Ｂａｍ複合体による外膜タンパク質形成の構造基盤の解明

阐明 Bam 复合物形成外膜蛋白的结构基础

基本信息

批准号：
14J09020
负责人：
草木迫司
金额：
$ 1.6万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2014
资助国家：
日本
起止时间：
2014-04-25 至 2017-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では，特に真正細菌の細胞において，外膜タンパク質がどのように外膜に組み込まれるのか，その形成メカニズムの構造基盤を解明することを目的として，外膜タンパク質の膜組み込み装置であるBam複合体に着目して構造研究を推進してきた．これまでにBam複合体の中核因子である膜タンパク質BamAの結晶化に成功していたが，最終的にBamAならびにBam複合体の構造決定には至らなかった．2016年には，海外の他研究室からBam複合体の構造が相次いで報告された．これらの報告から外膜タンパク質形成メカニズムの構造基盤の一端が示された．しかしながら，Bam複合体と基質タンパク質とがどのように相互作用して，またBam複合体がどのような構造変化を伴って基質タンパク質を外膜に組み込むのかということに関しては，未だ不明な点が多く残されている．今後はBam複合体と基質タンパク質との複合体の構造解析や膜組み込み過程におけるダイナミクス研究の進展が予想される．また前年度に引き続いて，Vibrio choleraeに由来する多剤排出輸送体MATEトランスポーターの構造・ダイナミクス研究も進め，本年度はその成果の一部を国際誌に発表した．決定した異なる2つのコンフォメーションの結晶構造と，得られた構造情報に基づく電子スピン共鳴解析の結果から，原核生物に由来するMATEトランスポーターに共通した基質排出メカニズムが示唆された．

在这项研究中，我们一直在促进着重点介绍的结构研究，该研究重点是BAM复合物，BAM复合物是一种用于外膜蛋白的膜整合装置，目的是阐明其形成机制的结构基础，尤其是在Eubacteria细胞中。到目前为止，BAM复合物的核心因素的膜蛋白巴马已经成功结晶，但最终尚未确定巴马和BAM复合物的结构。 2016年，其他海外实验室报告了BAM综合体的结构。这些报告表明，外膜形成机理的结构基础之一。但是，关于BAM复合物如何与底物蛋白相互作用以及BAM复合物的结构变化涉及将底物蛋白掺入外膜中的结构变化仍然存在许多未知。可以预期，在膜整合过程中，对BAM复合物和底物蛋白的复合物和底物蛋白的复合物以及动力学研究的结构分析进一步进步。从上一年开始，我们还研究了Mate Transporter的结构和动力学，这是一种源自Vibrio Cholerae的多药物废水转运蛋白，今年我们在国际杂志中发表了一些结果。根据获得的结构信息确定了两个不同构象的晶体结构和电子自旋共振分析的结果，这表明源自原核生物的伴侣转运蛋白的常见底物撤离机制。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Vibrio cholerae由来多剤排出トランスポーターMATEのX線結晶構造解析

霍乱弧菌多药外排转运蛋白 MATE 的 X 射线晶体结构分析

DOI：
发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
0
作者：
草木迫司;田中良樹;Andres D. Maturana;Christopher J. Hipolito;黒田照夫;石谷隆一郎;菅裕明;濡木理
通讯作者：
濡木理

X-ray crystallographic analysis of a MATE multidrug transporter from V. cholerae

霍乱弧菌 MATE 多药转运蛋白的 X 射线晶体学分析

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kusakizako;T.;Tanaka;Y.;Maturana;A.D.;Hipolito;C.J.;Kuroda;T.;Ishitani;R.;Suga;H.;Nureki;O.
通讯作者：
O.

LCP crystallization and X-ray diffraction analysis of VcmN, a MATE transporter from Vibrio cholerae.

DOI：
10.1107/s2053230x16008931
发表时间：
2016-07
期刊：
Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
影响因子：
0
作者：
Kusakizako T;Tanaka Y;Hipolito CJ;Kuroda T;Ishitani R;Suga H;Nureki O
通讯作者：
Nureki O

Vanderbilt University(米国)

范德比尔特大学（美国）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Structural analysis of a MATE transporter from Vibrio cholerae

霍乱弧菌 MATE 转运蛋白的结构分析

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kusakizako;T.;Tanaka;Y.;Maturana A. D.;Hipolito;C. J.;Kuroda;T.;Ishitani;R.;Suga;H.;Nureki;O.
通讯作者：
O.

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通讯作者：
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通讯作者：
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Motozono Chihiro;Toyoda Mako;Zahradnik Jiri;Saito Akatsuki;Other 19 authors;Ikeda Terumasa;Nakagawa So;Ueno Takamasa;Sato Kei;草木迫司;Shintani Seine A.;Sae Tanaka
通讯作者：
Sae Tanaka