新規同定された難培養歯周病菌の種間相互作用を介した栄養要求性の解明

通过新发现的难以培养的牙周病原体的种间相互作用阐明营养缺陷型

基本信息

批准号：
22K10311
负责人：
坂中哲人
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K10311/
关键词：
難培養歯周病菌 Fusobacterium 種間相互作用栄養共生

项目摘要

次世代シークエンサーの登場により、これまで分離培養が困難であった多くの細菌が歯周病に関与している実態が明らかになってきた。こうした難培養菌は宇宙の暗黒物質になぞらえ、歯周病菌ダークマターとも呼ばれ、その病因論的役割に注目が集まっている。近年、こうした難培養歯周病菌のいくつかの菌種の分離培養が可能になり、基準株が利用できるようになったが、その生育には口腔常在菌であるFusobacterium nucleatumの培養上清あるいは菌体成分が必要不可欠であることが分かっている。本研究では、in silicoおよび独自の共培養メタボロミクス測定系を活用し、F. nucleatumから難培養歯周病菌に提供される扶養因子を探索し、これら難培養歯周病菌のF. nucleatumに対する栄養依存機構および生存戦略を紐解くことで、歯周病菌ダークマターの謎に満ちた生態や病態形成における役割に光をあてることを目指す。これまでに、F. nucleatumに対する難培養歯周病菌の栄養依存機構について、公共データベースから取得したゲノム情報に基づいてin silico解析を実施し、難培養歯周病菌を支える扶養因子の探索に向けた候補物質のカタログ化を行っている。また、共培養メタボロミクス実験系の構築に向け、理研・微生物材料開発室から難培養歯周病菌を入手し、F. nucleatumとの共培養下で安定的に培養、増殖、集菌ができるよう基礎的な条件検討と最適化を行い、難培養歯周病菌のルーチン培養方法を確立し、次年度以降のメタボローム解析のための実験環境の整備に努めた。

随着下一代测序仪的出现，人们已经清楚地发现许多以前难以分离和培养的细菌与牙周病有关。这些难以培养的细菌也被称为牙周病细菌暗物质，将其比作宇宙的暗物质，其病因学作用正引起人们的关注。近年来，一些难以培养的牙周病细菌已经可以分离和培养，并且已知细菌成分是必不可少的。在本研究中，我们利用计算机和独特的共培养代谢组学测量系统来探索F. nucleatum为难培养牙周细菌提供的支持因子，并研究这些难培养牙周细菌的营养依赖性。通过揭示具核梭杆菌的机制和生存策略，我们的目标是揭示牙周病原体暗物质的神秘生态学及其在发病机制中的作用。迄今为止，我们基于从公共数据库获得的基因组信息，对难以在具核梭杆菌上培养的牙周病细菌的营养依赖机制进行了计算机分析，旨在寻找支持难以培养的支持因素。培养牙周病细菌。我们正在对候选物质进行编目。此外，为了构建共培养代谢组学实验系统，我们从RIKEN微生物材料开发实验室获得了难以培养的牙周病细菌，并建立了共培养下稳定培养、增殖和细菌收集的基础我们对具核梭菌进行了调查和优化，建立了难以培养的牙周病细菌的常规培养方法，并从明年开始致力于为代谢组分析准备实验环境。