Functional classification of long noncoding RNAs based on functional elements and deep learning

基于功能元件和深度学习的长非编码RNA功能分类

基本信息

批准号：
16H05879
负责人：
Hamada Michiaki
金额：
$ 14.98万
依托单位：
Waseda University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-01 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

项目成果

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会议论文数量（0）

专利数量（0）

DeepM6ASeq: prediction and characterization of m6A-containing sequences using deep learning

DOI：
10.1186/s12859-018-2516-4
发表时间：
2018-12-31
期刊：
BMC BIOINFORMATICS
影响因子：
3
作者：
Zhang, Yiqian;Hamada, Michiaki
通讯作者：
Hamada, Michiaki

A Novel Method for Assessing the Statistical Significance of RNA-RNA Interactions Between Two Long RNAs

评估两个长 RNA 之间 RNA-RNA 相互作用统计意义的新方法

DOI：
10.1089/cmb.2017.0260
发表时间：
2018
期刊：
Journal of Computational Biology
影响因子：
1.7
作者：
Fukunaga Tsukasa;Hamada Michiaki
通讯作者：
Hamada Michiaki

Identifying sequence features that drive ribosomal association for lncRNA

DOI：
10.1186/s12864-018-5275-8
发表时间：
2018-12
期刊：
BMC Genomics
影响因子：
4.4
作者：
Chao Zeng;Michiaki Hamada
通讯作者：
Chao Zeng;Michiaki Hamada

The analysis of mutational signatures for understanding carcinogenesis considering temporal heterogeneity

考虑时间异质性，分析突变特征以了解致癌作用

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
塚原美緒;中西基文;和泉慎太郎;中井陽三郎;川口博;吉本雅彦;Kanami Yagimoto(早大)，Shion HOSODA(早大/CBBD-OIL)，Michiaki HAMADA(早大/CBBD-OIL);Shiina NAITO(早大)， Taro Matsutani(早大/CBBD-OIL)， Michiaki HAMADA(早大/CBBD-OIL)
通讯作者：
Shiina NAITO(早大)， Taro Matsutani(早大/CBBD-OIL)， Michiaki HAMADA(早大/CBBD-OIL)

Estimating energy parameters for RNA secondary structure predictions using both experimental and computational data

使用实验和计算数据估计 RNA 二级结构预测的能量参数

DOI：
10.1109/tcbb.2018.2813388
发表时间：
2018
期刊：
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
影响因子：
0
作者：
Shimpei Nishida;Shun Sakuraba;Kiyoshi Asai;and Michiaki Hamada
通讯作者：
and Michiaki Hamada

DOI：
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作者：
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通讯作者：
安村亮祐，西出俊，康シン，任福継

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DOI：
发表时间：
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影响因子：
0
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通讯作者：
鳴海拓志

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发表时间：
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影响因子：
0
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Hosoda Shion;Fukunaga Tsukasa;Hamada Michiaki;鳴海拓志
通讯作者：
鳴海拓志

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DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
Zeng Chao;Hamada Michiaki;柴崎英展，康シン，西出俊，任福継
通讯作者：
柴崎英展，康シン，西出俊，任福継

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10.1021/acs.jctc.0c00270
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2020
期刊：
Journal of Chemical Theory and Computation
影响因子：
5.5
作者：
Sakuraba Shun;Iwakiri Junichi;Hamada Michiaki;Kameda Tomoshi;Tsuji Genichiro;Kimura Yasuaki;Abe Hiroshi;Asai Kiyoshi
通讯作者：
Asai Kiyoshi