Single-cell analysis of adaptive immune system cells in IBD patients

IBD 患者适应性免疫系统细胞的单细胞分析

• 批准号: 22KJ2212
• 负责人: 荒瀬 充
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ2212/
• 关键词: 炎症性腸疾患; クローン病; 組織常在性メモリーT細胞

炎症性腸疾患は腸管の慢性的な炎症を呈し、寛解と増悪を繰り返す疾患である。臨床的な症状と病理所見からクローン病と潰瘍性大腸炎に分類され、近年は本邦も含め世界中で増加傾向にある疾患である。本研究では複数のシングルセル解析手法を用いて先行研究において発見したクローン病に特徴的な細胞障害性を持つCD4陽性組織常在性記憶T細胞集団の詳細な解析を行い、新たな治療ターゲットを発見することを目的としている。今年度は炎症性腸疾患の腸管検体から単離した粘膜固有層単核球細胞を用いてフローサイトメトリーによってCD4陽性T細胞を分取した後に、その細胞を用いて単一細胞からRNAとオープンクロマチン領域の情報を解析するシングルセルMultiome及び、単一細胞からRNAと表面タンパクの情報の解析を行うCITE-seqを施行した。そして、これらの実験から得られたデータを複数の解析手法と組み合わせることによって転写因子X、Yが先行研究で発見した細胞障害性を持つCD4陽性組織常在性記憶T細胞の誘導に関与していることがわかった。今後はこれらの転写因子が実際にクローン病の発症や再燃に関与しているかどうかを検索するため、これらの転写因子を腸管由来のCD4陽性T細胞に過剰発現やノックダウンすることでその細胞の機能がどう変化するかという解析を行なっていく予定である。また、T細胞におけるこれらの転写因子の発現と実際の臨床データ及び疾患活動性がどのように変化しているかを解析する予定である。

炎症性肠病是一种疾病，表现出肠道慢性炎症，导致反复缓解和加剧。根据临床症状和病理发现，它已被归类为克罗恩病和溃疡性结肠炎，近年来，它在全球范围内一直在增加，包括日本。这项研究使用多种单细胞分析方法对CD4阳性组织的居民T细胞种群进行详细分析，这是克罗恩病的特征，在先前的研究中发现，旨在发现新的治疗靶标。今年，在使用从肠道标本中分离出的炎症性肠病的单核细胞将CD4阳性T细胞通过流式细胞仪分离后，然后将细胞对单个细胞多组件进行分析，该细胞对RNA和开放式染色质区域分析了来自单个细胞的开放式染色体区域，并分析了对RNA和Surface蛋白的信息。通过将从这些实验获得的数据与多种分析技术相结合，发现转录因子X和Y参与了先前研究中发现的细胞毒性CD4阳性组织驻留记忆T细胞的诱导。将来，我们将研究这些转录因子是否实际上参与了克罗恩病的发作或复发，并将分析这些转录因子如何过表达或将其击倒为源自肠道的CD4阳性T细胞，这将改变细胞的功能。我们还将分析T细胞中这些转录因子表达的表达和实际临床数据以及疾病活性如何变化。