Elucidate spatial and temporal heterogenity using extracellare vesicles

使用细胞外囊泡阐明空间和时间异质性

基本信息

  • 批准号:
    22K08787
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.58万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

本研究の目的は細胞外小胞を用いて空間的・時間的Heterogeneityを同定することにより薬物治療に対する耐性獲得メカニズムを明らかにすることである。血中のsmall extracellular vesicle (S-EV)を採取し、腫瘍由来DNAを抽出することにはすでに成功しているため、尿中のS-EVおよび血中のlarge extracellular vesicle (L-EV)の安定した採取法の確立に取り組んだ。尿からS-EVを採取し、腫瘍由来DNAを抽出しRAS変異を同定することに成功した。電子顕微鏡およびNonoSightで50-150 nmの粒子を確認している。しかし、長期間凍結保存した尿からはS-EVが少量しか採取できず、変異同定率が低下する可能性があることがわかったため、現在保存法を検討中である。血液からL-EVを採取することに成功した。しかし電子顕微鏡で観察すると相当数のL-EVが壊れていることがわかったため、最適なL-EV採取法について検討中である。S-EVやL-EVから抽出したDNAは血漿内にあるDNA (cell-free DNA: cfDNA) より良質であり、cfDNAからは同定できない変異が同定できるようになった。これまで、組織でRAS変異が同定されない患者の約10%でcfDNAからRAS変異が同定できることを報告してきたが、血中のS-EVからは18.1%の症例でRAS変異が同定された。組織RAS野生型の約80%でのみ抗Epidermal growth factor receptor (EGFR)抗体が奏効することを鑑みると、S-EVを利用することで抗EGFR抗体の効果予測の精度が向上する可能性がある。
本研究的目的是通过使用细胞外囊泡识别空间和时间异质性来阐明药物治疗耐药性获得的机制。由于我们已经成功地收集了血液中的小细胞外囊泡(S-EV)并提取了肿瘤来源的DNA,因此我们已经成功地收集了血液中的小细胞外囊泡(S-EV)并提取了肿瘤来源的DNA。努力建立稳定的收集方式。我们从尿液中收集了S-EV,提取了肿瘤来源的DNA,并成功鉴定了RAS突变。 50-150 nm 的颗粒已使用电子显微镜和 NonoSight 进行了确认。但研究发现,长期冷冻保存的尿液只能采集到少量的S-EV,这可能会降低突变识别率,因此目前正在考虑保存方法。我们成功地从血液中采集了 L-EV。然而,当用电子显微镜观察时,发现相当数量的L-EV被破坏,因此我们目前正在考虑最佳的L-EV收集方法。从 S-EV 和 L-EV 中提取的 DNA 比血浆中的 DNA(游离 DNA:cfDNA)质量更高,因此可以识别 cfDNA 无法识别的突变。到目前为止,我们已经报道,在大约 10% 组织中未发现 RAS 突变的患者中,可以从 cfDNA 中发现 RAS 突变,但在 18.1% 的血液 S-EV 病例中发现了 RAS 突变。考虑到抗表皮生​​长因子受体(EGFR)抗体仅在大约80%的野生型组织RAS中有效,S-EV的使用可以提高预测抗EGFR抗体功效的准确性。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Detection of RAS mutations in colorectal cancer patients using DNA from extracellular vesicles
使用细胞外囊泡 DNA 检测结直肠癌患者的 RAS 突变
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    栗山翔;山田岳史
  • 通讯作者:
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    2023
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  • 作者:
    Nozu;T. Okumura;T.;山田岳史
  • 通讯作者:
    山田岳史
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    栗山翔;山田岳史;山田岳史;山田岳史
  • 通讯作者:
    山田岳史
ふたつのHeterogeneityがもたらす大腸癌の難治性とその克服
两种异质性带来的结直肠癌的难治性及其克服
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    栗山翔;山田岳史;山田岳史
  • 通讯作者:
    山田岳史
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