Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
基本信息
- 批准号:10224109
- 负责人:
- 金额:$ 54.32万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2017
- 资助国家:美国
- 起止时间:2017-08-01 至 2023-07-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:19qAccountingAddressAdultAdult GliomaAgeAmericanArchivesB-LymphocytesBioinformaticsBiologicalBiological AssayBloodBlood CellsBlood specimenBone MarrowCD8-Positive T-LymphocytesCellsChildClassificationClassification SchemeClinicCorrelation StudiesDNADNA MethylationDataDevelopmentDiagnosisDiagnosticDisease ProgressionElementsEnvironmentEpidemiologyEpigenetic ProcessExclusionFingerprintFluorescence-Activated Cell SortingFoundationsFutureGene MutationGenerationsGliomaGliomagenesisGoalsHeartHematopoiesisImmuneImmune System DiseasesImmune checkpoint inhibitorImmunologic FactorsImmunologic MarkersImmunologicsImmunophenotypingImmunosuppressionImmunotherapeutic agentInflammationInheritedInterventionLeukocytesLibrariesLymphocyteMalignant NeoplasmsMalignant neoplasm of brainMeasuresMedicineMethylationMolecularMolecular GeneticsMutationMyelogenousMyeloid-derived suppressor cellsMyelopoiesisParaffin EmbeddingPatient-Focused OutcomesPatientsPeripheralPopulationPredictive ValueProductionPrognosisPrognostic FactorPrognostic MarkerProtocols documentationResourcesRisk FactorsRoleSan FranciscoSignal TransductionSuppressor-Effector T-LymphocytesTechniquesTechnologyTestingThe Cancer Genome AtlasTherapeuticTimeTreatment outcomeTumor ImmunityTumor MarkersVaccinesVariantbasecancer immunotherapycancer sitecancer therapycell typeclinical decision-makingcost effectiveepigenetic markerflexibilitygenome wide methylationgranulocyteimmunological statusimprovedin vitro Modelinnovationmethylomemonocyteneutrophilnovel markerpatient populationperipheral bloodpersonalized cancer therapyprognostic valueprogramspromoterpublic health relevanceresponserisk predictionrisk stratificationsuccesssurvival predictiontooltumortumor DNAtumor microenvironmentyears of life lost
项目摘要
Project Summary/Abstract
Gliomas are devastating central nervous tumors that are associated with an immunosuppressive
network impacting the tumor microenvironment, bone marrow and the peripheral blood
compartments. The development of novel biomarkers of cancer immunity have not kept pace with
breakthroughs in our understanding of cancer-associated inflammation and its relationship with
abnormal hematopoiesis and the production of myeloid related suppressor cells (MDSC). This gap in
our understanding is a recognized high priority in the new era of cancer immunotherapy. The Cancer
Moonshot blue ribbon panel recommended as a key actionable goal “to develop approaches to
overcome an obstructive, immune-suppressive tumor environment in both children and adults”. Our
project addresses this important goal by developing and testing a highly innovative approach for
measuring immunosuppression in glioma patients. In Aim 1 we will augment our validated epigenetic
bioinformatic approach for leukocyte profiles to include both granulocytic and monocytic MDSCs. We
use specific DNA methylation changes as quantitative markers of immune cell types. In Aim 2 we will
then assess the predictive value of methylation generated immune profiles (CD4, CD8, T-cells, B-
cells, NK, monocytes, neutrophils, gMDSC, mMDSC) in glioma patient progression and survival.
Patients will be carefully selected from the UCSF Adult Glioma Study to represent key molecular
genetic subtypes of glioma using three diagnostic gene mutations (IDH, TERT, 1p19q deletion). We
then will validate the blood immune profiles in an independent population of glioma patients from the
Mayo Clinic. We will also augment Aim 2 by oversampling an uncommon and poorly understood
subset of glioma patients whose tumors do not contain any of the three cardinal mutations (i.e. triple
negative glioma). To explore the relationship of blood and tumor immune profiles we will apply
genome wide methylation assay to tumors in Aim 3 from patients with matched blood samples from
UCSF. We will then replicate tumor blood correlations within the Mayo Clinic patient population. This
comprehensive program will develop new tools to characterize the destructive immune suppression in
glioma patients. Our epigenetic immune approach is highly flexible and cost effective and will provide
a major advance for evaluating immune factors in glioma treatment and outcomes.
项目摘要/摘要
神经胶质瘤是与免疫抑制有关的中枢神经肿瘤
影响肿瘤微环境,骨髓和外周血的网络
车厢。新型癌症免疫生物标志物的发展并没有使空间保持空间
我们对癌症相关感染的理解及其与之的关系的突破
造血异常和髓样相关抑制细胞(MDSC)的产生。这个差距
在癌症免疫疗法的新时代,我们的理解是公认的高优先事项。癌症
蓝色丝带面板推荐为关键目标“开发方法
克服儿童和成人的阻塞性,免疫抑制性肿瘤环境。”
项目通过开发和测试一种高度创新的方法来解决这一重要目标
测量神经胶质瘤患者的免疫抑制。在AIM 1中,我们将增加我们经过验证的表观遗传学
白细胞谱的生物信息学方法包括粒细胞和单核细胞MDSC。我们
使用特定的DNA甲基化变化作为免疫球类型的定量标记。在目标2中,我们将
然后评估甲基化产生的免疫谱的预测值(CD4,CD8,T细胞,B-
细胞,NK,单核细胞,中性粒细胞,GMDSC,MMDSC)在患者的进展和存活中。
将从UCSF成人神经胶质瘤研究中仔细选择患者,以代表关键分子
胶质瘤的遗传亚型使用三个诊断基因突变(IDH,TERT,1P19Q缺失)。我们
然后将验证来自独立的神经胶质瘤患者的血液免疫特征
梅奥诊所。我们还将通过过采样罕见且不了解的理解来增强目标2
肿瘤患者的子集不包含三个基本突变中的任何一个(即三重
阴性神经胶质瘤)。为了探索血液和肿瘤免疫特征的关系,我们将应用
来自AIM 3的基因组广泛的甲基化测定
UCSF。然后,我们将复制梅奥诊所患者人群中的肿瘤血液相关性。这
综合计划将开发新工具来表征破坏性的免疫抑制
神经胶质瘤患者。我们的表观遗传免疫方法高度灵活且具有成本效益,并将提供
评估神经胶质瘤治疗和结果中免疫因子的主要进步。
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
John K. Wiencke其他文献
John K. Wiencke的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('John K. Wiencke', 18)}}的其他基金
Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
- 批准号:
9751071 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
- 批准号:
9982213 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
8461813 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7523958 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7645800 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7848862 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
7934298 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
8278519 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中的生存生物标志物
- 批准号:
8115135 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
相似国自然基金
签字注册会计师动态配置问题研究:基于临阵换师视角
- 批准号:72362023
- 批准年份:2023
- 资助金额:28 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
全生命周期视域的会计师事务所分所一体化治理与审计风险控制研究
- 批准号:72372064
- 批准年份:2023
- 资助金额:40 万元
- 项目类别:面上项目
会计师事务所数字化能力构建:动机、经济后果及作用机制
- 批准号:72372028
- 批准年份:2023
- 资助金额:42.00 万元
- 项目类别:面上项目
会计师事务所薪酬激励机制:理论框架、激励效应检验与优化重构
- 批准号:72362001
- 批准年份:2023
- 资助金额:28.00 万元
- 项目类别:地区科学基金项目
环境治理目标下的公司财务、会计和审计行为研究
- 批准号:72332002
- 批准年份:2023
- 资助金额:165.00 万元
- 项目类别:重点项目
相似海外基金
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
10472504 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
10226954 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
9759883 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Molecular and clinical evaluation of the glioma patient experience to anticipate modern outcomes and guide patient care
对神经胶质瘤患者经历进行分子和临床评估,以预测现代结果并指导患者护理
- 批准号:
10675604 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别:
Immune epigenetic biomarkers of survival in glioma epidemiology
神经胶质瘤流行病学中生存的免疫表观遗传生物标志物
- 批准号:
9751071 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 54.32万 - 项目类别: