Regulation of APOBEC3 gene expression and its transcript splicing

APOBEC3基因表达及其转录剪接的调控

• 批准号: 21390143
• 负责人: MIYAZAWA Masaaki
• 金额: $ 10.15万
• 依托单位: Kinki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21390143/
• 关键词: 個体; 感染抵抗性; 宿主因子; 遺伝子発現; APOBEC3; 遺伝子多型; スプライシング; 翻訳効率; 進化; レトロウイルス; 複製制御; シチジンデアミナーゼ; 発現制御; エキソン; 単一塩基多型; 中和抗体; Bリンパ球; 活性化

Polymorphisms at the mouse APOBEC3(mA3) gene locus have been associated with different susceptibilities to infection with mouse leukemia viruses. In virus-resistant C57BL/6(B6) mice, mA3 transcripts and protein are more abundant than those in susceptible BALB/c mice, and these strains of mice also express mA3 transcripts with different splicing patterns. B6 mice express predominantly the exon 5-deficient transcript, which confer more efficient translation than the full-length transcript. By employing in vitro splicing assays using genomic DNA clones, we identified two critical determinants that regulate exon 5 inclusion into mA3 transcripts : the number of TCCT repeats upstream of exon 5 and the newly identified single nucleotide polymorphism within exon 5 located 12 bases upstream of the exon 5/intron 5 boundary.

小鼠 APOBEC3(mA3) 基因位点的多态性与小鼠白血病病毒感染的不同易感性相关。在抗病毒的C57BL/6(B6)小鼠中，mA3转录本和蛋白质比易感BALB/c小鼠更丰富，并且这些品系的小鼠也表达具有不同剪接模式的mA3转录本。 B6 小鼠主要表达外显子 5 缺陷转录本，这比全长转录本具有更有效的翻译效率。通过使用基因组 DNA 克隆进行体外剪接测定，我们确定了调节 mA3 转录本中外显子 5 包含的两个关键决定因素：外显子 5 上游 TCCT 重复的数量以及位于外显子 5 上游 12 个碱基处新鉴定的单核苷酸多态性。外显子 5/内含子 5 边界。

项目成果

Immunological approaches for healthy longevity

健康长寿的免疫学方法

• 发表时间: 2012
• 作者: Miyazawa; M.; 他
• 通讯作者: 他

An evolutionary analysis of RAC2 identifies haplotypes associated with human autoimmune diseases

RAC2 的进化分析识别与人类自身免疫性疾病相关的单倍型

• DOI: 10.1093/molbev/msr164
• 发表时间: 2011
• 作者: Sironi; M.; F. R. Guerini; C. Agliardi; M. Biasin; R. Cagliani; M. Fumagalli; D. Caputo; A. Cassinotti; S. Ardizzone; M. Zanzottera; E. Bolognesi; S. Riva; Y. Kanari; M. Miyazawa; M. Clerici
• 通讯作者: M. Clerici

Persistence of viremia and production of neutralizing antibodies differentially regulated by polymorphic APOBEC3 and BAFF-R loci in Friend virus-infected mice

弗兰德病毒感染小鼠中病毒血症的持续存在以及中和抗体的产生受多态性 APOBEC3 和 BAFF-R 基因座的差异调节

• DOI: 10.1128/jvi.02516-09
• 发表时间: 2010
• 作者: Tsuji

Production of virus-neutralizing antibodies and protection against lethal retroviral infection in AID-deficient mice

在 AID 缺陷小鼠中产生病毒中和抗体并防止致命的逆转录病毒感染

• 发表时间: 2011
• 作者: Kato; M.; 他
• 通讯作者: 他

Infection of thymus with murine retrovirus induces virus-specific central tolerance that prevents dynamic differentiation of functional memory CD8+ T cells

鼠逆转录病毒感染胸腺可诱导病毒特异性中枢耐受，从而阻止功能性记忆 CD8 T 细胞的动态分化

• 发表时间: 2011
• 作者: Takamura; S.; 他
• 通讯作者: 他