Comparative phylogeography of amphibians in northeastern Japan based on genomic data

基于基因组数据的日本东北部两栖动物的比较系统发育地理学

• 批准号: 22K06365
• 负责人: 吉川 夏彦
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: National Museum of Nature and Science, Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06365/
• 关键词: 両生類; 比較系統地理; 歴史生物地理; 東北日本; ゲノムデータ; 両生類; 比較系統地理; 歴史生物地理; 東北日本; ゲノムデータ

本研究課題では中部・関東以北の東北日本の両生類を対象とした種網羅的な比較系統地理解析を通じて、日本列島の生物相形成史における東北日本の位置づけの再評価を目指す。関東地方以北の東北本州、特に東北地方は両生・爬虫類の種多様性が西南本州に比べて低く、遺伝的多様性も低い種が多いことから、多くの種で氷期に一度集団が縮小あるいは消滅した後で、近年に一斉に拡大した歴史の浅い地域と考えられていた。しかし小型サンショウウオなど一部の種では中新世に起源をもつような古い遺伝的な多様性を残していることも分かってきている。2022年度はこれまで種内の遺伝構造の解明が不十分であったアカガエル属2種（ニホンアカガエル、ヤマアカガエル）の新規サンプル収集を進めるとともに、京都大学等の共同研究者からサンプルの提供を受け、東日本を中心とした分布域全体から得られたサンプルについて、ミトコンドリアDNAのシーケンスによる予備的な遺伝構造の解析を順次進めている。さらに、トウキョウダルマガエルおよびトノサマガエルでも関東以北の集団の新規サンプル収集と遺伝解析を進め、関東平野より北では遺伝的多様性が著しく低下することが明らかになった。他にも東日本産ハコネサンショウウオ属4種（狭義ハコネ、バンダイハコネ、タダミハコネ、ツクバハコネ）、サンショウウオ属3種（トウホクサンショウウオ、イワキサンショウウオ、トウキョウサンショウウオ）でも新規サンプル収集と過去に収集したサンプルの整理をおこない、ミトコンドリアDNAおよび核SNPに基づく遺伝構造の解析を進めた。それらの一環として、広義のトウキョウサンショウウオのうち北部遺伝集団とされてきた地域集団を遺伝的、形態的な違いに基づいて新種イワキサンショウウオとして記載した。

该研究主题旨在通过对日本中部和关东地区的物种覆盖的比较系统发育的全面比较植物地理学分析来重新评估日本群岛在日本群岛中生物群形成史的地位。尤其是在关东地区以北的Tohoku Honshu，两栖动物和爬行动物的多样性少于西南·霍森（Southwest Honshu），许多物种的遗传多样性较低，因此，在人口萎缩或消失后，许多物种的遗传多样性却很短。但是，也很清楚，某些物种（例如小sal豆）仍然保留了起源于中新世的旧遗传多样性。在2022财年，我们正在收集两种红色青蛙属（日本红蛙和Yamagata青蛙）的新样本，以前在该物种内的遗传结构中阐明了这些样本，这些样本由京都大学和其他国家 /其他国家 /地区的合作者提供的样品逐渐分析了概念的遗传学序列，该样品逐渐分析了遗传学的整体序列。主要在日本东部。此外，收集了新的样本，并在东京平原上还进行了关东北部的人口遗传分析，日本普通青蛙也进行了，据显示，遗传多样性显着降低了关东平原以北。 We also collected new samples and organized previous samples for four species of the genus Salamanders from East Japan (narrowly speaking, Hakone, Bandai Hakone, Tadamihakone, and Tsukubahakone), and three species of the genus Salamanders (Joint salamanders, Yakhona, and Tsukubahakone) from East Japan (Joint salamanders, Yakhona, and Tsukubahakone) and three species Salamanders属（Salamanders，Yakhona和Tokyo Salamanders），并基于线粒体DNA和核SNP分析了遗传结构。作为其中的一部分，基于遗传和形态学差异，东京萨拉曼德人的更广泛的萨拉曼德人是一种被认为是北部遗传人群的当地人口。