Analysis of regulation mechanism for metabolic pathway based on comparative proteomics for protein abundance

基于蛋白质丰度比较蛋白质组学分析代谢途径调控机制

• 批准号: 22510207
• 负责人: KITO Keiji
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Meiji University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22510207/
• 关键词: 比較プロテオミクス; 代謝経路; 酵母; 質量分析; 出芽酵母; 絶対量計測; PCS-MS法

In this study, we analyzed proteome expression pattern for multiple yeast species grown on different culture conditions to understand proteome differences involved in interspecies varieties. Eight yeast species grew with comparable growth rate on glucose medium. In contrast, four species of Saccharomyces genus, including S. cerevisiae, showed slow growth rate by two-to three-fold on glycerol and acetate medium, compared to four species belonging to different genus. Some groups of proteins involved in mitochondrial metabolic pathway and response to oxidative stress showed different abundance between Saccharomyces and other genus when grown on glycerol. It is suggested that such differences in abundance of proteins with specific functions could be responsible for disparity of growth rate among yeast species.

在这项研究中，我们分析了在不同培养条件下生长的多种酵母物种的蛋白质组表达模式，以了解种间品种所涉及的蛋白质组差异。八种酵母菌在葡萄糖培养基上以相当的生长速度生长。相比之下，与属于不同属的四种酵母相比，包括酿酒酵母在内的四种酵母属在甘油和醋酸盐培养基上的生长速度慢了两到三倍。当在甘油上生长时，参与线粒体代谢途径和氧化应激反应的一些蛋白质组在酵母菌和其他属之间表现出不同的丰度。有人认为，具有特定功能的蛋白质丰度的这种差异可能是酵母物种之间生长速度差异的原因。

项目成果

Hierarchical Use of Peptide-concatenated Standard (PCS) for Absolute Protein Quantification with Mass Spectrometry.

肽连接标准品 (PCS) 的分层使用用于质谱绝对蛋白质定量。

• 发表时间: 2010
• 作者: Keiji Kito; Takashi Ito
• 通讯作者: Takashi Ito

Hierarchical Use of Peptide-concatenated Standard (PCS) for Absolute Protein Quantification with Mass Spectrometry.

肽连接标准品 (PCS) 的分层使用用于质谱绝对蛋白质定量。

• 发表时间: 2010
• 作者: Keiji Kito; Takashi Ito.
• 通讯作者: Takashi Ito.

Remodeling of the SCF complex-mediated ubiquitination system by compositiona lalteration of incor-porated F-box proteins.

通过掺入的 F-box 蛋白的组成和变化来重塑 SCF 复合物介导的泛素化系统。

• 发表时间: 2010
• 影响因子: 3.4
• 作者: Kato;M.;Kito;K.;Ota;K.;Ito;T.
• 通讯作者: T.

酵母種間における比較プロテオミクス

酵母物种之间的比较蛋白质组学

• 发表时间: 2012
• 作者: 大西美帆子;伊藤遼;長谷川勇輔;正岡昌一郎;紀藤圭治
• 通讯作者: 紀藤圭治

酵母種間における代謝経路の比較プロテオミクス

酵母物种代谢途径的比较蛋白质组学

• 发表时间: 2012
• 作者: 紀藤圭治