Using CRISPR/Cas9 genome editing to facilitate antibiotic discovery in novel Streptomyces species
使用 CRISPR/Cas9 基因组编辑促进新链霉菌物种中抗生素的发现
基本信息
- 批准号:BB/X00967X/1
- 负责人:
- 金额:$ 50.5万
- 依托单位:
- 依托单位国家:英国
- 项目类别:Fellowship
- 财政年份:2023
- 资助国家:英国
- 起止时间:2023 至 无数据
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Antibiotics are some of our most important medicines; they treat a range of infectious diseases and are also used to prevent infections in immunocompromised patients such as those undergoing chemotherapy or organ transplant surgery. Unfortunately, microorganisms are increasingly developing resistance to our current antibiotics, meaning the antibiotics no longer work as effectively. New antibiotics that have activity against resistant microorganisms are urgently needed. Around two-thirds of currently used antibiotics were developed from compounds made naturally by soil-dwelling bacteria like Streptomyces. Streptomyces are thought to produce many antimicrobial compounds in the environment, but in the lab, they only usually make a few. This means many more antimicrobial molecules remain to be discovered from Streptomyces if we can find ways to switch on these 'silent' pathways in the lab.This project will use genetic engineering to switch on the production of antibiotics in Streptomyces formicae, a new strain isolated from the nests of Tetraponera penzigi plant-ants. S. formicae is a talented strain, with the potential to produce many antimicrobial molecules. So far, only one has been characterised; a new family of antibiotics called the formicamycins which are potent inhibitors of resistant microorganisms. By deleting the genes responsible for formicamycin production, we have shown that S. formicae starts to produce previously 'silent' compounds, including more new antimicrobials that have activity against resistant microorganisms. In this fellowship, I will seek to characterise these new antimicrobials and determine their clinical potential. I also aim to understand how the antimicrobial molecules are made by S. formicae and why deletion of the formicamycin pathway induces the production of these previously silent molecules. By understanding how these silent pathways are switched on, we can determine whether the same approach could be used in the many hundreds of other Streptomyces strains isolated across the globe, facilitating the discovery of many new antimicrobial molecules.
抗生素是我们最重要的药物之一;它们可以治疗一系列传染病,也可用于预防免疫功能低下患者的感染,例如接受化疗或器官移植手术的患者。不幸的是,微生物对我们现有的抗生素越来越产生耐药性,这意味着抗生素不再有效。迫切需要具有抗耐药微生物活性的新型抗生素。目前使用的抗生素中约有三分之二是由链霉菌等土壤细菌天然产生的化合物开发而成。链霉菌被认为在环境中产生许多抗菌化合物,但在实验室中,它们通常只产生少量。这意味着,如果我们能找到在实验室中打开这些“沉默”途径的方法,则仍有更多的抗菌分子有待从链霉菌中发现。该项目将利用基因工程来启动福米卡链霉菌(一种分离出的新菌株)中抗生素的生产。来自 Tetraponera penzigi 植物蚁的巢穴。 S. formicae 是一种天才菌株,具有产生许多抗菌分子的潜力。到目前为止,只有一个特征被确定;一种新的抗生素家族,称为福米霉素,是耐药微生物的有效抑制剂。通过删除负责产生福米霉素的基因,我们发现福米卡酵母菌开始产生以前“沉默”的化合物,包括更多对耐药微生物具有活性的新型抗菌剂。在本次研究金中,我将寻求描述这些新型抗菌药物的特征并确定它们的临床潜力。我还旨在了解抗菌分子是如何由福米卡菌产生的,以及为什么删除福米霉素途径会诱导这些先前沉默的分子的产生。通过了解这些沉默途径是如何开启的,我们可以确定是否可以在全球分离的数百种其他链霉菌菌株中使用相同的方法,从而促进许多新抗菌分子的发现。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Rebecca Devine其他文献
Hyphomonas oceanitis sp. nov., Hyphomonas hirschiana sp. nov., and Hyphomonas jannaschiana sp. nov.
海洋丝单胞菌 sp.
- DOI:
10.1099/00207713-35-3-237 - 发表时间:
1985-07-01 - 期刊:
- 影响因子:2.8
- 作者:
R. Weiner;Rebecca Devine;D. M. Powell;L. Dağaşan;Richard L. Moore - 通讯作者:
Richard L. Moore
Future directions for the discovery of antibiotics from actinomycete bacteria.
从放线菌中发现抗生素的未来方向。
- DOI:
10.1042/etls20160014 - 发表时间:
2017-04-21 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Rebecca Devine;M. Hutchings;Neil A. Holmes - 通讯作者:
Neil A. Holmes
Dissolution of the Disparate: Co-ordinate Regulation in Antibiotic Biosynthesis
不同的溶解:抗生素生物合成的协调调控
- DOI:
10.3390/antibiotics8020083 - 发表时间:
2019-06-01 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
T. C. McLean;B. Wilkinson;M. Hutchings;Rebecca Devine - 通讯作者:
Rebecca Devine
Aromatic polyketide biosynthesis: fidelity, evolution and engineering
芳香族聚酮生物合成:保真度、进化和工程
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Zhiwei Qin;Rebecca Devine;M. Hutchings;B. Wilkinson - 通讯作者:
B. Wilkinson
Complete genome sequence of Streptomyces formicae KY5, the formicamycin producer.
福米霉素生产者福米卡链霉菌 KY5 的完整基因组序列。
- DOI:
10.1016/j.jbiotec.2017.11.011 - 发表时间:
2018-01-10 - 期刊:
- 影响因子:4.1
- 作者:
Neil A. Holmes;Rebecca Devine;Zhiwei Qin;R. Seipke;Barrie Wilkinson;M. Hutchings - 通讯作者:
M. Hutchings
Rebecca Devine的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
相似国自然基金
利用CRISPR/Cas9基因编辑技术靶向胰蛋白酶原异常激活所致遗传性胰腺炎的实验研究
- 批准号:82300740
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
利用CRISPR/Cas9构建低毒的H129扩增子顺向跨单级示踪系统
- 批准号:32371148
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
基于柔性电极微电场的视网膜基因电转技术及其在CRISPR/Cas9基因编辑治疗遗传性视网膜疾病中的作用研究
- 批准号:82371075
- 批准年份:2023
- 资助金额:49 万元
- 项目类别:面上项目
CRISPR/Cas9 RNP介导MaATXR2基因编辑以提高桑树芽器官再生能力的研究
- 批准号:32301611
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于CRISPR/Cas9文库筛选的STK19增强舌鳞癌顺铂敏感性的机制研究
- 批准号:82360568
- 批准年份:2023
- 资助金额:32 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
相似海外基金
Establishing the roles of oestrogen receptor 1 (ESR1) in olfactory development and function using novel CRISPR/Cas9-based knockouts in the zebrafish
使用基于 CRISPR/Cas9 的新型斑马鱼基因敲除技术确定雌激素受体 1 (ESR1) 在嗅觉发育和功能中的作用
- 批准号:
BB/Y00003X/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 50.5万 - 项目类别:
Research Grant
Establishing clinically relevant zebrafish animal models to study abnormal retinal development using CRISPR-Cas9 mutagenesis
使用 CRISPR-Cas9 诱变建立临床相关的斑马鱼动物模型以研究视网膜发育异常
- 批准号:
2882196 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 50.5万 - 项目类别:
Studentship
BRC-BIO: MediCARGO- Decoding peptide perception during Medicago-Sinorhizobium symbiosis using CRISPR-cas9 As a Reverse Genetics tool
BRC-BIO:MediCARGO - 使用 CRISPR-cas9 作为反向遗传学工具解码苜蓿-中华根瘤菌共生期间的肽感知
- 批准号:
2217830 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 50.5万 - 项目类别:
Standard Grant
Using hairy root transformation to optimize the clustered regularly interspersed palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 system in pea (Pisum sativum)
利用毛状根转化优化豌豆 (Pisum sativum) 中的成簇规则散布回文重复序列 (CRISPR)/Cas9 系统
- 批准号:
576038-2022 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 50.5万 - 项目类别:
Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Master's
Site-specific Integration of Large (10-100 kb) DNA Constructs into the Mouse Genome and Human Induced Pluripotent Stem Cells Using the Cas9-Bxb1 Integrase Toolbox
使用 Cas9-Bxb1 整合酶工具箱将大型 (10-100 kb) DNA 构建体定点整合到小鼠基因组和人类诱导多能干细胞中
- 批准号:
10654838 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 50.5万 - 项目类别: