HTLV-1感染細胞を腫瘍化に導く宿主クロマチン環境の解明

阐明导致 HTLV-1 感染的细胞发生肿瘤的宿主染色质环境

• 批准号: 22K07091
• 负责人: 三浦 未知
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kawasaki Medical School
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07091/
• 关键词: RNA FISH; マルチプレックス; インフルエンザウイルス; RNA核外輸送; heterogeneity; HTLV-1; ATL; クロマチン; 蛍光イメージング

研究計画1年目である2022年度は、固定した細胞内のRNAを多重に蛍光染色して多種類のRNA分子を一度に同一細胞で検出する実験系の立ち上げを行った。この実験系を、まずは細胞質が広く観察できる肺がん由来の接着細胞を用いて、インフルエンザウイルスを感染させ、転写されたウイルスmRNAの検出を試みることでテストした。この実験系による検出の結果は、ground truthとしている従来の単一蛍光染色によるsmFISHの結果とよく一致し、今回立ち上げた実験系の正確性を確認することができた。なおspin-offの成果として、ここで行ったインフルエンザウイルスmRNAの検出に基づいて、ウイルスmRNAの細胞内分布のばらつきからmRNAの核外輸送速度を推定する理論モデルを着想して発表した(Miura et al. 2023. bioRxiv 2023.04.07.536075)(eLifeに掲載予定)。

在2022财年，即研究计划的第一年，我们启动了一个实验系统，通过对固定细胞中的RNA进行多重荧光染色，同时检测同一细胞中的多种类型的RNA分子。该实验系统首先通过用流感病毒感染肺癌来源的贴壁细胞（其细胞质可以广泛观察到）并尝试检测转录的病毒mRNA来进行测试。使用该实验系统的检测结果与使用单一荧光染色的传统 smFISH 的结果非常吻合，作为基本事实，我们能够确认我们推出的实验系统的准确性。作为衍生结果，基于此处进行的流感病毒 mRNA 检测，我们构思并发表了一个理论模型，该模型根据病毒 mRNA 的细胞内分布变化来估计 mRNA 的核输出率（Miura et al. al. 2023） .bioRxiv 2023.04.07.536075）（计划发表在eLife）。

项目成果

A statistical framework for quantifying the nuclear export rate of influenza viral mRNAs

量化流感病毒 mRNA 核输出率的统计框架

• DOI: 10.1101/2023.04.07.536075
• 发表时间: 2023
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Michi Miura;Naho Kiuchi;Siu-Ying Lau;Bobo Wing-Yee Mok;Hiroshi Ushirogawa;Tadasuke Naito;Honglin Chen;Mineki Saito
• 通讯作者: Mineki Saito