Search for new effector proteins in Cladosporium fulvum

寻找黄枝孢菌中新的效应蛋白

• 批准号: 23780046
• 负责人: IIDA Yuichiro
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Agriculture and Food Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23780046/
• 关键词: 植物病原糸状菌; トマト葉かび病; エフェクター; Avr; Cladosporium fulvum; レース; 寄生性; Avr5; 国際研究者交流; 一塩基多型解析; 国際研究者交流（オランダ）

Leaf mold of tomato is caused by the biotrophic fungus Cladosporium fulvum which complies with the gene-for-gene system. We sequenced avirulence (Avr) genes in 123 strains collected in Japan to get information about the molecular basis of adaptation to the different Cf genes. The Avr genes of these strains contain unique mutations causing adaptation to Cf genes including (i) frameshift mutations, (ii) transposon insertions in Avr2, (iii) point mutations in Avr4 and Avr4E, and (iv) deletions of Avr4E or Avr9. Proteomics analysis of the apoplastic fluid and RNAseq data were employed to collect the candidates of new effector gene. Among them we identified Avr5 that is conferred by the tomato resistance gene Cf-5 and is located on 1.8 Mb small chromosome.

番茄叶霉病是由符合基因对基因系统的生物营养真菌黄枝孢菌引起的。我们对在日本收集的 123 株菌株的无毒力 (Avr) 基因进行了测序，以获得有关适应不同 Cf 基因的分子基础的信息。这些菌株的 Avr 基因包含导致适应 Cf 基因的独特突变，包括（i）移码突变，（ii）Avr2 中的转座子插入，（iii）Avr4 和 Avr4E 中的点突变，以及（iv）Avr4E 或 Avr9 的删除。利用质外体液的蛋白质组学分析和RNAseq数据来收集新效应基因的候选者。其中我们鉴定出Avr5是由番茄抗性基因Cf-5赋予的，位于1.8 Mb的小染色体上。

项目成果

トマト葉かび病菌の寄生性分化機構.植物防疫

番茄叶霉病植物保护的寄生分化机制。

• 发表时间: 2011
• 作者: 飯田祐一郎;窪田昌春;雨川公洋
• 通讯作者: 雨川公洋

トマト葉かび病菌の寄生性分化機構

番茄叶霉病菌的寄生分化机制

• 发表时间: 2011
• 作者: 飯田祐一郎; 窪田昌春; 雨川公洋
• 通讯作者: 雨川公洋

Unique mutations in effector genes of a Cladosporium fulvum population in Japan have caused adaptation to different tomato Cf genes.

日本黄枝孢菌种群效应基因的独特突变导致了对不同番茄 Cf 基因的适应。

• 发表时间: 2011
• 作者: Yuichiro Iida; Pieter van‘t Hof; Ioannis Stergiopoulos; Rahim Mehrabi; Henriek Beenen; Ayumi Notsu; Masaharu Kubota; Ali Bahkali; Kamel Abd;Pierre J.G.M. de Wit
• 通讯作者: Pierre J.G.M. de Wit

群馬県で確認されたトマト葉かび病菌のレース

群马县确认番茄叶霉病菌种

• 发表时间: 2012
• 作者: 池田健太郎;飯田祐一郎;窪田昌春
• 通讯作者: 窪田昌春

New races with unique mutations in avirulence genes overcoming tomato Cf resistance genes in a Japanese population of Cladosporium fulvum

日本黄枝孢菌群体中具有独特无毒基因突变的新品种克服了番茄 Cf 抗性基因

• 发表时间: 2012
• 作者: Y. Iida; P. van ‘t Hof; I. Stergiopoulos; R. Mehrabi; H. Beenen; A. Notsu; M. Kubota; A. Bahkali; K. Abd
• 通讯作者: K. Abd