Development of a Novel Method for the Identification and Characterization of Intercellular Communication in the Cancer Niche

开发一种用于识别和表征癌症生态位中细胞间通讯的新方法

基本信息

  • 批准号:
    10426930
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 7.75万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2022-09-01 至 2024-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ABSTRACT Intercellular interactions and communication between cancer cells the cells that comprise their niches are critical for many aspects of cancer development, progression, metastasis, and therapy resistance. These interactions are often dynamic, transient and complex. Moreover, intercellular communication occurs directly by contact dependent cell-cell interactions and indirectly by the secretion of soluble factors into the local microenvironment. Current limitations to proximity dependent labeling strategies designed to identify and characterize direct and indirect cellular interaction partners in vivo include reagents that are toxic and/or limit the isolation and subsequent characterization of interacting cells, non-specific or large radius labeling (i.e. direct vs. indirect contacts), or a requirement to pre-engineer both interacting cells which obviates the possibility of identifying novel cellular interaction partners. Thus, a more ideal in vivo proximity dependent labeling system would concurrently, but differentially, label both direct and indirect cellular contacts at multiple timepoints using technology that is compatible with an array of downstream analyses ranging from microscopy to single cell analyses. In this proposal we will address this shortcoming in current technologies for comprehensively identifying and characterizing direct and indirect intercellular interactions in vivo. We will build upon the literature and our preliminary work to develop a novel approach in which an engineered cancer cell, or other cell of interest, concurrently, differentially and temporally fluorescently labels both direct and indirect cellular contacts within the cancer niche (Aims 1 and 2). Importantly, labeled cells will be suitable for an array of downstream analyses such as microscopy, flow cytometry, and cell sorting followed by bulk or single cell analyses. Accordingly, as proof-of-concept we will then combine this niche labeling technology with single-cell RNA-seq to begin to define cellular contacts during early stages of central nervous system leukemia metastasis and niche development (Aim 3).
抽象的 癌细胞之间的细胞间相互作用和通讯(构成其生态位的细胞是) 对于癌症发生、进展、转移和治疗耐药性的许多方面都至关重要。这些 相互作用通常是动态的、短暂的和复杂的。此外,细胞间通讯直接发生 通过接触依赖性细胞间相互作用以及间接通过可溶性因子分泌到局部 微环境。目前设计用于识别和识别邻近依赖标记策略的局限性 表征体内直接和间接细胞相互作用伙伴,包括有毒和/或限制的试剂 相互作用细胞的分离和后续表征、非特异性或大半径标记(即 直接接触还是间接接触),或者需要预先设计两个相互作用的细胞,从而避免 识别新的细胞相互作用伙伴的可能性。因此,更理想的体内接近依赖 标记系统将同时但有区别地标记多个细胞的直接和间接接触 使用与显微镜等一系列下游分析兼容的技术来确定时间点 单细胞分析。在本提案中,我们将解决当前技术的这一缺陷 全面识别和表征体内直接和间接细胞间相互作用。我们将建设 根据文献和我们的初步工作,开发一种新方法,其中工程化癌细胞, 或其他感兴趣的细胞,同时、差异和时间荧光标记直接和间接 癌症生态位内的细胞接触(目标 1 和 2)。重要的是,标记的细胞将适用于阵列 下游分析,例如显微镜、流式细胞术和细胞分选,然后进行批量或单细胞分析 分析。因此,作为概念验证,我们将把这种利基标记技术与单细胞结合起来 RNA-seq 开始定义中枢神经系统白血病早期阶段的细胞接触 转移和生态位发展(目标 3)。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

PETER M GORDON其他文献

PETER M GORDON的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('PETER M GORDON', 18)}}的其他基金

A Novel VpreB1 Anti-body Drug Conjugate for the Treatment of B-Lineage Acute Lymphoblastic Leukemia/Lymphoma
一种用于治疗 B 系急性淋巴细胞白血病/淋巴瘤的新型 VpreB1 抗体药物偶联物
  • 批准号:
    10651082
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Overcoming Leukemia Chemoresistance in the Central Nervous System
克服中枢神经系统的白血病化疗耐药性
  • 批准号:
    10591475
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Overcoming Leukemia Chemoresistance in the Central Nervous System
克服中枢神经系统的白血病化疗耐药性
  • 批准号:
    10357911
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Autophagy and apoptosis in the response of c-KIT cancers to targeted therapy
c-KIT 癌症对靶向治疗反应中的自噬和凋亡
  • 批准号:
    8537381
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Autophagy and apoptosis in the response of c-KIT cancers to targeted therapy
c-KIT 癌症对靶向治疗反应中的自噬和凋亡
  • 批准号:
    8190091
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Autophagy and Apoptosis in the Response of c-KIT Cancers to Targeted Therapy
c-KIT 癌症对靶向治疗的反应中的自噬和凋亡
  • 批准号:
    8837386
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Autophagy and apoptosis in the response of c-KIT cancers to targeted therapy
c-KIT 癌症对靶向治疗反应中的自噬和凋亡
  • 批准号:
    8334457
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Autophagy and Apoptosis in the Response of c-KIT Cancers to Targeted Therapy
c-KIT 癌症对靶向治疗的反应中的自噬和凋亡
  • 批准号:
    8712410
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Autophagy and Apoptosis in the Response of c-KIT Cancers to Targeted Therapy
c-KIT 癌症对靶向治疗的反应中的自噬和凋亡
  • 批准号:
    8913061
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:

相似国自然基金

基于3D生物打印类器官模型探究PAK5调控三阴性乳腺癌铂类耐药的机制研究
  • 批准号:
    82303979
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
基于微生物群落代谢网络模型构建解析客家黄酒发酵中扣囊复膜酵母与乳酸菌的交互作用机制
  • 批准号:
    32302029
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
热带森林动态植被与土壤微生物耦合模型构建与应用
  • 批准号:
    42371032
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    47 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于生物三维打印的阿尔兹海默症炎性血脑屏障模型构建及β-淀粉样蛋白病变机制研究
  • 批准号:
    52375295
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
具趋向性和非局部作用生物扩散模型的时空动力学研究
  • 批准号:
    12301190
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似海外基金

Extending experimental evolutionary game theory in cancer in vivo to enable clinical translation: integrating spatio-temporal dynamics using mathematical modeling
扩展癌症体内实验进化博弈论以实现临床转化:使用数学建模整合时空动力学
  • 批准号:
    10662098
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Project 2: Ex Vivo Modeling and Analysis of Gastric Precancerous Lesions
项目2:胃癌前病变的离体建模与分析
  • 批准号:
    10715763
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Shared Resource Core 1: Molecular Data Science and Advanced Dosimetry
共享资源核心 1:分子数据科学和高级剂量测定
  • 批准号:
    10712295
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
BCCMA: Overcoming chemoresistance in ovarian cancer: Identification and validation of biomarkers and targetable drivers of platinum resistance
BCCMA:克服卵巢癌的化疗耐药性:铂类耐药的生物标志物和靶向驱动因素的识别和验证
  • 批准号:
    10585641
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
Multi-organ culture and pumping systems for ex vivo models of immunity in hybrid tissue-chips
用于混合组织芯片中免疫离体模型的多器官培养和泵系统
  • 批准号:
    10578463
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 7.75万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了