地互补性,但代表了
构建具有独特特异性或抗体的抗体
除去不良的交叉反应性,用于临床
免疫疗法。
项目成果
期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Aromatic residues mediate the pressure-induced association of digoxigenin and antibody 26-10.
芳香族残基介导压力诱导的地高辛和抗体 26-10 的结合。
- DOI:10.1016/s0301-4622(99)00139-8
- 发表时间:2000
- 期刊:
- 影响因子:3.8
- 作者:Roy,P;Roth,CM;Margolies,MN;Yarmush,ML
- 通讯作者:Yarmush,ML
Complementary combining site contact residue mutations of the anti-digoxin Fab 26-10 permit high affinity wild-type binding.
抗地高辛 Fab 26-10 的互补结合位点接触残基突变允许高亲和力野生型结合。
- DOI:10.1074/jbc.m110444200
- 发表时间:2002
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Short,MaryK;Krykbaev,RustemA;Jeffrey,PhilipD;Margolies,MichaelN
- 通讯作者:Margolies,MichaelN
Contribution of antibody heavy chain CDR1 to digoxin binding analyzed by random mutagenesis of phage-displayed Fab 26-10.
通过噬菌体展示的 Fab 26-10 的随机诱变分析抗体重链 CDR1 对地高辛结合的贡献。
- DOI:10.1074/jbc.270.48.28541
- 发表时间:1995
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Short,MK;Jeffrey,PD;Kwong,RF;Margolies,MN
- 通讯作者:Margolies,MN
An approach for preventing recombination-deletion of the 40-50 anti-digoxin antibody V(H) gene from the phage display vector pComb3.
一种防止噬菌体展示载体 pComb3 中 40-50 抗地高辛抗体 V(H) 基因重组删除的方法。
- DOI:10.1016/s0378-1119(99)00462-x
- 发表时间:2000
- 期刊:
- 影响因子:3.5
- 作者:Kim,SH;Titlow,CC;Margolies,MN
- 通讯作者:Margolies,MN
Identification of a model cardiac glycoside receptor: comparisons with Na+,K+-ATPase.
模型强心苷受体的鉴定:与Na ,K -ATP酶的比较。
- DOI:10.1021/bi973037d
- 发表时间:1998
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kasturi,R;Yuan,J;McLean,LR;Margolies,MN;BallJr,WJ
- 通讯作者:BallJr,WJ
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