Development of intra-molecule dynamic structure network analysis method to characterize protein dynamics

开发表征蛋白质动力学的分子内动态结构网络分析方法

• 批准号: 16K00407
• 负责人: Wako Hiroshi
• 金额: $ 1.5万
• 依托单位: Waseda University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-01 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16K00407/
• 关键词: 生物物理学; バイオインフォ―マティクス; 計算化学; タンパク質の立体構造; 基準振動解析; 動的構造; ネットワーク解析; タンパク質の動的構造; Protein Data Bank; 多量体; T細胞受容体; 中心性指標; アロステリック効果; 生物物理; 生体生命情報学; 計算物理

项目成果

二面角系基準振動解析プログラムの巨大分子への適用―側鎖自由度の固定

二面体系统标准振动分析程序在大分子中的应用-固定侧链自由度

• 发表时间: 2016
• 作者: 猿渡茂;輪湖博
• 通讯作者: 輪湖博

タンパク質の基準振動モードのネットワーク解析：中心性指標Betweennessとアロステリック機構

蛋白质标准振动模式的网络分析：中心性指数介数和变构机制

• 发表时间: 2017
• 作者: 輪湖 博;猿渡 茂
• 通讯作者: 猿渡 茂

Characterization of TCR-pMHC interaction at residue-level based on FMO and PIEDA

基于 FMO 和 PIEDA 的残基水平 TCR-pMHC 相互作用表征

• 发表时间: 2017
• 作者: H.Tsurui;Y. Tsuchiya;Y. Namiuchi;H. Wako
• 通讯作者: H. Wako

T細胞受容体による特異的および交差反応的な抗原認識機構の解明

阐明 T 细胞受体的特异性和交叉反应性抗原识别机制

• 发表时间: 2017
• 作者: 土屋裕子;波内良樹;輪湖 博;鶴井博理
• 通讯作者: 鶴井博理

基準振動のネットワーク解析によるTCR-pMHC複合体の動的構造

通过参考振荡网络分析 TCR-pMHC 复合物的动态结构

• 发表时间: 2018
• 作者: 輪湖博;土屋裕子;猿渡茂
• 通讯作者: 猿渡茂