被子植物における分子進化速度と生態的特性の相互作用の解析

被子植物分子进化速率与生态特征的交互作用分析

基本信息

批准号：
22KJ0490
负责人：
片山なつ
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ0490/
关键词：
分子進化速度被子植物生態的特性突然変異率

项目摘要

本研究は、被子植物全体において、分子進化速度の変更パターンと生態的特性との関連性を解明することを目的としている。第一年度は、本解析のベースとなる被子植物大規模系統情報と生態的形態的表現型データセットの取得と整備をおこなった。被子植物の大規模系系統情報については、Zanne et al. (2014)と1KP (2019)、Ramirez-Barahona et al. (2020)の系統解析データを取得し解析を進めている。表現型データセットについては、Zanne et al. (2014)とRamirez-Barahona et al. (2020)が使用している形質データに加え、TRY Plant Trait データベースに公開されているデータを使用することとした。系統解析で使用された種とTRY Plant Trait データベースに形質が登録されている種が一致しないことが多いため、使用する形態データの選別に加え、種レベルではなく属レベルでの解析が可能かを検討している。その結果、種レベルでは３つの系統解析の種数の50%以上をカバーするTRY trait 形質データはいずれの系統解析についても一桁以下しか得ることができなかったが、属レベルでは1KP (2019)については39形質得ることができた。また、TRY Plant Trait データベースは、公開されている多数のデータベースを集約したデータベースであることから、形質データ値の統一を行なっている。第二年度以降、引き続きデータセットを整備し、分子進化速度の変更パターンと生態的特性との関連性の解析を実施する。

这项研究旨在阐明整个CO植物中分子进化速度模式和生态特征的相关性。在第一年，进行了和维护了该分析的基础，对大规模线性系统信息的获取和维护和生态形式-Type表达数据集进行了研究。关于教练工厂的大规模系统信息，Zanne等人（2014年），1KP（2019）和Ramirez-Barahona等人（2020年）。对于表达数据集，除了Zanne等人（2014年）和Ramirez-Barahona等人（2020年）所用的特征外，还发布了植物特征数据库。由于在系统分析中使用的物种以及在尝试植物性状数据库中具有性状的物种通常不匹配，除了使用所使用的数据的分类外，还可以在属水平而不是物种水平上进行分析。我正在考虑。结果，在物种级别上涵盖三个系统分析中的50％或以上的尝试性状数据只能获得每个系统分析的单个数字或更少，但在属1KP属（2019）中只能获得一个数字。我能够获得39个特征。此外，Try Plant Trait数据库是一个与许多已发布数据库集成的数据库，因此它具有统一的性状数据。从第二年开始，将继续开发数据集并分析分子进化速度模式和生态特征的相关性。