COpenPlantOmics (COPO): a Collaborative Bioinformatics Plant Science Platform

COpenPlantOmics (COPO)：协作生物信息学植物科学平台

基本信息

批准号：
BB/L024071/1
负责人：
Paul Flicek
金额：
$ 10.96万
依托单位：
European Bioinformatics Institute
依托单位国家：
英国
项目类别：
Research Grant
财政年份：
2014
资助国家：
英国
起止时间：
2014 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://gtr.ukri.org/projects?ref=BB%2FL024071%2F1
关键词：
COpenPlantOmics COPO Collaborative Bioinformatics Plant

项目摘要

Abstracts are not currently available in GtR for all funded research. This is normally because the abstract was not required at the time of proposal submission, but may be because it included sensitive information such as personal details.

GTR目前尚未用于所有资助研究的摘要。这通常是因为提交提案时不需要摘要，但可能是因为它包含了敏感信息，例如个人详细信息。

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

COPO: a metadata platform for brokering FAIR data in the life sciences

DOI：
10.1101/782771
发表时间：
2019-09
期刊：
bioRxiv
影响因子：
0
作者：
Anthony Etuk;Felix Shaw;Alejandra N. González-Beltrán;David Johnson;Marie-Angélique Laporte;P. Rocca-Serra;E. Arnaud;M. Devare;P. Kersey;Susanna-Assunta Sansone;Robert P. Davey
通讯作者：
Anthony Etuk;Felix Shaw;Alejandra N. González-Beltrán;David Johnson;Marie-Angélique Laporte;P. Rocca-Serra;E. Arnaud;M. Devare;P. Kersey;Susanna-Assunta Sansone;Robert P. Davey

Ensembl Genomes 2018: an integrated omics infrastructure for non-vertebrate species.

DOI：
10.1093/nar/gkx1011
发表时间：
2018-01-04
期刊：
Nucleic acids research
影响因子：
14.9
作者：
Kersey PJ;Allen JE;Allot A;Barba M;Boddu S;Bolt BJ;Carvalho-Silva D;Christensen M;Davis P;Grabmueller C;Kumar N;Liu Z;Maurel T;Moore B;McDowall MD;Maheswari U;Naamati G;Newman V;Ong CK;Paulini M;Pedro H;Perry E;Russell M;Sparrow H;Tapanari E;Taylor K;Vullo A;Williams G;Zadissia A;Olson A;Stein J;Wei S;Tello-Ruiz M;Ware D;Luciani A;Potter S;Finn RD;Urban M;Hammond-Kosack KE;Bolser DM;De Silva N;Howe KL;Langridge N;Maslen G;Staines DM;Yates A
通讯作者：
Yates A

ISA API: An open platform for interoperable life science experimental metadata.

DOI：
10.1093/gigascience/giab060
发表时间：
2021-09-16
期刊：
GigaScience
影响因子：
9.2
作者：
Johnson D;Batista D;Cochrane K;Davey RP;Etuk A;Gonzalez-Beltran A;Haug K;Izzo M;Larralde M;Lawson TN;Minotto A;Moreno P;Nainala VC;O'Donovan C;Pireddu L;Roger P;Shaw F;Steinbeck C;Weber RJM;Sansone SA;Rocca-Serra P
通讯作者：
Rocca-Serra P

The Ontologies Community of Practice: A CGIAR Initiative for Big Data in Agrifood Systems.

DOI：
10.1016/j.patter.2020.100105
发表时间：
2020-10-09
期刊：
Patterns (New York, N.Y.)
影响因子：
0
作者：
Arnaud E;Laporte MA;Kim S;Aubert C;Leonelli S;Miro B;Cooper L;Jaiswal P;Kruseman G;Shrestha R;Buttigieg PL;Mungall CJ;Pietragalla J;Agbona A;Muliro J;Detras J;Hualla V;Rathore A;Das RR;Dieng I;Bauchet G;Menda N;Pommier C;Shaw F;Lyon D;Mwanzia L;Juarez H;Bonaiuti E;Chiputwa B;Obileye O;Auzoux S;Yeumo ED;Mueller LA;Silverstein K;Lafargue A;Antezana E;Devare M;King B
通讯作者：
King B

DOI：
{{ item.doi }}
发表时间：
{{ item.publish_year }}
期刊：
{{ item.journal_name }}
影响因子：
{{ item.factor }}
作者：
{{ item.authors }}
通讯作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

Paul Flicek其他文献

Variant calling on the GRCh38 assembly with the data from phase three of the 1000 Genomes Project [version 1; peer review: 2 not approved]

使用 1000 基因组计划第三阶段的数据调用 GRCh38 组装的变体 [版本 1；

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ernesto Lowy;S. Fairley;Xiangqun Zheng;Magali Ruffier;Laura Clarke;Paul Flicek
通讯作者：
Paul Flicek

International classification of rodent tumours. Part I--The rat. 2. Soft tissue and musculoskeletal system.

啮齿动物肿瘤的国际分类。

DOI：
发表时间：
1992
期刊：
IARC scientific publications
影响因子：
0
作者：
A. Mallon;V. Iyer;David G. Melvin;Hugh Morgan;H. Parkinson;Steve D. M. Brown;Paul Flicek;W. Skarnes
通讯作者：
W. Skarnes

Multiple laboratory mouse reference genomes define strain specific haplotypes and novel functional loci

多个实验室小鼠参考基因组定义了品系特异性单倍型和新的功能位点

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
bioRxiv
影响因子：
0
作者：
Jingtao Lilue;A. Doran;Ian T. Fiddes;M. Abrudan;J. Armstrong;Ruth Bennett;W. Chow;J. Collins;A. Czechanski;P. Danecek;M. Diekhans;Dirk;M. Dunn;R. Durbin;Dent Earl;A. Ferguson;Paul Flicek;J. Flint;A. Frankish;B. Fu;M. Gerstein;J. Gilbert;L. Goodstadt;J. Harrow;K. Howe;M. Kolmogorov;Stefanie Koenig;C. Lelliott;J. Loveland;R. Mott;Paul Muir;Fábio C. P. Navarro;D. Odom;Naomi R. Park;S. Pelan;S. Phan;M. Quail;L. Reinholdt;Lars Romoth;Lesley M Shirley;Cristina Sisu;Marcela Sjoberg;M. Stanke;C. Steward;Mark Thomas;Glen Threadgold;David Thybert;J. Torrance;Kim Wong;J. Wood;Fengtang Yang;D. Adams;B. Paten;Thomas M. Keane
通讯作者：
Thomas M. Keane

18-P003 A gene regulatory network for mesoderm directed by zebrafish No tail

DOI：
10.1016/j.mod.2009.06.771
发表时间：
2009-08-01
期刊：
Conference abstract
影响因子：
作者：
Rosie Morley;Kim Lachani;Damian Keefe;Andrew Nelson;Michael Gilchrist;Paul Flicek;Jim Smith;Fiona Wardle
通讯作者：
Fiona Wardle