MECHANISMS OF TISSUE-SPECIFIC GENE EXPRESSION
组织特异性基因表达机制
基本信息
- 批准号:2175494
- 负责人:
- 金额:$ 25.78万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:1981
- 资助国家:美国
- 起止时间:1981-07-01 至 1995-06-30
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:DNA binding protein DNA footprinting Drosophilidae RNase protection assay alcohol dehydrogenase antibody cell differentiation developmental genetics early embryonic stage fat body gene deletion mutation gene expression genetic enhancer element genetic library genetic promoter element immunoprecipitation in situ hybridization laboratory mouse laboratory rabbit molecular cloning myogenesis nucleic acid sequence polymerase chain reaction protein biosynthesis protein sequence protein structure function regulatory gene southern blotting tissue /cell culture transcription factor transfection
项目摘要
The long term objective of the proposed research is to understand
the mechanisms involved in temporal and tissue-specific gene expression
during Drosophila development. We are approaching this problem by
studying alcohol dehydrogenase (Adh) gene expression, and the function
and expression of nautilus (nau), a presumptive myogenic regulatory gene.
The Adh studies will involve characterization of cis-acting regulatory
sequences involved in tissue-specific Adh expression in larvae and
adults, and the identification of proteins that regulate Adh gene
expression. We propose to study the structure, function and expression
of proteins that bind specifically to DNA sequences required for normal
Adh gene expression in larvae (BBF-1, BBF-2, ABF-1) and adults (AEF-1).
The amino acid sequences of these proteins will be deduced from the DNA
sequences of the corresponding cDNA clones, and their pattern of
expression studied by in situ hybridization and RNAse protection methods.
The function of these proteins will be determined by genetic studies,
cotransfection experiments in cultured Drosophila cells, and by in vitro
transcription analyses. A binding site for the mammalian transcription
factor C/EBP has been implicated in the positive control of Adh gene
expression in adults. We therefore plan to clone and characterize
Drosophila genes which encode proteins that bind to this sequence to
determine whether Adh gene regulation involves a functional analog of the
mammalian C/EBP gene. If successful, the Adh studies should provide a
detailed understanding of the protein-DNA and protein-protein
interactions involved in regulating the complex pattern of temporal and
tissue-specific expression of Adh.
The primary goal of the nau gene project is to understand the
regulatory mechanisms involved In the earliest stages of myogenesis in
Drosophila. The DNA sequences required for nau expression in muscle
precursor cells will be identified in P element transformation
experiments, and these sequences will be used to identify genes that
control nau gene expression. The latter will be accomplished by
screening a lambda gt 11 cDNA expression library for clones that express
proteins that bind specifically lo the regulatory sequences. A variety
of molecular approaches will be used to determine whether the nau gene is
directly involved in the regulation of gene expression in muscle
precursor cells. Finally, we plan to identify the targets of nau gene
function using the polymerase chain reaction in conjunction with methods
to isolate specific DNA-protein complexes. The ultimate objective of the
Adh and nau gene studies is to establish a link between the regulatory
events involved in the terminal differentiation of specific cell types,
and the well-characterized regulatory hierarchy involved in the
establishment of specific segments in the early embryo.
拟议研究的长期目标是了解
涉及时间和组织特异性基因表达的机制
在果蝇发育过程中。 我们正在通过以下方式解决这个问题
研究乙醇脱氢酶(Adh)基因表达及其功能
以及鹦鹉螺(nau)的表达,这是一种推定的生肌调节基因。
Adh 研究将涉及顺式作用调节的表征
参与幼虫组织特异性 Adh 表达的序列
成人以及调节 Adh 基因的蛋白质的鉴定
表达。 我们建议研究其结构、功能和表达
与正常细胞所需的 DNA 序列特异性结合的蛋白质
Adh 基因在幼虫(BBF-1、BBF-2、ABF-1)和成虫(AEF-1)中的表达。
这些蛋白质的氨基酸序列将从DNA中推导出来
相应 cDNA 克隆的序列及其模式
通过原位杂交和RNA酶保护方法研究表达。
这些蛋白质的功能将由遗传学研究确定,
在培养的果蝇细胞中进行共转染实验,并通过体外
转录分析。 哺乳动物转录的结合位点
因子C/EBP与Adh基因的阳性控制有关
成人的表达。 因此,我们计划克隆并表征
果蝇基因编码与该序列结合的蛋白质
确定 Adh 基因调控是否涉及 Adh 的功能类似物
哺乳动物 C/EBP 基因。 如果成功,Adh 研究应该提供
详细了解蛋白质-DNA和蛋白质-蛋白质
涉及调节时间和时间的复杂模式的相互作用
Adh 的组织特异性表达。
nau 基因项目的主要目标是了解
参与肌生成最早阶段的调节机制
果蝇。 肌肉中 nau 表达所需的 DNA 序列
前体细胞将在P元素转化中被识别
实验,这些序列将用于识别基因
控制 nau 基因表达。 后者将通过以下方式完成
筛选 lambda gt 11 cDNA 表达文库,寻找表达的克隆
特异性结合调节序列的蛋白质。 品种齐全
分子方法将用于确定 nau 基因是否
直接参与肌肉基因表达的调节
前体细胞。 最后,我们计划确定nau基因的靶点
使用聚合酶链反应与方法结合使用的功能
分离特定的 DNA-蛋白质复合物。 该项目的最终目标是
Adh 和 nau 基因研究的目的是建立调控之间的联系
涉及特定细胞类型的终末分化的事件,
以及涉及的特征明确的监管层级
在早期胚胎中建立特定片段。
项目成果
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