リンゴ自家不和合性機構の解明と栽培育種への展開

苹果自交不亲和机制的阐明及其栽培育种进展

基本信息

批准号：
22K05612
负责人：
松本省吾
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05612/
关键词：
園芸学果樹リンゴ自家不和合性 SFB遺伝子 S遺伝子型

项目摘要

自家不和合性に関わる17番染色体上の機能性SFB遺伝子ならびに9番染色体上に存在する新奇機能性SFB遺伝子の同定に際しては、リンゴ品種毎の染色体レベルのゲノム解析が必要である。本年度は、ナノポアシーケンスによるゲノム解読に向け、NucleoBond HMW DNA（タカラバイオ）を用いてS1S20アリルを有する‘祝’、S20S24アリルを有する’Rome Beauty’、S1S24アリルを有する‘夏錦’、ならびにS3S7アリルを有する‘JPP35’の葉から高分子量DNAを抽出した。しかしながらOxford Nanopore社での研究分担者所属先変更情報の更新に数ヶ月の時間を要するという想定外の事態に直面し、当該年度内でナノポアシーケンサーMinIONによるシーケンスデータの取得が完了した品種は‘JPP35’のみに留まった。なお‘JPP35’のナノポアシーケンスではリンゴのゲノムサイズの約60倍に相当する約28.9GBの配列を取得できており、残る３品種でも同等のデータ量を確保すれば予定していた解析は実施可能と判断された。また、DDBJなどのデータベースからS-RNaseアミノ酸配列データを取得し、系統解析の結果を基にS-allele表記について統一番号を割り付けた。野生種のS遺伝子標記の始めにwを付けて栽培種と識別するとともに、データベース並びに文献情報を基に追加・修正した1000品種以上（新たにS遺伝子型が同定された中国のリンゴ150品種を含む）のS遺伝子型情報を電子ファイル化した。

为了鉴定 17 号染色体上参与自交不亲和的功能性 SFB 基因和 9 号染色体上的新型功能性 SFB 基因，需要对每个苹果品种进行染色体水平的基因组分析。今年，我们将使用 NucleoBond HMW DNA (Takara Bio) 通过纳米孔测序解码基因组，并将使用 NucleoBond HMW DNA (Takara Bio) 生产带有 S1S20 等位基因的“Koku”、带有 S20S24 等位基因的“Rome Beauty”，从带有S1S24等位基因的“Natsunishiki”和带有S3S7等位基因的“JPP35”的叶子中提取高分子量DNA。然而，我们遇到了意想不到的情况，牛津纳米孔研究合作者的隶属关系变化信息需要几个月的时间才能更新，而年内使用纳米孔测序仪MinION获取序列数据的品种是“JPP35” ”它只剩下。此外，通过“JPP35”的纳米孔测序，我们获得了约28.9GB的序列，大约是苹果基因组大小的60倍，只要满足条件，就可以对其余三个品种进行计划的分析。确定了相同数量的数据的安全。我们还从DDBJ等数据库中获取了S-RNase氨基酸序列数据，并根据系统发育分析的结果为S-等位基因符号分配了统一的编号。除了通过在野生品种的S基因标签开头添加w来识别栽培品种外，我们还根据数据库和文献信息添加和修改了1000多个品种（其中包括新识别的S基因型的150个中国苹果品种）。（含）的基因型信息已转化为电子文件。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

トマトの成熟を制御する新奇低分子RNAの探索

寻找控制番茄成熟的新型小RNA

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sato H.;Otagaki S.;Ono Y.;Shiratake K.;Matsumoto S.;石橋美咲，吉川郁恵，財津桂，及川彰，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕;位田瑞実，星野敦，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕;石垣晋一郎，井藤大也，白武勝裕，吉岡泰，松本省吾;中村優介，兒島孝明，金丸京平，山口維尚，白武勝裕，太田垣駿吾，松本省吾;石橋美咲，中道範人，速水駿，太田垣駿吾，松本省吾，及川彰，白武勝裕;濱元聡奈，服部幹也，白武勝裕，松本省吾，太田垣駿吾
通讯作者：
濱元聡奈，服部幹也，白武勝裕，松本省吾，太田垣駿吾

Production of high Brix tomato by genome editing of invertase inhibitor gene.

通过蔗糖酶抑制剂基因的基因组编辑生产高糖度番茄。

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kohei Kawaguchi;Rie Takei-Hoshi;Ikue Yoshikawa;Keiji Nishida;Makoto Kobayashi;Miyako Kusano;Yu Lu;Tohru Ariizumi;Hiroshi Ezura;Shungo Otagaki;Shogo Matsumoto ;Katsuhiro Shiratake
通讯作者：
Katsuhiro Shiratake

栽培条件及びゲノム編集技術を基盤としたコチョウランの早期開花系の確立

基于栽培条件和基因组编辑技术的蝴蝶兰早期开花系统的建立

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sato H.;Otagaki S.;Ono Y.;Shiratake K.;Matsumoto S.;石橋美咲，吉川郁恵，財津桂，及川彰，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕;位田瑞実，星野敦，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕;石垣晋一郎，井藤大也，白武勝裕，吉岡泰，松本省吾
通讯作者：
石垣晋一郎，井藤大也，白武勝裕，吉岡泰，松本省吾

ナノポアシーケンス技術を活用したII型赤果肉リンゴ系統のゲノム解析

利用纳米孔测序技术对 II 型红肉苹果品系进行基因组分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
M. Hashimoto;S. Murakami;H. Aoki;T. Koyama;橋本叡信・林裕也・成澤友香・村上隼・青木博光・神山拓也;橋本叡信・林裕也・青木博光・村上隼;小倉輝之・大西孝幸・房　相佑;渡邉健太・上野正実・川満芳信;渡邉健太・上野正実・川満芳信;渡邉健太・普天間亮太・上野正実・川満芳信;石垣晋一郎，井藤大也，白武勝裕，吉岡泰，松本省吾;中村優介，兒島孝明，金丸京平，山口維尚，白武勝裕，太田垣駿吾，松本省吾
通讯作者：
中村優介，兒島孝明，金丸京平，山口維尚，白武勝裕，太田垣駿吾，松本省吾

トマトの接ぎ木成立に関与する無機イオンの探索とMnの機能解析

番茄嫁接建立过程中无机离子的寻找及Mn的功能分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sato H.;Otagaki S.;Ono Y.;Shiratake K.;Matsumoto S.;石橋美咲，吉川郁恵，財津桂，及川彰，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕;位田瑞実，星野敦，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕;石垣晋一郎，井藤大也，白武勝裕，吉岡泰，松本省吾;中村優介，兒島孝明，金丸京平，山口維尚，白武勝裕，太田垣駿吾，松本省吾;石橋美咲，中道範人，速水駿，太田垣駿吾，松本省吾，及川彰，白武勝裕;濱元聡奈，服部幹也，白武勝裕，松本省吾，太田垣駿吾;川口航平，馬建鋒，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕
通讯作者：
川口航平，馬建鋒，太田垣駿吾，松本省吾，白武勝裕

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松本省吾其他文献

イネ圃場における定期的な低温プラズマ処理による生育や収穫に対する検討 (II)

常规低温等离子体处理稻田生长与收获研究（二）

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
橋爪博司;北野英己;水野寛子;湯浅元気;東野里江;田中宏昌;石川健治;松本省吾;榊原均;仁川進;前島正義;水野正明;堀勝
通讯作者：
堀勝

CRISPR/Cas9システムを用いたファレノプシス属のゲノム編集

使用 CRISPR/Cas9 系统编辑蝴蝶兰基因组

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
二宮佳奈;浅野裕己;Endang Semiarti;Aziz Purwantoro;Jaka Widada;Aries Bagus Sasongko;Muhammad Dylan Lawrie;Windi Mose;松本省吾;吉岡泰
通讯作者：
吉岡泰