Development of a novel histopathological examination method for castration-resistant prostate cancer focusing on neutral theory of molecular evolution

以分子进化中性理论为重点，开发去势抵抗性前列腺癌的新型组织病理学检查方法

基本信息

批准号：
22K09444
负责人：
石井健一朗
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Mie University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本年度は、アンドロゲン受容体依存性ヒト前立腺がんLNCaP細胞から樹立した、アンドロゲン受容体依存性が異なる３つのサブクローンE9, F10, G4を用いて、Agilent社SureSelect Human All Exon V6 (60.5Mb) kitによるエクソーム解析を実施した。次世代シークエンス解析結果については、２種類の代表的なパイプライン（GATKおよびFreebayes）による精度の高い変異検出を行った（ダブルパイプライン解析）。さらに、タンパク質にインパクトを与える変異と、アレル頻度情報による変異の絞り込みを行った。今回、我々は前立腺がん細胞にアンドロゲン受容体依存性の差異を生み出すパッセンジャー遺伝子変異を同定することを目的としているため、遺伝子の抽出には”androgen receptor (AR)”をキーワードに、かつ親株であるLNCaPには変異が見られないものの、E9, F10, G4のいずれかに変異が認められる遺伝子を抽出することとした。これらの条件で解析した結果、E9もしくはG4に特異的な変異が認められる遺伝子は皆無であったものの、F10に特異的な、一塩基変異Single Nucleotide Variant (SNV)が認められる遺伝子が４つ抽出された。今回、我々はエクソーム解析を施行し、アンドロゲン受容体低依存性のサブクローンF10に特異的な一塩基変異を有する遺伝子４つを抽出することに成功した。これらの遺伝子が正常に働かないために、F10がアンドロゲン受容体低依存性である可能性が考えられる。次年度は、これら４つの遺伝子が前立腺がん細胞のアンドロゲン受容体依存性を規定する鍵分子であることを検証する。

今年，我们使用了安捷伦的 SureSelect 人全外显子 V6 (60.5Mb) 试剂盒，使用具有不同雄激素受体依赖性的三个亚克隆 E9、F10 和 G4，这些亚克隆是从雄激素受体依赖性人前列腺癌 LNCaP 细胞中建立的，并使用外显子组分析进行了分析。对于下一代序列分析结果，使用两种典型管道（GATK和Freebayes）进行高精度突变检测（双管道分析）。此外，我们使用等位基因频率信息缩小了对蛋白质有影响的突变和突变的范围。这次，我们的目的是鉴定导致前列腺癌细胞雄激素受体依赖性差异的过客基因突变，因此我们使用关键字“雄激素受体（AR）”提取基因，而我们决定提取亲本菌株中没有的基因。在某个 LNCaP 中观察到突变，但在 E9、F10 或 G4 中观察到突变。在这些条件下进行分析的结果是，没有提取出具有E9或G4特有的突变的基因，但提取出具有F10特有的单核苷酸变异体(SNV)的4个基因。这次，我们进行了外显子组分析，成功提取了雄激素受体低依赖性亚克隆F10特有的4个具有单核苷酸突变的基因。 F10 可能较少依赖雄激素受体，因为这些基因不能正常发挥作用。明年，我们将验证这四个基因是定义前列腺癌细胞雄激素受体依赖性的关键分子。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Fibroblast-derived miRNA regulates NKX3-1 expression in prostate cancer cells having androgen receptor dependency

成纤维细胞来源的 miRNA 调节具有雄激素受体依赖性的前列腺癌细胞中 NKX3-1 的表达

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Chise Matsuda; Kenichiro Ishii; Yasuhisa Nakagawa; Taku Shirai; Yoshifumi Hirokawa; Kazuhiro Iguchi; Masatoshi Watanabe
通讯作者：
Masatoshi Watanabe

Drug Repositioning of the Phenylpiperazine Derivative Naftopidil in Prostate Cancer Treatment

苯基哌嗪衍生物萘哌地尔在前列腺癌治疗中的药物重新定位