骨髄移植症例を用いたHLA近傍ゲノム領域における急性GVHD新規感受性多型の同定

利用骨髓移植病例鉴定 HLA 附近基因组区域的新型急性 GVHD 易感性多态性

• 批准号: 22K08465
• 负责人: 鈴木 進悟
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tokai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08465/
• 关键词: 造血幹細胞移植; 急性GVHD; HLA; 急性移植片対宿主病; ヒト白血球抗原

急性移植片対宿主病 (aGVHD)は、古典的HLA遺伝子5座 (HLA-A, -B, -C, -DRB1, -DQB1) を患者・ドナー間でマッチさせた骨髄移植症例であっても約半数の症例で発症する。申請者らは、その分子機序を理解にするためのaGVHD 関連解析を先行的に実施した結果、HLA-A座のテロメア側に位置する150 kbからなる連鎖不平衡 (LD) ブロック内にaGVHDと強く関連する遺伝的多型をHLA-F-AS1座に同定した。しかし、HLA-F-AS1座そのものが急性GVHDと相関するのか、それともLDブロック内の別の座位がより強い感受性を示すのかについては不明である。そこで、HLA-F-AS1座が座位するLDブロックにおける網羅的な多型解析を実施し、得られるSNPs情報を用いたゲノム相関解析から真のaGVHD感受性多型を同定することを目的とした。急性GVHDの重症度を考慮して選抜した患者・ドナー99ペア (計198検体)を供試し、Long-ranged PCR法を用いてLDブロックにおける網羅的な多型解析を次世代シーケンサーにより実施した。その結果、198検体から、データベースに登録されている1573箇所および未登録の262箇所の合計1835箇所のSNPsを検出した。次いで、得られた多型データにおける患者・ドナー間でのマッチおよびミスマッチの分布を比較したところ、150kbの内、テロメア側の約130kbに患者・ドナー間でのミスマッチが集中し、残り20kb中のSNPsはその殆どが患者ドナー間で一致するSNPsであった。今後は、得られた多型データを用いてaGVHD発症群と非発症群間、さらにはaGVHDのグレード別に分けた統計解析を実施することで、真のaGVHD感受性多型の同定を目指す。

即使在患者和供体之间五个经典 HLA 基因位点（HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1）匹配的骨髓移植病例中，也可能发生急性移植物抗宿主病（aGVHD）。大约一半的病例会发生这种情况。作为了解其分子机制的初步aGVHD相关分析的结果，申请人发现aGVHD存在于位于HLA-A基因座端粒侧的150kb连锁不平衡(LD)块中，我们鉴定了遗传多态性。在 HLA-F-AS1 位点中，与然而，尚不清楚 HLA-F-AS1 基因座本身是否与急性 GVHD 相关，或者 LD 块内的另一个基因座是否表现出更强的敏感性。因此，我们对HLA-F-AS1位点所在的LD块进行了全面的多态性分析，旨在利用获得的SNP信息通过基因组相关分析来鉴定真正的aGVHD易感性多态性。使用根据急性GVHD的严重程度选择的99对患者-供体对（总共198个样本），使用使用长程PCR的下一代测序仪对LD块进行全面的多态性分析。结果，从198个样本中总共检测到1835个SNP，其中1573个已在数据库中注册，262个未注册。接下来，我们比较了获得的多态性数据中患者和供体之间的匹配和错配分布，发现在150kb中，患者和供体之间的错配集中在端粒侧的130kb左右，而在剩余的20kb中大部分。患者和捐赠者之间的 SNP 是一致的。未来，我们的目标是利用获得的多态性数据对aGVHD发病组和非发病组之间以及aGVHD分级进行统计分析，以确定真正的aGVHD易感性多态性。

项目成果

Sequence Variations Within HLA-G and HLA-F Genomic Segments at the Human Leukocyte Antigen Telomeric End Associated With Acute Graft-Versus-Host Disease in Unrelated Bone Marrow Transplantation.

人类白细胞抗原端粒末端 HLA-G 和 HLA-F 基因组片段的序列变异与无关骨髓移植中的急性移植物抗宿主病相关。

• DOI: 10.3389/fimmu.2022.938206
• 发表时间: 2022
• 作者: Suzuki S; Morishima S; Murata M; Tanaka M; Shigenari A; Ito S; Kanga U; Kulski JK; Morishima Y; Shiina T.
• 通讯作者: Shiina T.