海洋ビッグデータを用いた新しい生態系評価手法の開発

利用海洋大数据开发新的生态系统评估方法

基本信息

批准号：
15F15399
负责人：
長井敏
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Fisheries Research and Education Agency
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2015
资助国家：
日本
起止时间：
2015-11-09 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

2012-2015年の4年間、大阪湾の2地点において、次世代シーケンサーを用いたメタゲノム解析による時系列モニタリングを実施した。貝毒原因渦鞭毛藻であるAlexandrium tamarenseの発生要因とそれに相関する環境生物因子の抽出について、複数の統計パラメータを用いて生物多様性解析を行ったところ、Shannon's index, Simpton's index, corresponding analysis、Phylogenetic aggregated structureなど、幾つか有効なパラメータを見出すことに成功した。これらのデータを用いて論文を作成し、国際誌の”Applied Environmental Microbiology”に投稿していたレビュー結果が返却された。レビュワーに指摘された主要な修正点については、水温、塩分、栄養塩濃度等の環境データを加えて、A. tamarenseの出現動向について議論することであった。このため、共同研究者である大阪府立環境農林水産総合研究所水産技術センターから環境モニタリングデータをいただき、統計解析ソフト「R」を用いて、メタゲノム解析から得られた群集構造のプロットに、群集構造の変動に有意な相関を示した環境要因を重ねてプロットする解析を試み、グラフを完成させた。論文の内容も修正を完了した。

从2012年到2015年，使用下一代序列的元基因组分析在大阪湾的两个位置进行了时间序列监测。使用多个统计参数进行了生物多样性分析，以提取鞭毛鞭毛酸酯tamarense的原因，一种引起贝类毒药的鞭毛藻，以及与之相关的环境生物学因素，我们成功地找到了几个有效的参数，例如Shannon的Index，Index，Index的Index，Index的Index，对应的分析，相应地分析，促进了促进。使用这些数据，撰写了论文，并返回了提交给国际杂志“应用环境微生物学”的评论结果。审稿人指出的主要修订是与水温，盐度和营养浓度等环境数据讨论a曲霉的出现。因此，我们从合作者，大阪县渔业技术中心，渔业技术中心收到了环境监控数据，并尝试使用统计分析软件“ R”来分析从元基因组分析获得的社区结构的情节，并绘制了环境因素，这些环境因素与社区结构中的变化，并叠加了图形，并完成了图表的差异。该论文的内容也已进行了修订。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

An attempt to semi-quantify potentially toxic diatoms of the genus Pseudo-nitzschia in Tokyo Bay, Japan by using massively parallel sequencing technology

尝试利用大规模并行测序技术对日本东京湾的拟菱形藻属潜在有毒硅藻进行半定量

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
Plankton Benthos Research
影响因子：
0
作者：
Nagai S;Urushizaki S;Hongo Y;Chen H;Dzhembekova N
通讯作者：
Dzhembekova N

Phylogenetically clumped species composition of marine green algae (Chlorophyta) in the temperate zone

温带海洋绿藻（绿藻）的系统发育集群物种组成

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
Chen;H.;Nagai;S.;and Kishino;H.;Hungyen Chen and Satoshi Nagai;Hungyen Chen and Satoshi Nagai;Hungyen Chen and Satoshi Nagai;Hungyen Chen and Satoshi Nagai;Hungyen Chen and Satoshi Nagai
通讯作者：
Hungyen Chen and Satoshi Nagai

Phylogenetically clumped species composition of marine green algae (Chlorophyta) in the temperate zone.

温带海洋绿藻（绿藻）的系统发育集群物种组成。

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
Journal of Marine Science and Technology
影响因子：
2.6
作者：
Nagai S;Urushizaki S;Hongo Y;Chen H;Dzhembekova N;Hungyen Chen and Satoshi Nagai
通讯作者：
Hungyen Chen and Satoshi Nagai

The method to detect the phylogenetic aggregation of the patterns of species temporal variation in an assemblage

检测组合中物种时间变异模式的系统发育聚集的方法

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
The Proceedings of the 2017 International Forum-Agriculture, Biology, and Life Science 2017
影响因子：
0
作者：
Hungyen Chen;Satoshi Nagai;Kwang-Tsao Shao;Hirohisa Kishino
通讯作者：
Hirohisa Kishino

Assessment of the network of protected areas for birds in Taiwan with regard to functional and phylogenetic diversity

台湾鸟类保护区网络的功能和系统发育多样性评估