A Study on Predicting the Effectiveness of Cancer Immunotherapy

预测癌症免疫治疗有效性的研究

• 批准号: 22K07292
• 负责人: 菊地 順子
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07292/
• 关键词: SWI/SNF複合体遺伝子; 免疫チェックポイント阻害薬; Tumor mutational burden; がん免疫療法; 効果予測

本研究は免疫チェックポイント阻害薬(ICI)の治療効果予測バイオマーカーとしてのSWI/SNF変異の意義についての検討を目的としている。まず、公共データベースを用いて、悪性黒色腫における29個の全SWI/SNF複合体遺伝子変異解析のICIの治療効果予測における有用性について検討を行なったところ、変異あり群はなし群と比して全生存期間延長の傾向を認めた。保険診療で行われる遺伝子パネル検査では29のSWI/SNF複合体遺伝子のなかで４つの遺伝子に関して遺伝子変異解析が行われている。この４つの遺伝子変異を対象として治療効果を比較すると、変異あり群はなし群と比して全生存期間延長の傾向を認めたが、統計学的優位性は示されなかった。SWI/SNF変異の意義を検討するためには、保険診療で検出可能な4遺伝子のみでは不足しているため、その他の25遺伝子についても解析に含めていく必要があることがわかった。また、デコンボルーション法用いてTCGA-SKCMデータベースの解析を行なった。腫瘍局所浸潤免疫細胞各サブタイプの比率はSWI/SNF複合体遺伝子変異の有無によって差を認めなかった。SWI/SNF複合体遺伝子変異は腫瘍浸潤免疫細胞比率とは独立した予後因子である可能性が示唆された。現在、ICIの効果予測バイオマーカーとして、Tumor mutational burden (TMB) が確立しているが、遺伝子パネル検査を行なった症例で、High症例、low症例を抽出し、全エクソンシークエンス、RNAシークエンスを検査を依頼中である。解析結果が返却されたら、TMB High, Low症例におけるSWI/SNF複合体遺伝子変異解析を実施する。

这项研究旨在将SWI/SNF突变作为免疫检查点抑制剂（ICI）作为治疗功效的预测生物标志物的预测生物标志物的重要性。首先，我们研究了ICI在预测使用公共数据库中29个全SWI/SNF复合物基因突变分析的突变分析的治疗疗效中的实用性，并发现与没有突变的组相比，发现了延长整体生存期的趋势。在保险治疗下进行的基因面板测试中的29个SWI/SNF复合基因中的四个基因进行了基因突变分析。在比较这四个基因突变的治疗效果时，与没有突变的组相比，延长总体生存的趋势，但没有显示统计优势。为了检查SWI/SNF突变的重要性，发现只有四个基因可以在保险覆盖的医疗治疗中检测到，因此有必要在分析中包括其他25个基因。此外，使用反卷积分析了TCGA-SKCM数据库。根据SWI/SNF复合基因突变的存在或不存在，局部侵入性免疫细胞的每个亚型的比率没有差异。有人提出，SWI/SNF复合物基因突变可能是独立于肿瘤免疫细胞比率的预后因素。当前，肿瘤突变烧伤（TMB）是作为ICI的预测生物标志物确定的，但是我们目前要求从经过基因面板测试的病例中提取高病例和低病例，并测试所有外显子序列和RNA序列。一旦返回分析结果，将进行TMB高和低病例中的SWI/SNF复合基因突变分析。