The elucidation of regulatory mechanism of molecular network on RNA virus infection in diffuse- and intestinal-type gastric cancer

弥漫型和肠型胃癌RNA病毒感染分子网络调控机制的阐明

• 批准号: 21K12133
• 负责人: 田邊 思帆里
• 金额: $ 2.25万
• 依托单位: National Institute of Health Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K12133/
• 关键词: 分子ネットワーク; がん; RNAウィルス; ネットワーク解析; 上皮間葉転換; パスウェイ; EMT; がん幹細胞

胃がんにはびまん型胃がんと腸型胃がん等のいくつかのサブタイプが知られている。びまん型胃がんは、抗がん剤耐性を有し転移や再発等に至るなど、腸型胃がんに比較して悪性度が高いことが知られている。びまん型胃がんの悪性化にはがん幹細胞や上皮間葉転換(Epithelial-mesenchymal transition; EMT)が関与していることが知られており、抗がん剤耐性や治療薬ターゲット、治療薬安全性に関する知見を得る上では、その分子ネットワークを解析する必要がある。びまん型胃がんと腸型胃がんのネットワークを解析したところ、RNAウィルス感染に関する制御ネットワークが得られたことから、がんとRNAウィルス感染との関連性について本研究において詳細を検討することを目的とした。公開データベース上の胃がん遺伝子発現データを用いて変動遺伝子群を同定した。RNAウィルス感染及びがん関連分子をIngenuity Pathway Analysis(IPA)等のネットワーク解析ツールを用いて解析し、RNAウィルス感染メカニズムに関連する分子ネットワークを明らかとした。Regulatory effect解析により、びまん型胃がんにおけるRNAウィルス感染ネットワークの関与が明らかになった。コロナウィルス病態パスウェイに関連する合計22,959解析が同定され、最も活性化スコアが高かった解析は腹膜中のM2マクロファージに関する解析であり、最も活性化スコアが低かった解析は末梢血中のB細胞に関する解析であった。EMTネットワークの活性化を予測するAIモデルを作成し、論文発表した。本研究によりRNAウィルス感染メカニズムとびまん型胃がんとの関連性が示唆され、その詳細を明らかにすることによりウィルス感染制御やがん創薬に繋がる可能性がある。

已知的几种亚型的亚型，例如弥漫性胃癌和肠胃癌。众所周知，弥漫性胃癌具有抗癌药耐药性并导致转移和复发，使其比肠道胃癌更恶性。众所周知，癌症干细胞和上皮间质转变（EMT）参与了弥漫性胃癌的恶性转化，并且有必要分析分子网络，以便获得有关抗癌药物耐药性，治疗药物靶标和治疗药物安全的了解。对弥漫性和肠胃癌之间网络的分析显示，RNA病毒感染的调节网络，本研究的目的是详细检查癌症与RNA病毒感染之间的关系。使用公共数据库上的胃癌基因表达数据确定可变基因组。使用网络分析工具（例如Ingenuity途径分析（IPA））分析了RNA病毒感染和与癌症相关的分子，并揭示了与RNA病毒感染机制相关的分子网络。调节作用分析表明，RNA病毒感染网络参与弥漫性胃癌。确定了与冠状病毒途径相关的22,959个分析，最高的激活评分是对腹膜中M2巨噬细胞的分析，最低的激活评分是对外周血中B细胞的分析。创建了AI模型来预测EMT网络的激活并发表论文。这项研究表明，RNA病毒感染的机制与弥漫性胃癌之间存在联系，并且通过阐明细节，它可能导致控制病毒感染和癌症药物发现。

项目成果

Report of the 1st and 2nd Mystery of Reactive Oxygen Species Conferences

第一届、第二届活性氧之谜会议报告

• DOI: 10.14573/altex.2203011
• 发表时间: 2022
• 期刊: ALTEX - Alternatives to animal experimentation
• 作者: Shihori Tanabe,Danielle Beaton,Vinita Chauhan;et al.
• 通讯作者: et al.

Relationship between Immune Checkpoint Inhibitors and Myocarditis

免疫检查点抑制剂与心肌炎的关系

• DOI: 10.52793/acmr.2022.3
• 发表时间: 2022
• 期刊: Advances in Clinical and Medical Research
• 作者: 山田雄大;平山和浩;藤井佑樹;吉田達貞;Takeshi Ishikawa;Shihori Tanabe
• 通讯作者: Shihori Tanabe

cfDNAによる毒性評価

使用 cfDNA 进行毒性评估

• 发表时间: 2022
• 作者: 小野竜一;山本 雄介;成瀬 美衣;田邊 思帆里;吉岡 祐亮;相崎 健一;広瀬 明彦;落谷 孝広;平林 容子;北嶋 聡
• 通讯作者: 北嶋 聡

慢性的活性酸素種からヒト治療耐性胃がんへ至る有害性発現経路の開発及び分子ネットワーク解析

慢性活性氧导致人类难治性胃癌毒性途径的开发和分子网络分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 張桀碩;岩瀬一彦;武村知昭;東川瞬;阿部晶子;大久保友幸;林久志;田邊 思帆里,カデール サビーナ,小野 竜一,カブラル オラシオ,青柳 一彦,広瀬 明彦,パーキンス エド,横崎 宏,佐々木 博己
• 通讯作者: 田邊 思帆里,カデール サビーナ,小野 竜一,カブラル オラシオ,青柳 一彦,広瀬 明彦,パーキンス エド,横崎 宏,佐々木 博己

INVOLVEMENT OF RNA VIRUS INFECTION PATHWAY IN DIFFUSE- AND INTESTINAL-TYPE GASTRIC CANCER

RNA 病毒感染途径参与弥漫性和肠型胃癌

• 发表时间: 2021
• 作者: 名越 翔;森田 裕之;Shihori Tanabe,Sabina Quader,Ryuichi Ono,Horacio Cabral,Kazuhiko Aoyagi,Akihiko Hirose,Ed Perkins,Hiroshi Yokozaki,Hiroki Sasaki
• 通讯作者: Shihori Tanabe,Sabina Quader,Ryuichi Ono,Horacio Cabral,Kazuhiko Aoyagi,Akihiko Hirose,Ed Perkins,Hiroshi Yokozaki,Hiroki Sasaki